MsBackendSql
基于SQL的质谱数据后端
生物导体版本:释放(3.19)
基于SQL的质谱(MS)数据后端还支持存储和处理超大数据集。此包中的物体应与Spectra Bioconductor包一起使用。通过内存占用最小的MsBackendSql,此包为超大或远程MS数据集提供了另一种MS数据表示。
作者:约翰内斯·雷纳[aut,cre],Chong Tang[ctb],Laurent Gatto[ctb]
维护人员:约翰内斯·雷纳(Johannes Rainer)。欧洲大学的Rainer
引文(从R中输入引文(“MsBackendSql”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“MsBackendSql”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“MsBackendSql”)
细节
生物视图 |
数据导入,基础设施,质谱学,代谢组学,蛋白质组学,软件 |
版本 |
1.4.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.17(R-4.3)(1.5年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=4.2.0),光谱(>= 1.9.12) |
进口 |
生物并行,S4载体、方法、,ProtGenerics公司(>= 1.35.3),数据库接口,MsCoreUtils(MsCore实用程序),I范围,数据表,进步,生物遗传学 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendSql |
错误报告 |
https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendSql/问题 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。