MotifDb公司

蛋白质-DNA结合序列基序注释集

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“MotifDb”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“MotifDb”）

PWM集合	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本
许可证	文本

细节

生物视图	Motif注释,软件
版本	1.46.0
在生物导体中	生物技术2.11（R-2.15）（12年）
许可证	Artistic-2.0 |文件许可证
取决于	R（>=3.5.0），方法，生物遗传学,S4载体,I范围,基因组范围,生物串
进口	rtracklayer公司,分裂的
系统要求
统一资源定位地址

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建议	RUnit（运行单位）,seq徽标,仿生风格,针织物,rmarkdown公司,格式R,降价
链接到
增强功能
取决于我	motifbreakR图案,基因调控
导入我	rTRMui公司
建议我	ATACseqQC公司,DiffLogo公司,enhancer同源搜索,igvR型,模因,MMDiff2（最大差值2）,图案计数器,动机堆栈,motif测试R,剖面记分分布,PWMEnrich公司,rTRM公司,T实用程序,普世运动,vtpnet（vtpnet）
链接到我
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	主题Db_1.46.0.tar.gz
Windows二进制	MotifDb_1.46.0.zip
macOS二进制（x86_64）	主题Db_1.46.0.tgz
macOS二进制（arm64）	主题Db_1.46.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MotifDb
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/MotifDb
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MotifDb网址/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/MotifDb/
软件包下载报告	下载统计信息