SUPERFAMILY 1.75 HMM库和基因组分配服务器

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TTHC002类超家族

SCOP分类
根目录: SUPERFAMILY中的SCOP层次结构[ 0] (11)
类别: α和β蛋白(a+b)[ 53931] (376)
折叠: TTHC002类[ 160760]
超级家族:   TTHC002类[ 160761]
家庭: TTHC002类[ 160762]


超级家庭统计
基因组(1) Uniprot 2018_03基因组 PDB链(SCOP1.75)
2 19 1
蛋白质 2 19 1


功能注释
文档:
SCOP域超家族的功能注释

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内部数据库链接

浏览此超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库用于超家族水平上所有基因组的外SCOP域分配。


序列对齐1个型号单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列一致性低于40%默认情况下显示,但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列,或者粘贴或上传您自己的序列。


浏览和查看具有以下特征的基因组中的蛋白质包括TTHC002样结构域的不同结构域组合。


检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象,即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。


探索域发生网络,其中节点代表基因组,边缘是包含感兴趣的超家族的域架构(在基因组之间共享)。

有1个隐马尔可夫模型表示类TTHC002超家族。关于如何构建模型的信息,以及显示疏水性,匹配发射概率插入/删除概率可以检查。


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