TCC（变矩器离合器）

TCC：基于稳健规范化策略的标签计数数据差异表达分析

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包提供了一系列功能，用于使用稳健的归一化策略（称为DEGES）从RNA-seq计数数据执行差异表达分析。DEGES的基本思想是，在数据归一化之前，应删除比较样本中潜在的差异表达基因或转录物（DEG），以获得排名良好的基因列表，其中真正的DEG排名靠前，非DEG排名垫底。这可以通过执行多步骤规范化策略（称为DEGES，用于DEG消除策略）来实现。TCC的一个主要特点是通过在依赖包中使用函数组合，为多种计数数据（有或无重复的两组、多组/多因素等）提供稳健的归一化方法。

作者：孙建强、西山智树、清水健太郎和加多田晃司

维护人员：孙建强（Jianqiang Sun）<Sun at biunit.dev>，Tomoaki Nishiyama<tomoakin at staff.kanazawa-u.ac.jp>

引文（从R中输入引文（“TCC”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“TCC”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“TCC”）

TCC（变矩器离合器）	PDF格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	差异表达式,免疫肿瘤学,RNA序列,排序,软件
版本	1.44.0
在生物导体中	生物技术2.13（R-3.0）（11年）
许可证	GPL-2型
取决于	R（>=3.0），方法，设计2,边缘R,世界车王争霸赛
进口
系统要求
统一资源定位地址

建议	RU单位,生物遗传学
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我	编码器
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	TCC_1.44.0.tar.gz
Windows二进制	TCC_1.44.0.zip文件
macOS二进制（x86_64）	TCC_1.44.0.tgz
macOS二进制（arm64）	TCC_1.44.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TCC
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/TCC
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/TCC/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/TCC/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.19的旧源代码包	源存档