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毒物Gx

大规模毒理基因组数据分析


生物导体版本:释放(3.19)

包含一组功能,用于对毒物基因组数据进行大规模分析,提供标准化的数据结构,以保存与毒物基因组的注释、可视化和统计分析相关的信息。

作者:Sisira Nair[aut]、Esther Yoo[aut]、Christopher Eeles[aut)、Amy Tang[aut】、Nehme El-Hachem[aut’、Petr Smirnov[aut〕、Jermiah Joseph[aut'、Benjamin Haibe-Kains[aut,cre]

维护人员:本杰明·海贝-凯恩斯(Benjamin Haibe.Kains)

引文(从R中输入引文(“毒物Gx”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“ToxicoGx”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“毒物Gx”)
ToxicoGx:用于综合毒理学数据分析的R平台 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 基因表达式,药物遗传学,药物基因组学,软件
版本 2.8.0
在生物导体中 生物柴油3.12(R-4.0)(3.5年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.1),核心Gx
进口 总结性实验,生物遗传学,S4载体,博科生物,生物并行,ggplot2,易怒的,数字播放器,caTools(计算机辅助工具),下载器,马格里特、方法、,重塑2,第三年,数据表,断言,规模,图形,grDevices,parallel,stats,utils,利马,jsonlite公司
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 有毒Gx_2.8.0.tar.gz
Windows二进制 有毒Gx_2.8.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 毒物Gx_2.8.0.tgz
macOS二进制(arm64) 毒物Gx_2.8.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ToxicoGx网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/ToxicoGx
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ToxicoGx网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/ToxicoGx网站/
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