咀嚼
Illumina Human甲基化450和EPIC芯片分析甲基化管道
生物导体版本：释放（3.19）
该软件包包括质量控制指标、一系列标准化方法和新方法，以识别差异甲基化区域并突出拷贝数变化。
作者：袁田[cre，aut]，蒂凡尼·莫里斯[ctb]，李·斯特林[ctb].安德鲁·费伯[ctb]，安德鲁·特申道夫[ctb].安库尔·查克拉瓦尔蒂
维护人员：袁天<gmail.com>上的冠军450k
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“ChAMP”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文档
细节
| 生物视图 |
副本编号,DNA甲基化,甲基化阵列,微阵列,规范化,软件,双通道 |
| 版本 |
2.34.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术2.13（R-3.0）（10.5年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=3.3），米菲,ChAMP数据(>= 2.6.0),DMR类别,Illumina450探头变量.db,IlluminaHumanMethylationEPIC清单，DT，转/分 |
| 进口 |
prettydoc、Hmisc、，全球测试,特别行政区,照明、rmarkdown、，IlluminaHumanMethylation450k最佳,Illumina人甲基化EPICanno.ilm10b4.hg19,利马,DNA副本,预处理核心,插补,马雷,瓦特瓜，年，戈塞克,甲基错误、kpmt、ggplot2、，基因组范围,q值、isva、doParallel、，颠簸猎人，四边形，有光泽，闪亮，圆滑（>=4.5.6），RColorBrewer，dendextend，matrixStats，组合 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
|
查看更多
| 建议 |
knitr、rmarkdown |
| 链接到 |
|
| 增强功能 |
|
| 取决于我 |
|
| 导入我 |
|
| 建议我 |
GeoTcga数据 |
| 指向我的链接 |
|
| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在您的R会话中使用此软件包的说明。
