细胞混合物
评估细胞特定混合
生物导体版本:释放(3.19)
CellMixS提供了度量和函数来评估单细胞转录组数据中具有单细胞分辨率的批效应、数据集成和批效应校正。结果可以在不同级别上进行可视化和总结,例如在单元格、单元格类型或数据集级别上。
作者:阿尔穆特·吕特格[aut,cre]
维护人员:Almut Lütge<Almut.luetge at uzh.ch>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“CellMixS”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“CellMixS”)
细节
生物视图 |
BatchEffect(批次效果),基因表达式,单个单元格,软件,转录组学 |
版本 |
1.20.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.9(R-3.6)(5年) |
许可证 |
GPL(>=2) |
取决于 |
k样本,R(>=4.0) |
进口 |
生物邻居,ggplot2,散射,翡翠色,奶牛场,总结性实验,单细胞实验,第三年,马格里特,数字播放器,ggridges公司,统计,呜呜声、方法、,生物并行,生物遗传学 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/almutlue/CellMixS |
错误报告 |
https://github.com/almutlue/CellMixS/issues(https://github.com/almutlue/CellMixS/issues) |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。