R453Plus 1工具箱

用于从罗氏基因组测序器系统导入和分析数据的软件包


生物导体版本:释放(3.19)

R453Plus1工具箱包含用于分析罗氏454测序平台生成的数据的有用功能。它增加了质量保证功能以及检测到的变体的注释和可视化功能,补充了罗氏公司随产品提供的软件工具。此外,还提供了用于检测结构变体的管道。

作者:Hans-Ulrich Klein、Christoph Bartenhagen、Christian Ruckert

维护人员:汉斯·克莱恩(Hans-Ulrich Klein)

引文(从R中输入引文(“R453Plus工具箱”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“R453Plus1工具箱”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“R453Plus1工具箱”)
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参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 数据导入,数据表示,基础设施,质量控制,报告写作,排序,软件,可视化
版本 1.54.0
在生物导体中 生物碳2.7(R-2.12)(14年)
许可证 LGPL-3型
取决于 R(>=2.12.0),方法,变量注释(>= 1.25.11),生物串(>= 2.47.6),pwalling(pwallign),博科生物
进口 utils、grDevices、图形、统计、工具,可发送的,R2HTML,教学演示,生物遗传学,S4载体(>= 0.17.25),I范围(>= 2.13.12),十六矢量,基因组范围(>= 1.31.8),总结性实验,生物反应器,牛基因组(>= 1.47.3),Rsamtools软件,短读(>= 1.37.1)
系统要求
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 R453Plus工具箱_1.54.0.tar.gz
Windows二进制 R453Plus1工具箱_1.54.0.zip
macOS二进制(x86_64) R453Plus1工具箱_1.54.0.tgz
macOS二进制(arm64) R453Plus1工具箱_1.54.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/R453Plus工具箱
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/R453Plus 1工具箱
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/R453Plus工具箱/
包短Url https://bioconductor.org/packages/R453Plus工具箱/
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