EWCE公司
此软件包适用于3.19版的Bioconductor。该包装已从Bioconductor中移除。有关最新的稳定版本，请参阅EWCE公司.
表达式加权细胞型富集
生物导体版本：释放（3.19）
用于确定基因列表中富集的细胞类型。该软件包提供了用于测试简单基因列表（如人类疾病相关基因）和差异表达研究结果中的丰富性的工具。该软件包不依赖于任何特定的单细胞转录组数据集，可以在分析中加载和使用用户定义的数据集。
作者：艾伦·墨菲[克]
，Brian Schilder[aut]，内森·斯凯恩[aut]
维护人员：阿兰·墨菲（Alan Murphy）<alanmurph94，网址：hotmail.com>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“EWCE”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“EWCE”）
细节
| 生物视图 |
生物医学信息学,差异表达式,功能基因组学,基因表达式,GeneSet扩展,遗传学,微阵列,一个频道,蛋白质组学,RNA序列,单个单元格,软件,转录,可视化,mRNA微阵列 |
| 版本 |
1.12.0 |
| 在生物导体中 |
生物多样性3.3（R-3.3）（8.5年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=4.2），RNOmni公司(>= 1.0) |
| 进口 |
stats、utils、方法，ewce数据(>= 1.7.1),数字播放器,ggplot2,重塑2,利马,字符串,HGNC助手,矩阵，平行，单细胞实验,总结性实验,DelayedArray（延迟阵列）,生物并行,正长岩(>= 0.99.8),数据表 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/NathanSkene/EWCE |
| 错误报告 |
https://github.com/NathanSkene/EWCE/issues网站 |
查看更多
| 建议 |
r工作流,遥控器,针织物,仿生风格,rmarkdown公司,测试那个(>= 3.0.0),读xl,备忘录,降价,sc变换,DESeq2公司,桅杆,延迟矩阵统计,ggdendro公司,规模,拼凑 |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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| 取决于我 |
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| 导入我 |
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| 建议我 |
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| 指向我的链接 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
