理学硕士实验
质谱实验基础设施
生物导体版本:释放(3.19)
存储和管理与完整蛋白质组学或代谢组学质谱(MS)实验相关的所有方面的基础设施。MsExperiment软件包为建立在Spectra、QFeatures和相关软件包提供的新MS基础设施上的MS实验提供了轻质灵活的容器。除了原始数据表示、原始数据文件的链接和示例注释外,还可以在MsExperimenta容器中存储其他元数据或注释。为了保证最大的灵活性,只对容器中数据的类型和内容施加最小的约束。
作者:劳伦特·加托[aut,cre],约翰内斯·雷纳,塞巴斯蒂安·吉布
维护人员:劳伦特·加托在uclouvane.be>
引文(从R中输入引文(“MsExperiment”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MsExperiment”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“MsExperiment”)
细节
生物视图 |
数据导入,实验设计,基础设施,质谱学,代谢组学,蛋白质组学,软件 |
版本 |
1.6.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.16(R-4.2)(1.5年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=4.2),ProtGenerics公司(>= 1.35.2) |
进口 |
方法,S4载体,I范围,光谱,总结性实验,Q功能,数据库接口,生物遗传学 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
https://github.com/RforMassSpectrometry/MsExperimental网站 |
错误报告 |
https://github.com/RforMassSpectrometry/MsExperiment/issues网站 |
查看更多
建议 |
测试那个,针织物(>= 1.1.0),氧气2,生物风格(>= 2.5.19),rmarkdown公司,rpx公司,毫兹罗,msdata(msdata),MsBackendSql(>= 1.3.2),RSQ网站 |
链接到 |
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增强功能 |
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取决于我 |
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导入我 |
MsQuality(消息质量),xcms公司 |
建议我 |
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指向我的链接 |
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生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。