啤酒

R中的贝叶斯充实估计


生物导体版本:释放(3.19)

BEER实现了用于分析噬菌体免疫沉淀测序(PhIP-seq)数据的贝叶斯模型。给定PhIPData对象,BEER返回富集抗体反应的后验概率、与阴性对照样本相比相对折叠变化的点估计值等。此外,BEER为使用edgeR识别富集抗体反应提供了方便的实现。

作者:陈雅典娜[aut,cre],Rob Scharpf[aut],Ingo Ruczinski[aut]

维护人员:陈雅典娜(Athena Chen)<jhu.edu的achen70

引文(从R中输入引文(“啤酒”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“啤酒”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“啤酒”)
啤酒 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 贝叶斯主义者,新闻报道,排序,软件,统计方法
版本 1.8.0
在生物导体中 生物柴油3.15(R-4.2)(2.5年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.2.0),PhIP数据(>= 1.1.1),rjags公司
进口 克莱,边缘R,BiocParallel公司、方法、,进步者,统计,总结性实验,实用程序
系统要求 卡爪(4.3.0)
统一资源定位地址 https://github.com/athchen/beer/
错误报告 https://github.com/athchen/beer/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 啤酒_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 啤酒_1.8.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 啤酒_1.8.0.tgz
macOS二进制(arm64) 啤酒_1.8.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/啤酒
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/啤酒
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/beer/
包短Url https://bioconductor.org/packages/啤酒/
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