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SH2域超家族

根目录：	SUPERFAMILY中的SCOP层次结构[ 0] (11)
类别：	α和β蛋白（a+b）[ 53931] (376)
折叠：	类SH2[ 55549]
超级家族:	SH2域[ 55550]
家庭：	SH2域[ 55551] (34)

超级家庭统计

	基因组学(456)	Uniprot 2018_03基因组	PDB链（SCOP1.75)
域	14,438	41145个	94
蛋白质类	12,967	36,814	90

功能注释

一般类别	法规
详细类别	信号转导

文件：SCOP结构域超家族的功能注释

酶委员会（EC）

(显示详细信息)

	EC术语	FDR（全部）	SDEO水平	注释（直接或继承）
酶委员会（EC）	作用于酯键	0.000006817	信息最少	直接
酶委员会（EC）	磷酸单酯水解酶	0.000002804	信息量适中	直接
酶委员会（EC）	磷酸二酯水解酶	0.00007356	信息量适中	直接
酶委员会（EC）	非特异性蛋白酪氨酸激酶	0	信息	直接
酶委员会（EC）	磷酰肌醇磷脂酶C	0.0000000000000101	信息	直接
酶委员会（EC）	蛋白质酪氨酸磷酸酶	0.0001895	信息	直接
酶委员会（EC）	磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸5-磷酸	0	高度信息化	直接

文件：SCOP域的EC注释

疾病本体（DO）

(显示详细信息)

	DO术语	FDR（全部）	SDDO级别	注释（直接或继承）
疾病本体（DO）	器官系统癌	0.0001116	信息最少	直接
疾病本体（DO）	传染病	0.0001827	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	造血系统疾病	0.03907	信息量适中	继承
疾病本体（DO）	血液肿瘤	0.8738	信息量适中	继承
疾病本体（DO）	乳腺癌	0.000961	信息	直接
疾病本体（DO）	髓系白血病	0.302	信息	继承
疾病本体（DO）	髓样肿瘤	1	信息	继承
疾病本体（DO）	骨髓病	0.0000003482	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	原位癌	0.0003699	高度信息化	直接

文件：SCOP域的DO注释

人类表型（HP）

(显示详细信息)

	HP术语	FDR（全部）	SDHP水平	注释（直接或继承）
继承模式（MI）	体细胞突变	0.0006839	信息	直接
表型异常（PA）	代谢/体内平衡异常	0.01615	信息最少	继承
表型异常（PA）	表皮异常	0.05099	信息最少	继承
表型异常（PA）	神经系统形态异常	0.6223	信息最少	继承
表型异常（PA）	肿瘤	0.00002797	信息量适中	直接
表型异常（PA）	血液和造血组织异常	0.00004311	信息量适中	直接
表型异常（PA）	呼吸系统异常	0.0001677	信息量适中	直接
表型异常（PA）	结缔组织异常	0.1259	信息量适中	继承
表型异常（PA）	免疫系统生理异常	0.5118	信息量适中	继承
表型异常（PA）	异常CNS感染	0.000008279	信息	直接
表型异常（PA）	血小板形态异常	0.008165	信息	继承
表型异常（PA）	温度调节异常	0.01311	信息	继承
表型异常（PA）	异常细胞生理学	0.02766	信息	继承
表型异常（PA）	蜂窝织炎	0.00003641	高度信息化	直接
表型异常（PA）	自身免疫性	0.0004787	高度信息化	直接
表型异常（PA）	骨髓细胞形态异常	0.03309	高度信息化	继承
表型异常（PA）	皮肤炎症异常	0.1672	高度信息化	继承

文件：SCOP域的HP注释

小鼠表型（MP）

(显示详细信息)

