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大甜瓜

用于大型实验的照明素甲基化阵列分析


生物导体版本:释放(3.19)

使用gdsfmt处理Illumina阵列的方法。

作者:Tyler J.Gorrie-Stone[aut]、Ayden Saffari[aut]、Karim Malki[aut'、Leonard C.Schalkwyk[cre,aut]

维护人员:Leonard C.Schalkwyk<埃塞克斯ac.uk的lschal>

引文(从R中输入引文(“大甜瓜”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“大甜瓜”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“大甜瓜”)
大甜瓜套餐 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 CpGIsland公司,DNA甲基化,数据导入,甲基化阵列,微阵列,预处理,质量控制,软件,双通道
版本 1.30.0
在生物导体中 生物柴油3.4(R-3.3)(7.5年)
许可证 GPL-3型
取决于 R(>=3.3),瓦特瓜(>= 1.25.0),gdsfmt公司(>=1.0.4),方法,最小保真(>= 1.21.0),博科生物,甲基脲
进口 统计数据,实用程序,地理查询、图形、,生物遗传学,照明
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 生物遗传学,RUnit(运行单位),生物风格,minfiData公司,平行,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19公司,Illumina人甲基化EPICanno.ilm10b2.hg19,颠簸猎人
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 大梅隆_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 大瓜_1.30.0.zip
macOS二进制(x86_64) 大瓜_1.30.0.tgz
macOS二进制(arm64) 大瓜_1.30.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bigg瓜
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/大瓜
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/big瓜/
包短Url https://bioconductor.org/packages/bigg瓜/
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