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MHC抗原识别域超家族

根：	SUPERFAMILY中的SCOP层次结构[ 0] (11)
类别：	α和β蛋白（a+b）[ 53931] (376)
折叠：	MHC抗原识别域[ 54451]
超级家族:	MHC抗原识别域[ 54452]
家庭：	MHC抗原识别域[ 54453] (12)

超级家庭统计

	基因组学（93）	Uniprot 2018_03基因组	PDB链（SCOP1.75)
域	3,661	96,097	190
蛋白质	3,650	95,956	190

功能注释

一般类别	流程_EC
详细类别	免疫应答

文件：SCOP结构域超家族的功能注释

疾病本体（DO）

(显示详细信息)

	DO术语	FDR（全部）	SDDO级别	注释（直接或继承）
疾病本体（DO）	神经系统疾病	0.01629	信息最少	继承
疾病本体（DO）	器官系统癌	0.0776	信息最少	继承
疾病本体（DO）	过敏反应Ⅱ型疾病	0.00000002116	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	传染病	0.0000003932	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	代谢病	0.000001342	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	造血系统疾病	0.00001503	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	皮肤病	0.00002326	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	结缔组织病	0.00002566	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	胃肠系统疾病	0.0001805	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	血液肿瘤	0.003338	信息量适中	继承
疾病本体（DO）	内分泌系统疾病	0.006504	信息量适中	继承
疾病本体（DO）	遗传病	0.03828	信息量适中	继承
疾病本体（DO）	神经退行性疾病	0.04129	信息量适中	继承
疾病本体（DO）	综合征	0.2878	信息量适中	继承
疾病本体（DO）	感觉系统疾病	0.7136	信息量适中	继承
疾病本体论	多发性硬化	0.0000000000006221	信息	直接
疾病本体（DO）	肝脏疾病	0.00000002116	信息	直接
疾病本体（DO）	脱发	0.00003451	信息	直接
疾病本体（DO）	原发性细菌性传染病	0.00008117	信息	直接
疾病本体（DO）	出血性疾病	0.0003324	信息	直接
疾病本体（DO）	疾病	0.0005322	信息	直接
疾病本体（DO）	过敏性鼻炎	0.0007548	信息	直接
疾病本体（DO）	周围神经系统疾病	0.007535	信息	继承
疾病本体（DO）	关节病	0.008618	信息	继承
疾病本体（DO）	大疱性皮肤病	0.01667	信息	继承
疾病本体（DO）	过敏反应Ⅳ型疾病	0.03044	信息	继承
疾病本体（DO）	髓系白血病	0.0916	信息	继承
疾病本体（DO）	葡萄糖代谢病	1	信息	继承
疾病本体（DO）	格雷夫斯病	0.00000000005062	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	白塞病	0.00000004832	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	川崎病	0.0000001408	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	镰状细胞性贫血	0.000001921	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	天疱疮	0.00001996	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	结节病	0.00002806	高度信息化	直接
疾病本体论	肝内胆汁淤积	0.00005997	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	葡萄膜炎	0.0001366	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	金属代谢紊乱	0.001067	高度信息化	继承
疾病本体（DO）	神经肌肉疾病	0.03283	高度信息化	继承
疾病本体论	脊椎关节病	0.4777	高度信息化	继承

文件：SCOP域的DO注释

人类表型（HP）

(显示详细信息)

