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DNAshapeR公司

DNA形状特征的高通量预测


生物导体版本：释放（3.19）

DNAhapeR是一种R/BioConductor软件包，用于超快速、高通量预测DNA形状特征。该软件包允许为统计学习预测、可视化和编码DNA形状特征。

作者：徐佩秋和费德里科·科莫格里奥

维护人员：Tsu-Pei Chiu

引文（从R中输入引文（“DNAshapeR”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）生物管理器：：安装（“DNAshapeR”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“DNAshapeR”）
DNAshapeR公司 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

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细节

生物视图 DNA3D结构,软件,结构预测
版本 1.32.0
在生物导体中 生物多样性3.3（R-3.3）（8.5年）
许可证 GPL-2型
取决于 R（>=3.4），基因组范围
进口 卢比(>= 0.12.1),生物串,领域
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 批注中心,针织物,rmarkdown公司,测试那个,英国基因组。Scerevisiae公司。UCSC.sacCer3,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19,插入符号
链接到 卢比
增强功能
取决于我
导入我
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 DNA沙佩R_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 DNA形状R_1.32.0.zip
macOS二进制（x86_64） DNA磁带R_1.32.0.tgz
macOS二进制（arm64） DNA磁带R_1.32.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DNAshapeR
源存储库（开发人员访问） git克隆git@git.bioconductor.org：packages/DNAshapeR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/DNAshapeR/
包短Url https://bioconductor.org/packages/DNAshapeR/
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