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ABS序列

ABSSeq:一种基于绝对表达差异建模的新RNA-Seq分析方法


生物导体版本:释放(3.19)

利用负二项分布并根据表达水平上的离散异质性调节fold-change,通过两组间的绝对计数差异推断差异表达基因。

作者:杨文涛

维护人员:杨文涛(Wentao Yang)<wyang at zoologie.uni-kiel.de>

引文(从R中输入引文(“ABSSeq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“ABSSeq”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“ABSSeq”)
ABS序列 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 差异表达式,软件
版本 1.58.0
在生物导体中 生物C 2.14(R-3.1)(10年)
许可证 GPL(>=3)
取决于 R(>=2.10),方法
进口 位置匹配,利马
系统要求
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 ABS序号_1.58.0.tar.gz
Windows二进制 ABS序列_1.58.0.zip
macOS二进制(x86_64) ABS序号_1.58.0.tgz
macOS二进制(arm64) ABS序号_1.58.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ABSSeq网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/ABSSeq
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ABSSeq网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/ABSSeq网站/
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