MHC抗原识别域家族

SCOP分类

根目录：	SUPERFAMILY中的SCOP层次结构[ 0] (11)
类别：	α和β蛋白（a+b）[ 53931] (376)
折叠：	MHC抗原识别域[ 54451]
超级家族：	MHC抗原识别域[ 54452]
家庭:	MHC抗原识别域[ 54453] (12)

家庭统计

	基因组(65)	Uniprot 2018_03基因组	PDB链（SCOP1.75)
域	2,875	69,430	190
蛋白质类	2869个	69,385	190

疾病本体（DO）

(显示详细信息)

	DO术语	FDR（全部）	SDDO级别	注释（直接或继承）
疾病本体（DO）	神经系统疾病	0.01255	信息最少	继承
疾病本体（DO）	器官系统癌	0.07263	信息最少	继承
疾病本体（DO）	过敏反应Ⅱ型疾病	0.00000001975	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	传染病	0.0000004772	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	代谢病	0.000001213	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	造血系统疾病	0.00001072	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	结缔组织病	0.00002395	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	胃肠系统疾病	0.0001528	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	表皮系统疾病	0.0006289	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	血液肿瘤	0.00292	信息量适中	继承
疾病本体（DO）	遗传病	0.03188	信息量适中	继承
疾病本体（DO）	神经退行性疾病	0.03351	信息量适中	继承
疾病本体（DO）	综合征	0.2779	信息量适中	继承
疾病本体（DO）	多发性硬化	0.0000000000006131	信息	直接
疾病本体（DO）	肝脏疾病	0.00000002503	信息	直接
疾病本体（DO）	川崎病	0.0000001129	信息	直接
疾病本体（DO）	血管炎	0.000001332	信息	直接
疾病本体（DO）	少毛症	0.00004805	信息	直接
疾病本体（DO）	出血性疾病	0.0003129	信息	直接
疾病本体（DO）	疾病	0.0003588	信息	直接
疾病本体（DO）	关节病	0.007326	信息	继承
疾病本体（DO）	大疱性皮肤病	0.01245	信息	继承
疾病本体（DO）	上呼吸道疾病	0.04475	信息	继承
疾病本体（DO）	眼病	0.06102	信息	继承
疾病本体（DO）	髓系白血病	0.06957	信息	继承
疾病本体（DO）	葡萄糖代谢病	1	信息	继承
疾病本体（DO）	格雷夫斯病	0.00000000007061	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	白塞病	0.00000005718	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	银屑病性关节炎	0.0000002171	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	镰状细胞性贫血	0.0000009922	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	脊椎炎	0.000008751	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	视神经脊髓炎	0.00001489	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	天疱疮	0.00001789	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	结节病	0.00002391	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	肝内胆汁淤积	0.00003804	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	血色病	0.0000627	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	血管止血病	0.00007335	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	葡萄膜炎	0.0001274	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	风湿热	0.0002952	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	甲状腺疾病	0.001791	高度信息化	继承
疾病本体（DO）	神经肌肉疾病	0.02601	高度信息化	继承

文件：SCOP域的DO注释

人类表型（HP）

(显示详细信息)

