基因区域扫描
基因区域扫描
生物导体版本：释放（3.19）
重点分析基因组离散区域的软件包。此软件包对于使用Affymetrix数据调查一个或几个基因很有用，因为它将使用Affmetrix Power Tools应用程序提取探针级数据，并将这些数据包装到ProbeLevelSet中。ProbeLevelSet直接扩展了表达式set，但包含有关每个探测序列及其派生的探测集的附加信息。该软件包包括许多功能，用于绘制这些探针级数据，作为mRNA-序列位置的函数。这可以用于分析可变剪接，特别适合用于外显子阵列数据。
作者：拉塞·福克森（Lasse Folkersen）、迭戈·迪兹（Diego Diez）
维护人员：Lasse Folkersen<哥伦比亚广播公司.dtu.dk的lasfol>
引文（从R中输入引文（“GeneRegionScan”）)以下为：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“GeneRegionScan”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“基因区域扫描”）
细节
| 生物视图 |
数据导入,微阵列,一个频道,SNP公司,软件,可视化 |
| 版本 |
1.60.0 |
| 在生物导体中 |
生物化学2.4（R-2.9）（15年） |
| 许可证 |
GPL（>=2） |
| 取决于 |
方法，博科生物(>= 2.5.5),生物串 |
| 进口 |
S4载体(>= 0.9.25),博科生物(>= 2.5.5),affxparser软件,R彩色啤酒,生物串 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
|
查看更多
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
