bnem公司
从微扰实验的间接测量中训练逻辑模型
生物导体版本:释放(3.19)
bnem将嵌套效应模型(package mnem)的间接测量与CellNOptR的布尔网络相结合。分析细胞中信号节点的扰动实验对整体基因表达谱的影响。这些简档为网络中下游节点的布尔调节提供了证据,例如,两个父母是独立激活他们的孩子(OR门)还是联合激活他们的孩子(AND门)。
作者:马丁·皮尔克
维护人员:马丁·皮尔克(Martin Pirkl)
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“bnem”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
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浏览幻影(“bnem”)
细节
生物视图 |
基因表达式,基因调控,网络,网络推理,路径,预处理,软件,系统生物学 |
版本 |
1.12.0 |
在生物导体中 |
生物C 3.13(R-4.1)(3.5年) |
许可证 |
GPL-3公司 |
取决于 |
R(>=4.1) |
进口 |
蜂窝NOptR,矩阵统计,降雪,Rgraphviz公司,集群,弗莱克斯集群,统计,R彩色啤酒,epiNEM公司,记忆,博科生物、方法、实用程序、图形、,图表,阿菲,二进制,利马,特别行政区,vsn(vsn),rmarkdown公司 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/MartinFXP/bnem网址/ |
错误报告 |
https://github.com/MartinFXP/bnem/issues网站 |
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程序包档案
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