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诉讼人

通过交叉验证选择突变签名数


生物导体版本:释放(3.19)

一种无监督交叉验证方法,用于选择最佳数量的突变签名。突变计数的数据集分为训练和验证数据。在训练数据中估计特征,然后用于预测验证数据中的突变。

作者:DongHyuk Lee[aut]、Bin Zhu[aut]、Bill Wheeler[cre]

维护人员:比尔·惠勒(Bill Wheeler)

引文(从R中输入引文(“诉讼人”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“SUITOR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“诉讼人”)
诉讼人:选择突变签名的数量 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 遗传学,软件,体细胞突变
版本 1.6.0
在生物导体中 生物柴油3.16(R-4.2)(1.5年)
许可证 GPL-2型
取决于 R(>=4.2.0)
进口 统计、实用程序、图形、,ggplot2,生物并行
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/wheelerb/SUITOR/issues网站
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建议 开发工具,突变模式,RUnit(运行单位),生物技术经理,生物遗传学,仿生风格,针织物,rmarkdown公司
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 套房_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 西装_1.6.0.zip
macOS二进制(x86_64) 套房_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64) 套房_1.6.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SUITOR网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/套房
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/SUITOR网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/SUITOR网站/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源代码包 源存档