格利玛

基因表达分析的交互式可视化

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包利用limma、edgeR或DESeq2的输出，为RNA-seq数据分析生成交互式可视化。它生成了流行RNA-seq分析图的交互式htmlwidgets版本，通过叠加交互式特征来增强分析结果的探索。这些绘图可以在web浏览器中查看，也可以嵌入到笔记本文档中。

作者：Shian Su[aut，cre]，Hasaru Kariyawasam[aut]，Oliver Voogd[aut]，Matthew Ritchie[aut'，Charity Law[aut】，Stuart Lee[ctb]，Isaac Virshup[ctb]

维护人员：Shian Su<Su.s at wehi.edu.au>

引文（从R中输入引文（“Glimma”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“Glimma”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“Glimma”）

生物视图	差异表达式,基因表达式,微阵列,RNA序列,报告写作,排序,软件,可视化
版本	2.14.0
在生物导体中	生物多样性3.3（R-3.3）（8.5年）
许可证	GPL-3公司
取决于	R（>=4.0.0）
进口	html小部件,边缘R,设计2,利马,总结性实验，统计，硅钠铝石、方法、，S4载体
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/hasaru-k/GlimmaV2
错误报告	https://github.com/hasaru-k/GlimmaV2/问题

建议	测试那个,针织物,市场营销,仿生风格,I范围,基因组范围,撬棍,批注中心,scRNA序列,散射,尖叫声
链接到
增强功能
取决于我	核糖核酸酶q123
导入我	附加核心工具
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	胶质_2.14.0.tar.gz
Windows二进制	闪光_2.14.0.zip
macOS二进制（x86_64）	胶质_2.14.0.tgz
macOS二进制（arm64）	胶质_2.14.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Glimma网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/Glimma
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/Glimma网站/
包短Url	https://bioductor.org/packages/Glimma/
软件包下载报告	下载统计信息