甲基混合物
甲基混合物：识别甲基化驱动的癌症基因
生物导体版本：释放（3.19）
MethylMix是一种用于识别疾病的高甲基化和低甲基化基因的算法。MethylMix基于β混合物模型来识别甲基化状态，并将其与正常DNA甲基化状态进行比较。MethylMix使用了一种新的统计数据，即差异甲基化值或DM值，定义为甲基化状态与正常甲基化状态的差异。最后，匹配的基因表达数据被用于通过关注影响基因表达的甲基化变化来识别不同的功能甲基化状态。参考文献：Gevaert 0。甲基混合物：用于识别DNA甲基化驱动基因的R包。生物信息学（英国牛津）。2015;31(11):1839-41. doi:10.1093/bioinformatics/btv020。Gevaert O，Tibshirani R，Plevritis SK.使用甲基混合物对DNA甲基化驱动基因进行全癌分析。基因组生物学。2015;16(1):17. doi:10.1186/s13059-014-0579-8。
作者：奥利维尔·格瓦尔特
维护人员：Olivier Gevaert<Olivier.Gevaert at gmail.com>
安装
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如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“甲基混合物”）
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文档
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细节
| 生物视图 |
脱氧核糖核酸甲基化,差异表达式,差异甲基化,基因表达式,基因调控,甲基化阵列,网络,路径,软件,统计方法 |
| 版本 |
2.34.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.0（R-3.1）（9.5年） |
| 许可证 |
GPL-2型 |
| 取决于 |
R（>=3.2.0） |
| 进口 |
foreach公司,RPMM公司,R彩色啤酒,ggplot2,RCurl（RCurl）,插补,数据表,利马,R.matlab公司,消化 |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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程序包档案
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