	MP术语	FDR（全部）	SDMP级别	注释（直接或继承）
哺乳动物表型（MP）	免疫系统表型	0.0000000007422	信息最少	直接
哺乳动物表型（MP）	造血系统表型	0.000000001289	信息最少	直接
哺乳动物表型（MP）	异常内稳态	0.1211	信息最少	继承
哺乳动物表型（MP）	细胞表型	0.1943	信息最少	继承
哺乳动物表型（MP）	生长/大小/身体部位表型	0.5095	信息最少	继承
哺乳动物表型（MP）	血细胞形态/发育异常	0.00000001058	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	免疫血清蛋白生理异常	0.000002013	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	腺体形态异常	0.0001928	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	免疫系统器官形态异常	0.0006336	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	蛋白质水平异常	0.02209	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	肝脏/胆道系统表型	0.02434	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	异常单核细胞形态	0.02731	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	造血细胞数异常	0.03449	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	血细胞形态异常	0.03466	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	身体成分异常	0.03546	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	白细胞生理异常	0.07148	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	出生后生长/体重/体型异常	0.08614	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	细胞异常死亡	0.1842	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	异常的专业抗原呈递细胞生理学	0.245	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	异常B细胞增殖	0.000000002484	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	自身免疫反应	0.000001671	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	胸腺形态异常	0.000005474	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	异常细胞分化	0.0001162	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	循环细胞因子水平异常	0.0002386	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	肝脏生理异常	0.0009464	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	脾脏形态异常	0.0009467	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	干扰素水平异常	0.03205	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	效应器T细胞形态异常	0.04849	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	B淋巴细胞抗原呈递异常	0.0589	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	成熟B细胞形态异常	0.06373	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	B细胞分化异常	0.06701	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	细胞凋亡增加	0.1473	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	白细胞介素水平异常	0.1513	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	异常瘦体重	0.1911	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	T细胞数量减少	0.2415	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	干扰素分泌异常	0.2733	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	异常自然杀伤细胞介导的细胞毒性	0.3573	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	B-1 B电池数量异常	0.0000005602	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	循环白细胞介素17水平升高	0.000161	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	表面II类分子水平异常	0.0003437	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	胸腺细胞数量减少	0.0003962	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	未成熟B细胞数量减少	0.0004615	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	B细胞凋亡异常	0.0005265	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	增加的瘦体重	0.0007075	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	异常前B细胞形态	0.0008161	高度信息化	直接

文件：SCOP域的MP注释

蠕虫表型（WP）

(显示详细信息)

	WP术语	FDR（全部）	SDWP水平	注释（直接或继承）
蠕虫表型（WP）	器官系统形态学变异	0.02788	信息最少	继承
蠕虫表型（WP）	细胞形态变异	0.03399	信息最少	继承
蠕虫表型（WP）	细胞生理变异	0.2685	信息最少	继承
蠕虫表型（WP）	生物代谢过程变体	0.5325	信息最少	继承
蠕虫表型（WP）	蛋白质表达变体	0.00001267	信息量适中	直接
蠕虫表型（WP）	肌肉细胞生理变异	0.000000000006287	信息	直接
蠕虫表型（WP）	单元组件定位变量	0.00000001605	信息	直接
蠕虫表型（WP）	体壁肌肌节形态变异	0.00000002692	信息	直接
蠕虫表型（WP）	线粒体形态变异	0.00000004475	信息	直接
蠕虫表型（WP）	蛋白质表达水平变异	0.0003468	信息	直接
蠕虫表型（WP）	肌细胞附着变异体	零点零零零零零零零零零零零零零一六九九	高度信息化	直接
蠕虫表型（WP）	蛋白质表达降低	0.0000000005527	高度信息化	直接

文件：SCOP域的WP注释

苍蝇表型（FP）

(显示详细信息)

	FP术语	FDR（全部）	SDFP级别	注释（直接或继承）
苍蝇表型（FP）	平面极性缺陷	0.00003099	信息	直接

文件：SCOP域的FP注释

飞行解剖学（FA）

(显示详细信息)

