HiLDA公司
利用层次潜在Dirichlet分配对突变签名的突变暴露进行比较的统计推断
生物导体版本:释放(3.19)
在应用分层潜在Dirichlet分配的Bayesian框架下构建的包。它从统计学上测试了两组之间突变特征(Shiraishi-model特征)的突变暴露是否不同。该包还提供推断和可视化。
作者:Zhi Yang[aut,cre]、Yuichi Shiraishi[ctb]
维护人员:Zhi Yang<gmail.com上的zyang895>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“HiLDA”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
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浏览幻影(“HiLDA”)
细节
生物视图 |
贝叶斯,排序,软件,体细胞突变,统计方法 |
版本 |
1.18.0 |
在生物导体中 |
生物C 3.10(R-3.6)(5年) |
许可证 |
GPL-3公司 |
取决于 |
R(>=4.1),ggplot2 |
进口 |
R2jags汽车,阿宾德,奶牛场,网格,对于猫,字符串,基因组范围,S4载体,十六矢量,生物串,基因组特征,英国基因组。Hsapiens。加州大学圣保罗分校hg19,生物遗传学,第三年,gr设备,统计,发送数据库。Hsapiens。UCSC.hg19.known基因,实用程序,方法,卢比 |
系统要求 |
挡块4.0.0 |
统一资源定位地址 |
https://github.com/USBiostats/HiLDA https://doi.org/10.1010/577452 |
Bug报告 |
https://github.com/USBiostats/HiLDA/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。