海湾序列

计数数据差异表达模式的经验贝叶斯分析


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包识别高通量“计数”数据中的差异表达,例如来自下一代测序机的数据,通过经验贝叶斯方法计算差异表达的估计后验概率(或更复杂的假设)。

作者:Thomas J.Hardcastle[aut],Samuel Granjeaud[cre]

维护人员:塞缪尔·格拉杰奥(Samuel Granjeaud)<Samuel.Granjeaud at inserm.fr>

引文(从R中输入引文(“baySeq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“baySeq”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“baySeq”)
高级baySeq分析 PDF格式 R脚本
bay序列 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 贝叶斯主义者,新闻报道,差异表达式,多重比较,SAGE公司,排序,软件
版本 2.38.0
在生物导体中 生物碳2.5(R-2.10)(15年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=2.3.0),方法
进口 边缘R,基因组范围,阿宾德,并行,图形,统计,实用程序
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/samgg/baySeq网站
错误报告 https://github.com/samgg/baySeq/issues网站
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取决于我 clusterSeq(群集序列),段序列
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 baySeq_2.38.0.tar.gz
Windows二进制 baySeq_2.38.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) 托架Seq_2.38.0.tgz
macOS二进制(arm64) 托架Seq_2.38.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/baySeq
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/baySeq
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/baySeq网址/
包短Url https://bioconductor.org/packages/baySeq网站/
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