	FA术语	FDR（全部）	SDFA级别	注释（直接或继承）
飞行解剖学（FA）	器官系统细分	0.005881	信息最少	继承
飞行解剖学（FA）	多组织结构	0.009351	信息最少	继承
飞行解剖学（FA）	有机体细分	0.04002	信息最少	继承
飞行解剖学（FA）	神经系统	0.08604	信息最少	继承
飞行解剖学（FA）	成人	0.09556	信息最少	继承
飞行解剖学（FA）	幼虫	0.4482	信息最少	继承
飞行解剖学（FA）	细胞	0.8525	信息最少	继承
飞行解剖学（FA）	无细胞解剖结构	0.0002276	信息量适中	直接
飞行解剖学（FA）	成人部分	0.0004363	信息量适中	直接
飞行解剖学（FA）	女性特有的解剖实体	0.004303	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	性腺	0.02251	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	成人标记	0.027	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	胚胎	0.05416	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	多单元组件结构	0.1058	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	感觉系统	0.1065	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	神经元	0.1457	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	头	0.1895	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	周围神经系统	0.1909	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	中枢神经系统	0.4836	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	体细胞前体细胞	0.6615	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	干细胞	0.7375	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	组胺能神经元	0.00001617	信息	直接
飞行解剖学（FA）	视杆细胞	0.00002142	信息	直接
飞行解剖学（FA）	成人视叶神经元	0.00004649	信息	直接
飞行解剖学（FA）	感觉器官细胞	0.00034	信息	直接
飞行解剖学（FA）	雌性生殖系囊肿	0.0005662	信息	直接
飞行解剖学（FA）	胚胎/幼虫表皮系统	0.0008612	信息	直接
飞行解剖学（FA）	拖拉机	0.001211	信息	继承
飞行解剖学（FA）	视网膜	0.002753	信息	继承
飞行解剖学（FA）	成人头部感器	0.005916	信息	继承
飞行解剖学（FA）	男性特异性解剖实体	0.2486	信息	继承
飞行解剖学（FA）	假定胚胎/幼虫系统	0.2946	信息	继承
飞行解剖学（FA）	胚胎腹神经索中线	0.00002821	高度信息化	直接
飞行解剖学（FA）	感光细胞R7	0.00009751	高度信息化	直接
飞行解剖学（FA）	睾丸体细胞	0.002417	高度信息化	继承

文件：SCOP域的FA注释

斑马鱼解剖学（ZA）

(显示详细信息)

	ZA术语	FDR（全部）	SDZA等级	注释（直接或继承）
斑马鱼解剖学（ZA）	复合器官	0.1238	信息最少	继承
斑马鱼解剖学（ZA）	细胞	0.1454	信息最少	继承
斑马鱼解剖学（ZA）	造血细胞	0.0004451	信息	直接
斑马鱼解剖学（ZA）	造血系统	0.02142	信息	继承
斑马鱼解剖学（ZA）	单核吞噬细胞	0.2225	高度信息化	继承
斑马鱼解剖学（ZA）	专业抗原呈递细胞	0.3583	高度信息化	继承
斑马鱼解剖学（ZA）	血	0.5713	高度信息化	继承

文件：SCOP域的ZA注释

爪蟾解剖学（XA）

(显示详细信息)

	XA术语	FDR（全部）	SDXA级别	注释（直接或继承）
爪蟾非原子实体（XAN）	胚胎	1	信息最少	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	动物半球	0.01257	信息	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	动物杆	0.0008746	高度信息化	直接

文件：SCOP域的XA注释

拟南芥植物本体（AP）

(显示详细信息)

	AP术语	FDR（全部）	SDAP级别	注释（直接或继承）
植物非原子实体（PAN）	保护电池	0	信息最少	直接
植物非原子实体（PAN）	花	0	信息最少	直接
植物非原子实体（PAN）	根系统	0	信息最少	直接
植物非原子实体（PAN）	拍摄轴	0	信息最少	直接
植物非原子实体（PAN）	叶	0	信息最少	直接

文件：SCOP域的AP注释

酶委员会（EC）

(显示详细信息)

	EC术语	FDR（全部）	SDEC级	注释（直接或继承）
酶委员会（EC）	转移含磷基团	0	信息最少	直接
酶委员会（EC）	水解酶类	1	信息最少	继承
酶委员会（EC）	氨酰转移酶类	0.000000868	信息量适中	直接
酶委员会（EC）	磷酸单酯水解酶	0.000001014	信息量适中	直接
酶委员会（EC）	蛋白质酪氨酸激酶	0	信息	直接
酶委员会（EC）	环型E3泛素转移酶	0.000000001114	信息	直接
酶委员会（EC）	磷酸二酯水解酶	0.000001431	信息	直接
酶委员会（EC）	蛋白质酪氨酸磷酸酶	0.00005675	信息	直接
酶委员会（EC）	非特异性蛋白酪氨酸激酶	0	高度信息化	直接
酶委员会（EC）	磷酰肌醇磷脂酶C	2.574e-16	高度信息化	直接

文件：SCOP域的EC注释

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内部数据库链接

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检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象，即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。

探索域发生网络，其中节点表示基因组，边缘是包含感兴趣超家族的域架构（基因组之间共享）。

有73个隐马尔可夫模型代表SH2域超家族。关于如何构建模型的信息，以及显示疏水性,匹配发射概率和插入/删除概率可以检查。

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