SUPERFAMILY 1.75 HMM库和基因组分配服务器

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MoaD/ThiS超家族

SCOP分类
根目录: SUPERFAMILY中的SCOP层次结构[ 0] (11)
类别: α和β蛋白(a+b)[ 53931] (376)
折叠: β-抓(泛素样)[ 54235] (14)
超级家族:   摩押/提斯[ 54285] (4)
家庭: 护城河[ 54286] (2)
  ThiS公司[ 54289] (4)
  C9orf74同源物[ 117833]
  HI0395类[ 159931]


超级家庭统计
基因组(2,507) Uniprot 2018_03基因组 PDB链(SCOP1.75)
5,966 45,749 12
蛋白质 5,966 45,746 12


功能注释
一般类别 其他
详细类别 未知函数

文档:
SCOP域超家族的功能注释

拟南芥植物本体(AP)

(显示详细信息)
AP术语FDR(全部)SDAP级别注释(直接或继承)
植物非原子实体(PAN)保护电池0信息最少直接

文档:SCOP域的AP注释

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内部数据库链接

浏览此超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库用于超家族水平上所有基因组的外SCOP域分配。


序列对齐12种型号单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列一致性低于40%默认情况下显示,但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列,或者粘贴或上传您自己的序列。


浏览和查看具有以下特征的基因组中的蛋白质不同的域组合,包括MoaD/ThiS域。


检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象,即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。


探索域发生网络,其中节点代表基因组,边缘是包含感兴趣的超家族的域架构(在基因组之间共享)。

有12个隐马尔可夫模型代表MoaD/ThiS超家族。关于如何构建模型的信息,以及显示疏水性,匹配发射概率插入/删除概率可以检查。


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