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主页>SCOP层次结构>2Fe-2S类铁氧还蛋白超家族
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InterPro注释
铁氧还蛋白家族是带有铁硫辅因子的电子载体蛋白,在多种代谢反应中起作用。铁氧还蛋白可根据铁硫簇的生理性质和序列相似性分为几个亚类。
该条目代表2Fe-2S铁氧还蛋白家族成员,其一般核心结构由β(2)-α-β(2[11173487,15755454,10220356,12069587]. 它们是由大约一百个氨基酸组成的蛋白质,具有四个保守的半胱氨酸残基,2Fe-2S簇与之连接。这个保守区域也被发现是各种代谢酶和多域蛋白中的一个结构域,例如醛氧化还原酶(N端)、黄嘌呤氧化酶(N端。
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浏览此超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库已被用于携带超家族水平上所有基因组的外SCOP域分配。
序列对齐61种型号单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列一致性低于40%默认情况下显示,但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列,或粘贴或上传您自己的序列。
浏览和查看具有以下特征的基因组中的蛋白质不同的结构域组合包括2Fe-2S类铁氧还蛋白结构域。
检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象,即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。
探索域发生网络,其中节点表示基因组,边缘是包含感兴趣超家族的域架构(基因组之间共享)。
有61个隐马尔可夫模型代表2Fe-2S类铁氧还蛋白超家族。关于如何构建模型的信息,以及显示疏水性,匹配发射概率和插入/删除概率可以进行检查。
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