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POZ域超家族

SCOP分类
根目录: SUPERFAMILY中的SCOP层次结构[ 0] (11)
类别: α和β蛋白(a+b)[ 53931] (376)
折叠: POZ域[ 54694]
超级家族:   POZ域[ 54695] (2)
家庭: BTB/POZ域[ 54696] (5)
  钾通道的四聚结构域[ 54701] (6)


超级家庭统计
基因组(509) Uniprot 2018_03基因组 PDB链(SCOP1.75)
39,057 105,779 24
蛋白质 36,844 100,007 24


功能注释
一般类别 概述
详细类别 蛋白质相互作用

文档:
SCOP域超家族的功能注释

人类表型(HP)

(显示详细信息)
HP术语FDR(全部)SDHP水平注释(直接或继承)
表型异常(PA)肌肉组织异常0.3328信息最少继承
表型异常(PA)骨骼肌形态异常0.1334信息量适中继承
表型异常(PA)产前发育或出生异常0.1262信息继承
表型异常(PA)肌纤维形态异常0.1889信息继承
表型异常(PA)Breech演示0.0006717高度信息化直接
表型异常(PA)肌纤维包涵体0.01028高度信息化继承

文档:SCOP域的HP注释

小鼠表型(MP)

(显示详细信息)
MP术语FDR(全部)SDMP级别注释(直接或继承)
哺乳动物表型(MP)肌肉生理异常0.1378信息量适中继承
哺乳动物表型(MP)肌肉抽搐0.0004253高度信息化直接

文档:SCOP域的MP注释

蠕虫表型(WP)

(显示详细信息)
WP术语FDR(全部)SDWP水平注释(直接或继承)
蠕虫表型(WP)幼虫生长变异体0.004711信息最少继承
蠕虫表型(WP)幼虫发育变异0.02828信息最少继承
蠕虫表型(WP)细胞发育变异体0.06907信息最少继承
蠕虫表型(WP)细胞生理变异0.6894信息最少继承
蠕虫表型(WP)细胞形态变异0.846信息最少继承
蠕虫表型(WP)生物代谢过程变体1信息最少继承
蠕虫表型(WP)细胞周期变异0.0001887信息量适中直接
蠕虫表型(WP)生殖细胞发育变异0.0004786信息量适中直接
蠕虫表型(WP)细胞分裂变体0.006737信息量适中继承
蠕虫表型(WP)细胞组织生物发生变体0.02746信息量适中继承
蠕虫表型(WP)早期胚胎致死0.02975信息量适中继承
蠕虫表型(WP)细胞凋亡变体0.1031信息量适中继承
蠕虫表型(WP)有机体片段形态变异0.3094信息量适中继承
蠕虫表型(WP)身体区域形态变异0.3158信息量适中继承
蠕虫表型(WP)生殖细胞分化变异0.9576信息量适中继承
蠕虫表型(WP)蛋白质相互作用变体0.9991信息量适中继承
蠕虫表型(WP)细胞稳态代谢变异1信息量适中继承
蠕虫表型(WP)早期幼虫停止0.00000163信息直接
蠕虫表型(WP)卵子发生变异期间的粗线期进展0.000004623信息直接
蠕虫表型(WP)累积生殖系细胞尸体0.00001156信息直接
蠕虫表型(WP)胚胎细胞组织生物发生变体0.00001744信息直接
蠕虫表型(WP)神经元迁移变异0.000156信息直接
蠕虫表型(WP)细胞骨架组织生物发生变体0.0001688信息直接
蠕虫表型(WP)减数分裂染色体组织变异0.01262信息继承
蠕虫表型(WP)染色体分离变异0.05914信息继承
蠕虫表型(WP)体轴形态变异0高度信息化直接
蠕虫表型(WP)主轴位置变量0.0000000000003807高度信息化直接
蠕虫表型(WP)细胞质流缺陷0.0000000000004213高度信息化直接
蠕虫表型(WP)L1幼虫发育变异体0.00000000001456高度信息化直接
蠕虫表型(WP)细胞增殖增加0.00000000005979高度信息化直接
蠕虫表型(WP)早期胚胎干细胞细胞质外观缺陷0.0000000006081高度信息化直接
蠕虫表型(WP)有丝分裂纺锤体缺陷的早期emb0.000000051高度信息化直接
蠕虫表型(WP)细胞凋亡增加0.0000001222高度信息化直接
蠕虫表型(WP)胚胎停滞0.000001303高度信息化直接
蠕虫表型(WP)对蛋白质聚集引起的瘫痪有抵抗力0.00002884高度信息化直接
蠕虫表型(WP)X染色体不分离0.0008411高度信息化直接

文档:SCOP域的WP注释

酵母表型(YP)

