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主页>SCOP层次结构>丝氨酸蛋白酶抑制剂超家族CI-2家族
InterPro注释
该蛋白酶抑制剂家族属于MEROPS抑制剂家族I13,IG家族。它们抑制S1和S8家族的肽酶[14705960]。马铃薯抑制剂I型序列不仅局限于马铃薯,还存在于其他植物物种中,例如:大麦胚乳糜蛋白酶抑制剂[3106042]和南瓜胰蛋白酶抑制剂。水蛭中存在例外情况,例如。药用水蛭(药用水蛭),但不是其他后生动物[3519213]。一般来说,这些蛋白质对糜蛋白酶样和弹性蛋白酶样蛋白酶具有特异性。这些抑制剂在结构上很小(60到90个残基),与其他蛋白酶抑制剂家族相比,它们缺乏二硫键。抑制剂是一个楔形分子,其尖角由蛋白酶结合环形成,其中含有松驰键。环与蛋白酶活性位点紧密结合,随后剪切键断裂,导致酶受到抑制[3519213].
抑制剂(指定类型I和II)为在马铃薯块茎中合成,随着块茎的发育浓度增加。整个植物中抑制剂的合成也是由叶片损伤引起的;这种全身反应是由一种假定的植物激素的释放触发的。
在细菌和古菌中发现的例子可能是假阳性。
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浏览此超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库用于超家族水平上所有基因组的外SCOP域分配。
序列对齐8种型号点击上面的“路线”图标,即可获得该超级家族中的路线。PDB序列的相同性小于40%默认情况下显示,但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列,或者粘贴或上传您自己的序列。
浏览和查看具有以下特征的基因组中的蛋白质不同的结构域组合包括丝氨酸蛋白酶抑制剂结构域的CI-2家族。
检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象,即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。
探索域发生网络,其中节点表示基因组,边缘是包含感兴趣超家族的域架构(基因组之间共享)。
丝氨酸蛋白酶抑制剂超家族的CI-2家族有8个隐马尔可夫模型。关于如何构建模型的信息,以及显示疏水性,匹配发射概率和插入/删除概率可以检查。
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