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2Fe-2S类铁氧还蛋白超家族

SCOP分类
根目录: SUPERFAMILY中的SCOP层次结构[ 0] (11)
类别: α和β蛋白(a+b)[ 53931] (376)
折叠: β-抓(泛素样)[ 54235] (14)
超级家族:   2Fe-2S类铁氧还蛋白[ 54292] (2)
家庭: 2Fe-2S铁氧还蛋白相关[ 54293] (3)
  来自多域蛋白的2Fe-2S铁氧还蛋白结构域[ 54312] (13)


超级家庭统计
基因组(2,892) Uniprot 2018_03基因组 PDB链(SCOP1.75)
20,940 163,762 57
蛋白质 20,917 163,672 57


功能注释
一般类别 新陈代谢
详细类别 氧化还原

文档:
SCOP域超家族的功能注释

酶委员会(EC)

(显示详细信息)
EC术语FDR(全部)SDEO水平注释(直接或继承)
酶委员会(EC)氧化还原酶类0信息最少直接
酶委员会(EC)代表CH-CH捐赠者小组0信息量适中直接
酶委员会(EC)作用于NADH或NADPH0信息量适中直接
酶委员会(EC)作用于供体的醛基或氧基0.03282信息量适中继承
酶委员会(EC)NADH:泛醌还原酶(H(+)转运)0信息直接
酶委员会(EC)与其他接受方0信息直接
酶委员会(EC)与其他接受方0.000000000005336信息直接
酶委员会(EC)作用于CH或CH(2)组0.000003125信息直接
酶委员会(EC)以NAD(+)或NADP(+)为受体1信息继承
酶委员会(EC)作为供体作用于铁硫蛋白0.008311信息继承
酶委员会(EC)以氧气为受体0高度信息化直接
酶委员会(EC)琥珀酸脱氢酶(泛醌)0高度信息化直接
酶委员会(EC)甲酸脱氢酶0高度信息化直接
酶委员会(EC)以NAD(+)或NADP(+)为受体0高度信息化直接
酶委员会(EC)以氧气为受体0.0000000001187高度信息化直接
酶委员会(EC)以NAD(+)或NADP(+)为受体0.0000000002174高度信息化直接
酶委员会(EC)琥珀酸脱氢酶0.0000000277高度信息化直接

文档:SCOP域的EC注释

疾病本体论

(显示详细信息)
DO术语FDR(全部)SDDO级别注释(直接或继承)
疾病本体论综合征0信息量适中直接

文档:SCOP域的DO注释

人类表型(HP)

(显示详细信息)
HP术语FDR(全部)SDHP水平注释(直接或继承)
表型异常(PA)代谢/体内平衡异常0信息最少直接
表型异常(PA)肌肉组织异常0信息最少直接
表型异常(PA)骨骼肌形态异常0信息量适中直接

文档:SCOP域的HP注释

小鼠表型(MP)

(显示详细信息)
MP术语FDR(全部)SDMP级别注释(直接或继承)
哺乳动物表型(MP)死亡率/老龄化0信息最少直接

文档:SCOP域的MP注释

蠕虫表型(WP)

(显示详细信息)
WP术语FDR(全部)SDWP水平注释(直接或继承)
蠕虫表型(WP)幼虫发育变异0信息最少直接
蠕虫表型(WP)幼虫生长变异体0信息最少直接

文档:SCOP域的WP注释

苍蝇表型(FP)

(显示详细信息) 文档:SCOP域的FP注释

飞行解剖学(FA)

(显示详细信息) 文档:SCOP域的FA注释

爪蟾解剖学(XA)

(显示详细信息)
XA术语FDR(全部)SDXA级别注释(直接或继承)
爪蟾非原子实体(XAN)泌尿生殖系统0信息最少直接
爪蟾非原子实体(XAN)0信息最少直接
爪蟾非原子实体(XAN)大旅行箱0信息最少直接
爪蟾非原子实体(XAN)空泡复合器官0信息最少直接
爪蟾非原子实体(XAN)睾丸0信息量适中直接

文档:SCOP域的XA注释

拟南芥植物本体(AP)

(显示详细信息)
AP术语FDR(全部)SDAP级别注释(直接或继承)
工厂结构开发阶段(PDE)幼苗发育阶段0.00005958信息直接
工厂结构开发阶段(PDE)0种子萌发期0.0001448信息直接

文档:SCOP域的AP注释

酶委员会(EC)

(显示详细信息)
EC术语FDR(全部)SDEC级注释(直接或继承)
酶委员会(EC)氧化还原酶类0信息最少直接
酶委员会(EC)作用于CH或CH(2)组0.0000000003217信息直接
酶委员会(EC)作用于NADH或NADPH0.00000008995信息直接
酶委员会(EC)作用于供体的醛基或氧基0.00184信息继承
酶委员会(EC)作用于成对供体,结合或还原分子氧。氧气混合物0.4088信息继承
酶委员会(EC)催化氢的转移1信息丰富继承
酶委员会(EC)以氧气为受体0高度信息化直接
酶委员会(EC)以醌或相关化合物为受体0高度信息化直接
酶委员会(EC)NADH脱氢酶0高度信息化直接
酶委员会(EC)NADH:泛醌还原酶(H(+)转运)0高度信息化直接
酶委员会(EC)以氧气为受体0.0000000003285高度信息化直接
酶委员会(EC)以NAD(+)或NADP(+)为受体0.0000001055高度信息化直接
酶委员会(EC)与其他接受方0.000000555高度信息化直接
酶委员会(EC)作为供体作用于铁硫蛋白0.00008247高度信息化直接
酶委员会(EC)以NADH或NADPH为一个供体,并加入一个氧原子0.0004476高度信息化直接
酶委员会(EC)作为供体作用于氢0.0006029高度信息化直接
酶委员会(EC)还原铁硫蛋白作为一个供体,并加入一个氧原子0.002995高度信息化继承

文档:SCOP域的EC注释

InterPro注释
交叉引用 IPR001041型 SSF54292号 蛋白质匹配
摘要

铁氧还蛋白家族是带有铁硫辅因子的电子载体蛋白,在多种代谢反应中起作用。铁氧还蛋白可根据铁硫簇的生理性质和序列相似性分为几个亚类。

该条目代表2Fe-2S铁氧还蛋白家族成员,其一般核心结构由β(2)-α-β(2[公共医学11173487,公共医学15755454,公共医学10220356,公共医学12069587]. 它们是由大约一百个氨基酸组成的蛋白质,具有四个保守的半胱氨酸残基,2Fe-2S簇与之连接。这个保守区域也被发现是各种代谢酶和多域蛋白中的一个结构域,例如醛氧化还原酶(N端)、黄嘌呤氧化酶(N端。


InterPro数据库


关于配体、序列和结构基序的PDBeMotif信息
交叉引用 PDB条目
配体结合统计
核酸结合统计
二级结构元素的出现
小型三维结构图案的出现

PDBeMotif资源

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内部数据库链接

浏览此超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库已被用于携带超家族水平上所有基因组的外SCOP域分配。


序列对齐61种型号单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列一致性低于40%默认情况下显示,但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列,或粘贴或上传您自己的序列。


浏览和查看具有以下特征的基因组中的蛋白质不同的结构域组合包括2Fe-2S类铁氧还蛋白结构域。


检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象,即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。


探索域发生网络,其中节点表示基因组,边缘是包含感兴趣超家族的域架构(基因组之间共享)。

有61个隐马尔可夫模型代表2Fe-2S类铁氧还蛋白超家族。关于如何构建模型的信息,以及显示疏水性,匹配发射概率插入/删除概率可以进行检查。


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