SUPERFAMILY 2可从supfam.org。拜托联系我们如果你遇到任何问题。
主页>SCOP层次结构>POZ域超家族
人类表型(HP)
小鼠表型(MP)
蠕虫表型(WP)
酵母表型(YP)
苍蝇表型(FP)
飞行解剖学(FA)
斑马鱼解剖学(ZA)
爪蟾解剖学(XA)
拟南芥植物本体(AP)
InterPro注释
BTB(用于BR-C、ttk和bab)[7938017]或POZ(用于痘病毒和锌指)[7958847,17384421]结构域是一种多功能的蛋白质相互作用基序,涉及许多细胞功能,包括转录调控、细胞骨架动力学、离子通道组装和门控以及泛素化靶向蛋白质[16207353]. BTB结构域可以与其他结构域一起出现:BTB-锌指(BTB-ZF)、BTB-BACK-Kelch(BBK)、电压门控钾通道T1(T1-Kv)[9917379]、MATH-BTB、BTB-NPH3和BTB-BACK-PHR(BBP)。其他蛋白质,如Skp1和ElonginC,几乎完全由核心BTB折叠组成。在所有这些蛋白质家族中,BTB核心折叠在结构上是保守的,由两层α/β拓扑结构组成,其中α螺旋簇的两侧是短β片[9770450]. 来自几个锌指蛋白的POZ结构域已被证明可介导转录抑制,并与组蛋白脱乙酰酶共同抑制复合物的组分相互作用,包括N-CoR和SMRT[9019154,9824158,9765306]. POZ或BTB域也称为BR-C/Ttk或ZiN。
该条目与IPR000210的不同之处在于包含含有POZ的Skp1蛋白。
跳转到[页面顶部·SCOP分类·InterPro注释·PDBeMotif链接·功能注释·人类表型(HP)·小鼠表型(MP)·蠕虫表型(WP)·酵母表型(YP)·苍蝇表型(FP)·飞行解剖学(FA)·斑马鱼解剖学(ZA)·爪蟾解剖学(XA)·拟南芥植物本体(AP)]
浏览这个超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库用于超家族水平上所有基因组的外SCOP域分配。
序列对齐36款车型单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列一致性低于40%默认情况下显示,但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列,或粘贴或上传您自己的序列。
浏览和查看基因组中具有包括POZ域域的不同域组合。
检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象,即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。
探索域发生网络,其中节点表示基因组,边缘是包含感兴趣超家族的域架构(基因组之间共享)。
有36个隐马尔可夫模型代表POZ域超家族。关于如何构建模型的信息,以及显示疏水性,匹配发射概率和插入/删除概率可以检查。
跳转到[页面顶部·SCOP分类·InterPro注释·PDBeMotif链接·功能注释·人类表型(HP)·小鼠表型(MP)·蠕虫表型(WP)·酵母表型(YP)·苍蝇表型(FP)·飞行解剖学(FA)·斑马鱼解剖学(ZA)·爪蟾解剖学(XA)·拟南芥植物本体(AP)·内部数据库链接]