化学工程师
R的化学信息学工具包
生物导体版本:释放(3.19)
ChemmineR是一个用于分析R中类药物小分子数据的化学信息学软件包。其最新版本包含高效处理大量分子、物理化学/结构属性预测、结构相似性搜索、,使用多种算法对复合库进行分类和聚类。此外,它还提供了化合物聚类结果和化学结构的可视化功能。
作者:Y.Eddie Cao、Kevin Horan、Tyler Backman、Thomas Girke
维护人员:托马斯·吉尔克(Thomas Girke)
引文(从R中输入引文(“ChemmineR”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)生物管理器::安装(“ChemmineR”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“ChemmineR”)
细节
生物视图 |
生物医学信息学,基于细胞的分析,化学信息学,群集,数据导入,基础设施,代谢组学,微量滴定板测定,药物遗传学,药物基因组学,蛋白质组学,软件,可视化 |
版本 |
3.56.0 |
在生物导体中 |
生物活性炭2.3(R-2.8)(16年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=2.10.0),方法 |
进口 |
罗杰森,图形,统计,RCurl(RCurl),数据库接口,消化,生物遗传学,卢比(>= 0.11.0),ggplot2,网格,额外网格,png公司,base64enc标准,DT公司,rsvg公司,jsonlite公司,斯特林吉 |
系统要求 |
GNU品牌 |
统一资源定位地址 |
https://github.com/girke-lab/ChemmineR |
查看更多
建议 |
RSQ网站,散点图3d,gplots(gplots),fmcsR公司,雪,RPostgreSQL,仿生风格,针织物,针织物,针织靴带,化学药物,png公司,rmarkdown公司,生物技术经理,围巾 |
链接到 |
卢比,伯克希尔哈撒韦 |
增强功能 |
化学OB |
取决于我 |
爱尔兰共和国,fmcsR公司,化学药物 |
导入我 |
生物测定R,复合Db,自定义CMPdb,爱尔兰共和国,fmcsR公司,MetID(气象ID),化学博士,药物模拟2DR,DR通过SPCN |
建议我 |
化学OB,xnet网络 |
指向我的链接 |
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生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。