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理学硕士实验

质谱实验基础设施


生物导体版本:释放(3.19)

存储和管理与完整蛋白质组学或代谢组学质谱(MS)实验相关的所有方面的基础设施。MsExperiment软件包为建立在Spectra、QFeatures和相关软件包提供的新MS基础设施上的MS实验提供了轻质灵活的容器。除了原始数据表示、原始数据文件的链接和示例注释外,还可以在MsExperimenta容器中存储其他元数据或注释。为了保证最大的灵活性,只对容器中数据的类型和内容施加最小的约束。

作者:劳伦特·加托[aut,cre],约翰内斯·雷纳,塞巴斯蒂安·吉布

维护人员:劳伦特·加托在uclouvane.be>

引文(从R中输入引文(“MsExperiment”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MsExperiment”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“MsExperiment”)
管理质谱实验 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 数据导入,实验设计,基础设施,质谱学,代谢组学,蛋白质组学,软件
版本 1.6.0
在生物导体中 生物柴油3.16(R-4.2)(1.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.2),ProtGenerics公司(>= 1.35.2)
进口 方法,S4载体,I范围,光谱,总结性实验,Q功能,数据库接口,生物遗传学
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/RforMassSpectrometry/MsExperimental网站
错误报告 https://github.com/RforMassSpectrometry/MsExperiment/issues网站
查看更多
建议 测试那个,针织物(>= 1.1.0),氧气2,生物风格(>= 2.5.19),rmarkdown公司,rpx公司,毫兹罗,msdata(msdata),MsBackendSql(>= 1.3.2),RSQ网站
链接到
增强功能
取决于我
导入我 MsQuality(消息质量),xcms公司
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 Ms实验_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 MsExperiment_1.6.0.zip
macOS二进制(x86_64) MsExperiment_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64) MsExperiment_1.6.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Ms实验
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/MsExperiment
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MsExperimental网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/Ms实验/
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