注册并公开摘要对于生物2024

DNAshapeR公司

DNA形状特征的高通量预测


生物导体版本:释放(3.18)

DNAhapeR是一种R/BioConductor软件包,用于超快速、高通量预测DNA形状特征。该软件包可以预测、可视化和编码DNA形状特征,用于统计学习。

作者:徐佩秋和费德里科·科莫格里奥

维护人员:Tsu-Pei Chiu

引文(从R中输入引文(“DNAshapeR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.软件包(“BiocManager”)BiocManager::安装(“DNAshapeR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“DNAshapeR”)
DNAshapeR公司 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 DNA3D结构,软件,结构预测
版本 1.30.0
在生物导体中 生物多样性3.3(R-3.3)(8年)
许可证 GPL-2型
取决于 R(>=3.4),基因组学范围
进口 Rcpp(>=0.12.1),生物串,字段
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 批注Hubknitr rmarkdown测试,BS基因组。Scerevisiae公司。UCSC.sacCer3,BS基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19,插入符号
链接到 卢比
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在您的R会话中使用此软件包的说明。

源程序包 DNA形状R_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 DNAshapeR_1.30.0.zip公司
macOS二进制(x86_64) DNA磁带R_1.30.0.tgz
macOS二进制(arm64) DNA磁带R_1.30.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DNAshapeR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DNAshapeR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/DNAshapeR/
包短Url https://bioconductor.org/packages/DNAshapeR/
软件包下载报告 下载统计信息