注册打开对于生物20247月24-26日

MsCoreUtils(MsCore实用程序)

质谱数据的核心用途


生物导体版本:释放(3.19)

MsCoreUtils为质谱数据定义低级函数,并独立于任何高级数据结构。这些功能包括质谱处理功能(噪声估计、平滑、binning、基线估计)、定量聚合功能(中值磨光、稳健总结…)、缺失数据插补、数据归一化(分位数、vsn…)、其他辅助功能、,用于质谱包R中的高级数据结构。

作者:RforMasssometry软件包维护人员[cre],Laurent Gatto[aut],约翰内斯·雷纳,塞巴斯蒂安·吉布,菲律宾路易[aut]、阿德里安·斯特克(Adrian Sticker)、西格杜尔·斯马拉森(Sigurdur Smarason)、托马斯·纳克(Thomas Naake)、约塞普·玛丽亚·巴迪亚·阿帕里西奥(Josep Maria Badia Aparicio),迈克尔·威廷、塞缪尔·维克佐雷克(Samuel Wieczorek)[ctb]、罗杰·吉尼·贝托缪(Roger Gine Bertomeu)[ctb)],Mar Garcia-Aloy[ctb]

维护人员:RforMassSpectrometry软件包维护者<RforMassSpectrometry.org上的维护者>

引文(从R中输入引文(“MsCoreUtils”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MsCoreUtils”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“MsCoreUtils”)
质谱数据的核心用途 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基础设施,质谱学,代谢组学,蛋白质组学,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 生物柴油3.11(R-4.0)(4年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.6.0)
进口 方法,S4载体,MASS(质量),统计,线索
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/RforMassSpectrometry/MsCoreUtils网站
错误报告 https://github.com/RforMassSpectrometry/MsCoreUtils/issues网站
查看更多
建议 测试那个,针织物,仿生风格,rmarkdown公司,氧气2,插补LCMD,插补,规范,pca方法,vsn(vsn),矩阵,预处理核心,miss森林
链接到 卢比
增强功能 HDF5阵列
取决于我
导入我 复合Db,M数据库,MetCirc公司,元注释,MetaboCoreUtils(元核心实用程序),MsBackendMassbank,消息后端管理,Ms后端Msp,MsBackendRawFileReader,MsBackendSql,Ms功能,PS匹配,Q功能,光谱,质量管理工具,供应链计划,xcms公司
建议我 MetNet公司,msqrob2
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 MsCoreUtils_1.16.0.tar.gz女士
Windows二进制 MsCoreUtils_1.16.0.zip
macOS二进制(x86_64) MsCoreUtils_1.16.0.tgz女士
macOS二进制(arm64) MsCoreUtils_1.16.0.tgz女士
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsCoreUtils网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/MsCoreUtils
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MsCoreUtils网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/MsCoreUtils网站/
软件包下载报告 下载统计信息