芝加哥

CHiCAGO：基因组组织的捕获Hi-C分析

生物导体版本：释放（3.19）

用于分析Capture Hi-C数据的管道。

作者：乔纳森·凯恩斯、保拉·弗雷尔·普里切特、史蒂文·温格特、米哈伊尔·斯皮瓦科夫

维护人员：米哈伊尔·斯皮瓦科夫（Mikhail Spivakov）<Mikhail.Spivakov at lms.mrc.ac.uk>

引文（从R中输入引文（“芝加哥”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“芝加哥”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“芝加哥”）

生物视图	表观遗传学,HiC公司,排序,软件
版本	1.32.0
在生物导体中	生物C 3.3（R-3.3）（8年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=3.3.1），数据表
进口	矩阵统计,MASS（质量）,Hmisc公司,德拉波特，方法，grDevices，图形，stats，utils
系统要求
统一资源定位地址

建议	参数分析器,生物风格,针织物,rmarkdown公司,PCHiC数据,测试那个,Rsamtools软件,基因组相互作用,基因组范围,I范围,批注中心
链接到
增强功能
取决于我	PCHiC数据
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	芝加哥-1.32.0.tar.gz
Windows二进制	芝加哥-1.32.0.zip
macOS二进制（x86_64）	芝加哥-1.32.0.tgz
macOS二进制（arm64）	芝加哥-1.32.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/芝加哥
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：套餐/芝加哥
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/芝加哥/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/芝加哥/
软件包下载报告	下载统计信息