远程控制模块

用负二项分布拟合微生物组的行列关联模型


生物导体版本:释放(3.19)

结合列联表的对数线性分析、灵活响应函数估计和经验Bayes离散度估计的思想,探索性地可视化微生物数据集。该软件包包括无约束分析和约束分析。此外,还可以使用诊断图来检测配合不足。

作者:斯蒂恩·哈温克尔[cre,aut]

维护人员:Stijn Hawinkel在psb.ugent.be>

引文(从R中输入引文(“RCM”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“RCM”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“RCM”)
RCM包装手册 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 尺寸缩减,基因组,微生物组,软件,可视化
版本 1.20.0
在生物导体中 生物技术3.9(R-3.6)(5.5年)
许可证 GPL-2型
取决于 R(>=4.0),数据库接口
进口 R彩色啤酒,阿拉巴马州,边缘R,重塑2,采礼,统计,VGAM公司,ggplot2(>= 2.2.1.9000),nleqslv公司,品学兼优,张量,MASS(质量),gr设备、图形、方法
系统要求
统一资源定位地址 https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/RCM/inst/doc/RCMvignette.html/
错误报告 https://github.com/CenterForStatistics-UGent/RCM/问题
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 RCM_1.20.0.tar.gz号
Windows二进制 RCM_1.20.0.zip文件(仅64位)
macOS二进制(x86_64) RCM_1.20.0.tgz号
macOS二进制(arm64) RCM_1.20.0.tgz号
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RCM
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/RCM
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/RCM网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/RCM/
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