变型实验
具有GDS后端的VCF/GDS数据的范围摘要实验容器
生物导体版本：释放（3.19）
VariantExperiment是一个Bioconductor包，用于将VCF/GDS格式的数据保存到RangedSummarizedExperiment对象中。高通量遗传/基因组数据保存在GDSArray对象中。要素/示例的注释数据以DelayedDataFrame格式保存，每列中包含一维GDSArray。分析数据和注释数据的按需表示实现了按需读取和处理，并显著节省了内存空间。RangedSummarizedExperiment数据格式的界面支持使用R和Bioconductor中常见的SummarigedExperience隐喻对高通量遗传/基因组数据进行简单而通用的操作。
作者：刘谦[aut，cre]，埃尔维·帕格斯[aut]，马丁·摩根[aut]
维护人员：钱刘<钱。刘在roswellpark.org>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“变体实验”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
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细节
| 生物视图 |
注释,数据表示,基因组注释,基因型阵列,基础设施,排序,软件 |
| 版本 |
1.18.1 |
| 在生物导体中 |
生物C 3.10（R-3.6）（5年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=3.6.0），S4载体(>= 0.21.24),总结性实验(>= 1.13.0),基因组范围 |
| 进口 |
GDS阵列(>= 1.11.1),延迟数据帧（>=1.6.0）、工具、实用工具、统计数据、方法、，gdsfmt公司,SNP关联,SeqArray（序列阵列）,DelayedArray（延迟阵列）,生物串,I范围 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/Bioconductor/变体实验 |
| Bug报告 |
https://github.com/Bioconductor/VariantExperiment/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