	HP术语	FDR（全部）	SDHP水平	注释（直接或继承）
继承模式（MI）	多因素遗传	0.00000000001956	信息	直接
继承模式（MI）	异构	0.0002301	信息	直接
表型异常（PA）	免疫系统异常	0.0002453	信息最少	直接
表型异常（PA）	表皮异常	0.02801	信息最少	继承
表型异常（PA）	代谢/体内平衡异常	0.08287	信息最少	继承
表型异常（PA）	骨骼形态异常	0.1864	信息最少	继承
表型异常（PA）	泌尿生殖系统异常	0.2059	信息最少	继承
表型异常（PA）	心血管系统异常	0.2349	信息最少	继承
表型异常（PA）	消化系统异常	0.3019	信息最少	继承
表型异常（PA）	神经系统形态异常	0.3456	信息最少	继承
表型异常（PA）	眼睛异常	0.3748	信息最少	继承
表型异常（PA）	神经系统生理异常	0.43	信息最少	继承
表型异常（PA）	面部异常	0.6524	信息最少	继承
表型异常（PA）	周围神经系统形态异常	0.00138	信息量适中	继承
表型异常（PA）	体内平衡异常	0.004863	信息量适中	继承
表型异常（PA）	腹部器官异常	0.008093	信息量适中	继承
表型异常（PA）	内分泌系统异常	0.0459	信息量适中	继承
表型异常（PA）	中枢运动功能异常	0.04926	信息量适中	继承
表型异常（PA）	血液和造血组织异常	0.05472	信息量适中	继承
表型异常（PA）	循环代谢物浓度异常	0.08271	信息量适中	继承
表型异常（PA）	消化系统生理异常	0.08367	信息量适中	继承
表型异常（PA）	胸部异常	0.08705	信息量适中	继承
表型异常（PA）	体重异常	0.09348	信息量适中	继承
表型异常（PA）	心脏形态异常	0.09501	信息量适中	继承
表型异常（PA）	局部皮肤损伤	0.1199	信息量适中	继承
表型异常（PA）	呼吸系统形态异常	0.1751	信息量适中	继承
表型异常（PA）	免疫系统生理异常	0.1921	信息量适中	继承
表型异常（PA）	皮肤附件形态异常	0.1945	信息量适中	继承
表型异常（PA）	血管形态异常	0.3385	信息量适中	继承
表型异常（PA）	眼部生理异常	0.3417	信息量适中	继承
表型异常（PA）	上尿路异常	0.5126	信息量适中	继承
表型异常（PA）	口腔形态异常	1	信息量适中	继承
表型异常（PA）	恶心和呕吐	0.00001564	信息	直接
表型异常（PA）	体重减轻	0.00002004	信息	直接
表型异常（PA）	皮肤生理异常	0.00004016	信息	直接
表型异常（PA）	眼部炎症异常	0.0001003	信息	直接
表型异常（PA）	周围神经病	0.0001083	信息	直接
表型异常（PA）	疼痛	0.0002786	信息	直接
表型异常（PA）	水肿	0.0003329	信息	直接
表型异常（PA）	解剖部位异常感染	0.0004303	信息	直接
表型异常（PA）	毛发数量异常	0.006967	信息	继承
表型异常（PA）	口炎	0.0114	信息	继承
表型异常（PA）	肾形态异常	0.1004	信息	继承
表型异常（PA）	循环蛋白水平异常	0.135	信息	继承
表型异常（PA）	功能性呼吸异常	0.2209	信息	继承
表型异常（PA）	关节痛	0.00000001575	高度信息化	直接
表型异常（PA）	胸膜异常	0.000001044	高度信息化	直接
表型异常（PA）	心包炎	0.000001183	高度信息化	直接
表型异常（PA）	脑膜炎	0.00001081	高度信息化	直接
表型异常（PA）	痰异常	0.00001364	高度信息化	直接
表型异常（PA）	肺浸润	0.00001613	高度信息化	直接
表型异常（PA）	脱发	0.00005389	高度信息化	直接
表型异常（PA）	复发性阿弗他口炎	0.00006268	高度信息化	直接
表型异常（PA）	肾小球病	0.00009615	高度信息化	直接
表型异常（PA）	咳嗽	0.0001358	高度信息化	直接
表型异常（PA）	胰腺生理异常	0.0001965	高度信息化	直接
表型异常（PA）	血沉异常	0.0002257	高度信息化	直接
表型异常（PA）	血管炎	0.0002636	高度信息化	直接
表型异常（PA）	C反应蛋白水平异常	0.0004726	高度信息化	直接
表型异常（PA）	尿崩症	0.0006282	高度信息化	直接
表型异常（PA）	胸痛	0.000703	高度信息化	直接
表型异常（PA）	皮肤溃疡	0.0007967	高度信息化	直接
表型异常（PA）	偏瘫/偏瘫	0.0009064	高度信息化	直接
表型异常（PA）	皮肤炎症异常	0.02214	高度信息化	继承

文件：SCOP域的HP注释

小鼠表型（MP）

(显示详细信息)

	MP术语	FDR（全部）	SDMP级别	注释（直接或继承）
哺乳动物表型（MP）	造血系统表型	0	信息最少	直接
哺乳动物表型（MP）	免疫系统表型	0.0000002058	信息最少	直接
哺乳动物表型（MP）	白细胞生理异常	0.000001892	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	T细胞形态异常	0.0000269	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	感染易感性的改变	0.00024	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	淋巴细胞数异常	0.07088	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	免疫血清蛋白生理异常	0.3979	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	异常的专业抗原呈递细胞生理学	0.6782	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	造血细胞数量减少	0.8044	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	抗原呈递异常	0.0001334	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	干扰素-γ分泌异常	0.0003966	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	自身免疫性疾病易感性的改变	0.0008009	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	CD8-阳性、α-βT细胞形态异常	0.08796	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	异常先天免疫	0.2007	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	异常α-βT细胞数	0.3207	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	T细胞数量减少	0.3284	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	T细胞生理异常	0.7924	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	细胞毒性T细胞生理异常	0.0005561	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	CD8-阳性、α-βT细胞数量减少	0.4561	高度信息化	继承

文件：SCOP域的MP注释

爪蟾解剖学（XA）

(显示详细信息)

	XA术语	FDR（全部）	SDXA级别	注释（直接或继承）
爪蟾非原子实体（XAN）	大旅行箱	0	信息最少	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	解剖簇	0	信息最少	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	消化系统	0	信息量适中	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	内脏	0.2607	信息量适中	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	胰腺	0.0003472	高度信息化	直接

文件：SCOP域的XA注释

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超级家庭级别	家庭层面

浏览此超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库用于超家族水平上所有基因组的外SCOP域分配。


超级家庭级别	家庭层面

序列对齐92种型号单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列的相同性小于40%默认情况下显示，但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列，或者粘贴或上传您自己的序列。

超级家庭级别

浏览和查看具有以下特征的基因组中的蛋白质不同的结构域组合包括MHC抗原再识别结构域。


超级家庭级别	家庭层面

检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象，即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。

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