(显示详细信息)
YP术语FDR(全部)SDYP级别注释(直接或继承)
酵母表型(YP)耐化学品性0信息最少直接

文档:SCOP域的YP注释

苍蝇表型(FP)

(显示详细信息)
FP术语FDR(全部)SDFP级别注释(直接或继承)
苍蝇表型(FP)看得见的0.3303信息继承
苍蝇表型(FP)睡眠缺陷0.0008226高度信息化直接

文档:SCOP域的FP注释

飞行解剖学(FA)

(显示详细信息)
FA术语FDR(全部)SDFA级别注释(直接或继承)
飞行解剖学(FA)多组织结构0.4157信息最少继承
飞行解剖学(FA)女性特有的解剖实体0.1648信息量适中继承
飞行解剖学(FA)性腺0.2235信息量适中继承
飞行解剖学(FA)生殖病院0.1077信息继承

文档:SCOP域的FA注释

斑马鱼解剖学(ZA)

(显示详细信息) 文档:SCOP域的ZA注释

爪蟾解剖学(XA)

(显示详细信息)
XA术语FDR(全部)SDXA级别注释(直接或继承)
爪蟾非原子实体(XAN)神经系统0.8181信息最少继承
爪蟾非原子实体(XAN)1信息最少继承
爪蟾非原子实体(XAN)空泡复合器官1信息最少继承
爪蟾非原子实体(XAN)感觉系统1信息量适中继承
爪蟾非原子实体(XAN)眼睛1信息继承
爪蟾非原子实体(XAN)神经元0.03576高度信息化继承
爪蟾非原子实体(XAN)单元格部分0.147高度信息化继承
爪蟾发育阶段(XDE)胚胎期0.0002364信息量适中直接
爪蟾发育阶段(XDE)NF阶段100.000518高度信息化直接

文档:SCOP域的XA注释

拟南芥植物本体(AP)

(显示详细信息)
AP术语FDR(全部)SDAP级别注释(直接或继承)
植物非原子实体(PAN)拍摄轴0.57信息最少继承
植物非原子实体(PAN)0.6723信息最少继承
植物非原子实体(PAN)多组织植物结构的重要组成部分0.8973信息最少继承
植物非原子实体(PAN)整个工厂1信息最少继承
植物非原子实体(PAN)种子1信息最少继承
工厂原子实体(PAN)水果0.0000000001496信息直接
植物非原子实体(PAN)莲座叶0.00000001428信息直接
植物非原子实体(PAN)地面组织的一部分0.2076信息继承
工厂原子实体(PAN)皮层0.007866高度信息化继承

文档:SCOP域的AP注释

InterPro注释
交叉引用 IPR011333级 SSF54695号 蛋白质匹配
摘要

BTB(用于BR-C、ttk和bab)[公共医学7938017]或POZ(用于痘病毒和锌指)[公共医学7958847,公共医学17384421]结构域是一种多功能的蛋白质相互作用基序,涉及许多细胞功能,包括转录调控、细胞骨架动力学、离子通道组装和门控以及泛素化靶向蛋白质[公共医学16207353]. BTB结构域可以与其他结构域一起出现:BTB-锌指(BTB-ZF)、BTB-BACK-Kelch(BBK)、电压门控钾通道T1(T1-Kv)[公共医学9917379]、MATH-BTB、BTB-NPH3和BTB-BACK-PHR(BBP)。其他蛋白质,如Skp1和ElonginC,几乎完全由核心BTB折叠组成。在所有这些蛋白质家族中,BTB核心折叠在结构上是保守的,由两层α/β拓扑结构组成,其中α螺旋簇的两侧是短β片[公共医学9770450]. 来自几个锌指蛋白的POZ结构域已被证明可介导转录抑制,并与组蛋白脱乙酰酶共同抑制复合物的组分相互作用,包括N-CoR和SMRT[公共医学9019154,公共医学9824158,公共医学9765306]. POZ或BTB域也称为BR-C/Ttk或ZiN。

该条目与IPR000210的不同之处在于包含含有POZ的Skp1蛋白。


InterPro数据库


关于配体、序列和结构基序的PDBeMotif信息
交叉引用 PDB条目
配体结合统计
核酸结合统计
二级结构元素的出现
小型3D结构图案的出现

PDBeMotif资源

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内部数据库链接

浏览这个超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库用于超家族水平上所有基因组的外SCOP域分配。


序列对齐36款车型单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列一致性低于40%默认情况下显示,但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列,或粘贴或上传您自己的序列。


浏览和查看基因组中具有包括POZ域域的不同域组合。


检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象,即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。


探索域发生网络,其中节点表示基因组,边缘是包含感兴趣超家族的域架构(基因组之间共享)。

有36个隐马尔可夫模型代表POZ域超家族。关于如何构建模型的信息,以及显示疏水性,匹配发射概率插入/删除概率可以检查。


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