BR基因组学
高效分析高分辨率基因组数据的工具
生物导体版本：释放（3.19）
该软件包为使用标准生物导体方法和类分析高分辨率基因组数据提供了有用和高效的实用工具。BRGenomics功能丰富，简化了许多对齐后处理步骤和数据处理。重点是有效分析多个数据集，支持标准化和黑名单。包括以下功能：标准化数据中的尖峰；生成基本对分辨率读取计数和覆盖数据（例如，用于热图）；导入和处理bam文件（例如，用于转换为bigWig文件）；生成具有置信区间的metaplots/metaprofiles（引导平均剖面）；方便地调用DESeq2，而无需使用基因离散的样本盲估计；在其他功能中。
作者：迈克·德贝拉丁
维护人员：迈克·德贝拉丁（Mike DeBerardine）<Mike.DeBerardine at gmail.com>
引文（从R中输入引文（“BRGenomics”）)以下为：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“BRGenomics”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
细节
| 生物视图 |
ATACSeq公司,ChIPSeq公司,新闻报道,数据导入,基因表达,基因调控,规范化,RNA序列,排序,软件,转录 |
| 版本 |
1.16.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.11（R-4.0）（4年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=4.0），rtracklayer公司,基因组信息数据库,S4载体 |
| 进口 |
基因组学范围，平行，I范围，统计，Rsamtools软件,基因组比对,DESeq2公司,总结性实验，实用程序，方法 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://mdeber.github.io |
| 错误报告 |
https://github.com/mdeber/BR基因组/问题 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
