远程控制模块
用负二项分布拟合微生物组的行列关联模型
生物导体版本:释放(3.19)
结合列联表的对数线性分析、灵活响应函数估计和经验Bayes离散度估计的思想,探索性地可视化微生物数据集。该软件包包括无约束分析和约束分析。此外,还可以使用诊断图来检测配合不足。
作者:斯蒂恩·哈温克尔[cre,aut]
维护人员:Stijn Hawinkel在psb.ugent.be>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“RCM”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“RCM”)
细节
生物视图 |
尺寸缩减,基因组,微生物组,软件,可视化 |
版本 |
1.20.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.9(R-3.6)(5.5年) |
许可证 |
GPL-2型 |
取决于 |
R(>=4.0),数据库接口 |
进口 |
R彩色啤酒,阿拉巴马州,边缘R,重塑2,采礼,统计,VGAM公司,ggplot2(>= 2.2.1.9000),nleqslv公司,品学兼优,张量,MASS(质量),gr设备、图形、方法 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/RCM/inst/doc/RCMvignette.html/ |
错误报告 |
https://github.com/CenterForStatistics-UGent/RCM/问题 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。