DMCFB公司
基于贝叶斯函数方法的差异甲基化胞嘧啶
生物导体版本:释放(3.19)
DMCFB是一种在亚硫酸氢盐测序数据中使用贝叶斯函数回归模型识别差异甲基化胞嘧啶的管道。通过使用功能回归数据模型,它试图捕获位置特异性、群体特异性和其他协变量特异性甲基化模式,以及甲基化数据的空间相关模式和未知基础模型。相对于真正的基础模型和包含任何协变量而言,它是稳健和灵活的,缺失值是使用位置和样本之间的空间相关性进行插补的。该方法采用贝叶斯方法进行估计和推理。
作者:Farhad Shokoohi【aut,cre】
维护人员:Farhad Shokoohi<icloud.com上的Shokoohi>
安装
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如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“DMCFB”)
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文档
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浏览渐晕图(“DMCFB”)
细节
生物视图 |
贝叶斯主义者,新闻报道,差异甲基化,回归,排序,软件 |
版本 |
1.18.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.10(R-3.6)(4.5年) |
许可证 |
GPL-3型 |
取决于 |
R(>=4.0.0),总结性实验、方法、,S4载体,生物并行,基因组范围,I范围 |
进口 |
utils、stats、,speedglm公司,MASS(质量),数据表、花键、,臂,rtracklayer公司,基准,易怒的,矩阵统计,fast假人,图形 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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错误报告 |
https://github.com/shokoohi/DMCFB/问题 |
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程序包档案
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