DEsubs公司
DEsubs:R软件包，用于使用RNA-seq表达实验灵活识别差异表达亚通路
生物导体版本：释放（3.19）
DEsubs是一个基于网络的系统生物学软件包，可提取RNA-seq实验记录的通路网络中受疾病干扰的亚通路。它包含一个广泛且可定制的框架，涵盖子路径分析所有阶段的广泛操作模式，支持特定案例的方法。操作模式是指针对各种生物和药理特征的通路网络构建和处理、亚通路提取、可视化和富集分析。它的功能使其成为建模者和实验者识别复杂疾病更强大的系统级生物标记物的工具指南。
作者：Aristidis G.Vrahatis和Panos Balomenos
维护人员：Aristidis G.Vrahatis<upatras.gr>，Panos Balomenos<upatrac.gr>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“DEsubs”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“DEsubs”）
细节
| 生物视图 |
差异表达式,基因表达式,图形和网络,免疫肿瘤学,KEGG公司,网络,网络丰富,规范化,路径,RNA序列,软件,系统生物学 |
| 版本 |
1.30.0 |
| 在生物导体中 |
生物化学3.4（R-3.3）（8年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=3.3），位置匹配 |
| 进口 |
图表,记录仪,苏格兰皇家银行,绕圈子,利马,边缘R,EB序列,NBPSeq公司、统计、gr设备、图形、，情势图，实用程序，ggplot2,矩阵,硅钠铝石、工具、，设计2，方法 |
| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
