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BANDITS：差异拼接的贝叶斯分析
生物导体版本：释放（3.19）
BANDITS是一种贝叶斯层次模型，用于通过差异转录使用（DTU）在两种或多种条件之间检测基因和转录物的差异剪接。该方法使用贝叶斯层次结构框架，允许在Dirichlet-Multinomal模型中指定样本比例，并对片段分配到转录本进行采样。通过马尔可夫链蒙特卡罗（MCMC）技术推断参数，并通过对转录物平均相对丰度的后验密度进行多元Wald检验来进行DTU检验。
作者：西蒙·提贝里[aut，cre]。
维护人员：西蒙·提贝里（Simone.Tiberi at uzh.ch）
引文（从R中输入引文（“BANDITS”）)以下为：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“BANDITS”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“BANDITS”）
细节
| 生物视图 |
交替拼接,贝叶斯主义者,差异表达式,差分拼接,基因表达,遗传学,多重比较,RNA序列,排序,软件,统计方法,转录,可视化 |
| 版本 |
1.20.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.9（R-3.6）（5年） |
| 许可证 |
GPL（>=3） |
| 取决于 |
R（>=4.3.0） |
| 进口 |
卢比,doRNG公司,MASS（质量）,数据表,R.utils公司,do并行，平行，foreach公司，方法，统计，图形，ggplot2,DRIMSeq公司,BiocParallel公司 |
| 系统要求 |
C++17 |
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/SimoneTiberi/BANDITS网站 |
| 错误报告 |
https://github.com/SimoneTiberi/BANDITS/问题 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
