BgeeCall电话
自动RNA-Seq存在/缺失基因表达调用生成
生物导体版本：释放（3.19）
BgeeCall允许生成存在/不存在的基因表达调用，而无需使用类似TPM<1的任意截止。调用是基于引用的基因间序列生成的。这些序列是根据Bgee中整合的每个物种的所有RNA-Seq库的表达生成的(网址：https://bgee.org).
作者：朱利安·沃尔布雷特（aut，cre）、萨拉·丰塞卡·科斯塔（Sara Fonseca Costa）、朱利安·布鲁克斯（Julien Roux）、马克·罗宾逊·里查维（Marc Robinson Rechavi）、弗雷德里克·巴斯蒂安（Frederic Bastian）
维护人员：朱利安·沃尔布雷特
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“BgeeCall”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“BgeeCall”）
细节
| 生物视图 |
基因表达式,RNA序列,软件 |
| 版本 |
1.20.1 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.11（R-4.0）（4.5年） |
| 许可证 |
GPL-3+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=3.6） |
| 进口 |
基因组特征,tximport（最大端口）,生物串,rtracklayer公司,生物反应器,jsonlite公司、方法、，数字播放器,数据表,新加坡证券交易所、grDevices、graphics、stats、utils、，rslurm公司,rhdf5型,txdb制造商 |
| 系统要求 |
卡利斯托 |
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/BgeeDB/BgeeCall网站 |
| 错误报告 |
https://github.com/BgeeDB/BgeeCall/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
