CSSQ公司

Chip-seq信号量化流水线

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包旨在执行统计分析，以确定多组ChIP-seq数据集之间具有统计意义的差异绑定区域。

作者：Ashwath Kumar[aut]，Michael Y Hu[aut'，Yajun Mei[aut].范玉红

维护人员：佐治亚理工学院Fan实验室<yuhong.Fan at biology.gatech.edu>

引文（从R中输入引文（“CSSQ”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“CSSQ”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“CSSQ”）

CSSQ简介	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式

生物视图	ChIPSeq公司,差异峰值呼叫,规范化,排序,软件
版本	1.16.0
在生物导体中	生物柴油3.11（R-4.0）（4年）
许可证	艺术-2.0
取决于	总结性实验,基因组范围,I范围,S4载体,rtracklayer公司
进口	基因组比对,基因组特征,Rsamtools软件,ggplot2、grDevices、stats、utils
系统要求
统一资源定位地址

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	CSSQ_1.16.0.tar.gz号
Windows二进制	CSSQ_1.16.0.zip码
macOS二进制（x86_64）	CSSQ_1.16.0.tgz型
macOS二进制（arm64）	中国证监会_1.16.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CSSQ
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/CSSQ
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/CSQ网址/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/CSSQ/
软件包下载报告	下载统计信息