R3CPET公司

3CPET:使用分级Dirichlet过程在Chia-PET实验中发现辅因子络合物


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包提供了一种方法,根据ChIA-PET实验结果推断出更可能协同工作以维持脉络膜蛋白相互作用的蛋白质组。

作者:Djekidel MN,Yang Chen等人。

维护人员:穆罕默德·纳迪尔·杰基德尔(Mohamed Nadhir Djekidel)<djek.nad at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“R3CPET”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“R3CPET”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“R3CPET”)
3CPET:寻找维持Chia-PET相互作用的辅因子复合物 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 贝叶斯主义者,基因表达式,基因预测,图形和网络,HiC公司,网络,网络推理,软件
版本 1.36.0
在生物导体中 生物C 3.1(R-3.2)(9.5年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 R(>=3.2),卢比(>=0.10.4),方法
进口 方法,并行,ggplot2,情势图,cl有效,记录仪,数据表,重塑2,Hmisc公司,RCurl(RCurl),生物遗传学,S4载体,I范围(>= 2.13.12),基因组信息Db,基因组范围(>= 1.31.8),ggbio公司
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/sirusb/R3CPET/issues网站
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建议 仿生风格,针织物,TxDb(发送日期)。哈皮恩斯。UCSC.hg19.known基因,biovizBase公司,生物电阻,注释Dbi,组织Hs.eg.db,闪亮的,ChIPpeakAnno公司
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 R3CPET_1.36.0.tar.gz公司
Windows二进制 R3CPET_1.36.0.zip文件
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/R3CPET
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/R3CPET
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/R3CPET网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/R3CPET/
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