MsBackendSql

基于SQL的质谱数据后端


生物导体版本:释放(3.19)

基于SQL的质谱(MS)数据后端还支持存储和处理超大数据集。此包中的物体应与Spectra Bioconductor包一起使用。通过内存占用最小的MsBackendSql,此包为超大或远程MS数据集提供了另一种MS数据表示。

作者:约翰内斯·雷纳[aut,cre],Chong Tang[ctb],Laurent Gatto[ctb]

维护人员:约翰内斯·雷纳(Johannes Rainer)。欧洲大学的Rainer

引文(从R中输入引文(“MsBackendSql”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MsBackendSql”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“MsBackendSql”)
在SQL数据库中存储质谱数据 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 数据导入,基础设施,质谱学,代谢组学,蛋白质组学,软件
版本 1.4.0
在生物导体中 生物柴油3.17(R-4.3)(1.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.2.0),光谱(>= 1.9.12)
进口 生物并行,S4载体、方法、,ProtGenerics公司(>= 1.35.3),数据库接口,MsCoreUtils(MsCore实用程序),I范围,数据表,进步,生物遗传学
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendSql
错误报告 https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendSql/问题
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 邮件备份Sql_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 MsBackendSql_1.4.0.zip
macOS二进制(x86_64) MsBackendSql_1.4.0.tgz
macOS二进制(arm64) MsBackendSql_1.4.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendSql
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/MsBackendSql
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MsBackendSql/
包短Url https://bioconductor.org/packages/MsBackendSql/
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