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从协同解决中预测交互作用
生物导体版本:释放(3.19)
PrInCE(从共洗脱预测相互作用组)使用基于数据集衍生特征训练的朴素贝叶斯分类器,从共洗提色谱图中恢复蛋白质相互作用。此包包含PrInCE的R实现。
作者:Michael Skinnider[aut,trl,cre],R.Greg Stacey[ctb],Nichollas Scott[ctb],Anders Kristensen[ctb]Leonard Foster[aut
维护人员:迈克尔·斯金奈德(Michael Skinnider)<米歇尔·斯金尼德(Michael.Skinnider,msl.ubc.ca>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“PrInCE”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“PrInCE”)
细节
生物视图 |
网络推理,蛋白质组学,软件,系统生物学 |
版本 |
1.20.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.9(R-3.6)(5.5年) |
许可证 |
GPL-3+文件许可证 |
取决于 |
R(>=3.6.0) |
进口 |
呜呜声(>= 0.2.4),数字播放器(>= 0.7.4),第三年(>= 0.8.99),预测(>= 8.2),进步(>= 1.1.2),Hmisc公司(>= 4.0),贝叶斯方法(>= 0.9.1),鲁棒基地(>= 0.92-7),护林员(>= 0.8.0),利伯里纳(>= 2.10-8),速度glm(>= 0.3-2),测试器(>= 0.1.7),马格里特(>= 1.5),博科生物(>= 2.40.0),M数据库(>=2.8.3)、stats、utils、methods、,Rdpack公司(>= 0.7) |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
|
错误报告 |
https://github.com/fosterlab/PrInCE/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。