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ERSSA公司

经验RNA-seq样本量分析


生物导体版本:释放(3.19)

ERSSA软件包采用用户提供的RNA-seq差异表达数据集,并计算不同生物复制水平下差异表达基因的数量。这允许用户在不依赖任何先验假设的情况下,确定其RNA-seq数据集是否实现了足够的差异检测。

作者:邵子轩[aut,cre]

维护人员:邵子轩(Zixuan Shao.zach at gmail.com>)

引文(从R中输入引文(“ERSSA”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“ERSSA”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“ERSSA”)
ERSSA包简介 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 差异表达式,基因表达式,免疫肿瘤学,多重比较,质量控制,RNA序列,软件,转录
版本 1.22.0
在生物导体中 生物技术3.8(R-3.5)(5.5年)
许可证 GPL-3|文件许可证
取决于 R(>=4.0.0)
进口 边缘R(>= 3.23.3),DESeq2公司(>= 1.21.16),ggplot2(>= 3.0.0),R彩色啤酒(>= 1.1-2),普利尔(>= 1.8.4),生物并行(>= 1.15.8),apeglm公司(>=1.4.2)、grDevices、stats、utils
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/z邵1/ERSSA
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 ERSSA_1.22.0.tar.gz公司
Windows二进制 ERSSA_1.22.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) ERSSA_1.22.0.tgz
macOS二进制(arm64) ERSSA_1.22.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ERSSA
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/ERSSA
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ERSSA/
包短Url https://bioconductor.org/packages/ERSSA/
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