生物数据库Hmdb

biodbHmdb,用于连接HMDB数据库的库


生物导体版本:释放(3.19)

biodbHmdb库是biodb框架包的扩展,提供对HMDB代谢产物数据库的访问。它允许在本地下载整个HMDB代谢产物数据库,访问条目并按名称或描述搜索条目。该软件包的未来版本还将包括通过质量和质谱注释进行搜索。

作者:皮尔里克·罗杰

维护人员:Pierrick Roger<Pierrick.Roger at cea.fr>

引文(从R中输入引文(“biodbHmdb”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“biodbHmdb”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“biodbHmdb”)
biodbHmdb包简介。 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 数据导入,基础设施,软件
版本 1.10.1
在生物导体中 生物柴油3.14(R-4.1)(3年)
许可证 AGPL-3型
取决于 R(>=4.1)
进口 R6级,生物数据库(>= 1.3.2),卢比,拉链
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/pkrog/biodbHmdb
错误报告 https://github.com/pkrog/biodbHmdb/issues网站
查看更多
建议 仿生风格,氧气2,开发工具,测试那个(>= 2.0.0),针织物,rmarkdown公司,覆盖(covr),长距离无线电
链接到 卢比,测试那个
增强功能
取决于我
导入我
建议我
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 生物数据库Hmdb_1.10.1.tar.gz
Windows二进制 biodbHmdb_1.10.1.zip
macOS二进制(x86_64) 生物Hmdb_1.10.1.tgz
macOS二进制(arm64) 生物Hmdb_1.10.1.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biodbHmdb
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/biodbHmdb
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/biodbHmdb/
包短Url https://bioductor.org/packages/biodbHmdb网址/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包 源存档