	HP术语	FDR（全部）	SDHP水平	注释（直接或继承）
继承模式（MI）	异构	0.0002273	信息	直接
继承模式（MI）	多因素遗传	0.00000000001268	高度信息化	直接
表型异常（PA）	表皮异常	0.03577	信息最少	继承
表型异常（PA）	代谢/体内平衡异常	0.09479	信息最少	继承
表型异常（PA）	骨骼形态异常	0.2251	信息最少	继承
表型异常（PA）	泌尿生殖系统异常	0.233	信息最少	继承
表型异常（PA）	心血管系统异常	0.2607	信息最少	继承
表型异常（PA）	消化系统异常	0.3293	信息最少	继承
表型异常（PA）	神经系统形态异常	0.3977	信息最少	继承
表型异常（PA）	眼睛异常	0.4211	信息最少	继承
表型异常（PA）	头部异常	0.49	信息最少	继承
表型异常（PA）	腹部器官异常	0.01093	信息量适中	继承
表型异常（PA）	血管系统异常	0.05373	信息量适中	继承
表型异常（PA）	内分泌系统异常	0.05404	信息量适中	继承
表型异常（PA）	消化系统生理异常	0.0984	信息量适中	继承
表型异常（PA）	循环代谢物浓度异常	0.102	信息量适中	继承
表型异常（PA）	呼吸系统异常	0.1584	信息量适中	继承
表型异常（PA）	免疫系统生理异常	0.2314	信息量适中	继承
表型异常（PA）	皮肤附件形态异常	0.2347	信息量适中	继承
表型异常（PA）	心血管系统形态异常	0.3589	信息量适中	继承
表型异常（PA）	眼部生理异常	0.3918	信息量适中	继承
表型异常（PA）	生长异常	0.4164	信息量适中	继承
表型异常（PA）	上尿路异常	0.5476	信息量适中	继承
表型异常（PA）	口腔形态异常	1	信息量适中	继承
表型异常（PA）	恶心和呕吐	0.00001997	信息	直接
表型异常（PA）	异常CNS感染	0.00006082	信息	直接
表型异常（PA）	眼部炎症异常	0.0001771	信息	直接
表型异常（PA）	周围神经病	0.000246	信息	直接
表型异常（PA）	水肿	0.0004445	信息	直接
表型异常（PA）	体质症状	0.004499	信息	继承
表型异常（PA）	毛发数量异常	0.01078	信息	继承
表型异常（PA）	口腔粘膜形态异常	0.03692	信息	继承
表型异常（PA）	体重减轻	0.05062	信息	继承
表型异常（PA）	胰腺异常	0.05188	信息	继承
表型异常（PA）	肺部形态异常	0.05413	信息	继承
表型异常（PA）	胸部异常	0.1045	信息	继承
表型异常（PA）	肾形态异常	0.1249	信息	继承
表型异常（PA）	功能性呼吸异常	0.2671	信息	继承
表型异常（PA）	关节痛	0.00000002295	高度信息化	直接
表型异常（PA）	腹痛	0.0000009914	高度信息化	直接
表型异常（PA）	胸膜异常	0.000001114	高度信息化	直接
表型异常（PA）	痰异常	0.00001566	高度信息化	直接
表型异常（PA）	脑膜炎	0.00002128	高度信息化	直接
表型异常（PA）	肺浸润	0.00002728	高度信息化	直接
表型异常（PA）	体重减轻	0.00002803	高度信息化	直接
表型异常（PA）	心包形态异常	0.00003305	高度信息化	直接
表型异常（PA）	复发性阿弗他口炎	0.00009758	高度信息化	直接
表型异常（PA）	血沉异常	0.0002635	高度信息化	直接
表型异常（PA）	血管炎	0.0005221	高度信息化	直接
表型异常（PA）	浆膜炎	0.0005873	高度信息化	直接
表型异常（PA）	尿崩症	0.0008123	高度信息化	直接
表型异常（PA）	皮肤炎症异常	0.0274	高度信息化	继承
表型异常（PA）	循环蛋白水平异常	0.1766	高度信息化	继承

文件：SCOP域的HP注释

小鼠表型（MP）

(显示详细信息)

	MP术语	FDR（全部）	SDMP级别	注释（直接或继承）
哺乳动物表型（MP）	造血系统表型	0	信息最少	直接
哺乳动物表型（MP）	免疫系统表型	0.0000002957	信息最少	直接
哺乳动物表型（MP）	白细胞生理异常	0.000002706	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	异常单核细胞形态	0.0006216	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	造血细胞数异常	0.3188	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	免疫血清蛋白生理异常	0.4349	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	异常的专业抗原呈递细胞生理学	0.698	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	B淋巴细胞抗原呈递异常	0.0001346	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	异常自然杀伤细胞介导的细胞毒性	0.0003109	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	干扰素分泌异常	0.001021	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	自身免疫反应	0.002675	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	效应器T细胞形态异常	0.1338	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	异常α-βT细胞形态	0.2026	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	T细胞数量减少	0.3787	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	T细胞生理异常	0.8213	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	细胞毒性T细胞生理异常	0.0007649	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	自身免疫性疾病易感性的改变	0.0009941	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	CD8-阳性、α-βT细胞形态异常	0.1096	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	α-βT细胞数量减少	0.2547	高度信息化	继承

文件：SCOP域的MP注释

爪蟾解剖学（XA）

(显示详细信息)

	XA术语	FDR（全部）	SDXA级别	注释（直接或继承）
爪蟾非原子实体（XAN）	大旅行箱	0	信息最少	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	消化系统	0	信息量适中	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	内脏	0.2717	信息量适中	继承
非洲爪蟾原子实体（XAN）	胰腺	0.000418	高度信息化	直接

文件：SCOP域的XA注释

InterPro注释

交叉引用 IPR011162型 SSF54452型蛋白质匹配

摘要
该条目表示来自以下来源的MHC类I和II类抗原再认知域：

MHC II类，α链和β链的N端结构域[9768757]

MHC I类、α-1和α-2结构域[15454423]

MHC I类相关蛋白，如γ-δT细胞配体[17291278]，Ultp3[12857997]，Fc（IgG）受体（α-1和-2结构域）[7969498]，CD1（α-1和-2域）[11677624]，锌-α-2-糖蛋白ZAG（脂肪消耗因子）[16475792]

免疫调节蛋白m144、α-1和α-2结构域[16500675]

血色素沉着症蛋白Hfe、α-1和α-2结构域[12667138]

NK细胞配体RAE-1β[12594837]

内皮蛋白C受体（磷脂结合蛋白）[17327234]

有关这些蛋白质的更多信息，请访问每月蛋白质：MHC。

InterPro数据库

关于配体、序列和结构基序的PDBeMotif信息

交叉引用	PDB条目配体结合统计核酸结合统计二级结构元素的出现小型三维结构图案的出现

PDBeMotif资源

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内部数据库链接

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序列对齐92种型号单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列一致性低于40%默认情况下显示，但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列，或者粘贴或上传您自己的序列。

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检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象，即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。

探索域发生网络，其中节点表示基因组，边缘是包含感兴趣超家族的域架构（基因组之间共享）。

有92个隐马尔可夫模型代表MHC抗原再认知域超家族。关于如何构建模型的信息，以及显示疏水性,匹配发射概率和插入/删除概率可以检查。

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