|
斑马鱼解剖学(ZA):解剖学组(显示信息)
表型本体与基因本体论(GO)一样,表型本体论通过将单个术语视为节点及其与父项(允许多个父项)的关系视为有向边,将基因突变/空表型信息从顶部非常一般的术语分类并组织到有向无环图(DAG)中更具体的术语。要导航此层次结构,我们显示所有亲本表型项按与当前项的最短距离排序的当前感兴趣的表型项。也,仅直接儿童表型术语列出了当前表型术语的。我们纳入的表型本体如下:
- 疾病本体(DO)DO通过DO术语到MeSH、ICD、NCI同义词库、SNOMED和OMIM的广泛交叉映射,在语义上整合了疾病和医学词汇。
- 人类表型(HP)本体(HP)HP捕获OMIM中描述的表型异常,以及相应的致病基因。它包括三个互补的生物学概念:遗传模式(MI)、ONset_and_clinical_course(ON)和表型异常(PA)。
- 小鼠表型(MP)本体(MP)MP描述了特定基因被基因破坏后小鼠的表型。利用它,小鼠基因组信息学(MGI)为小鼠提供了高覆盖率的基因水平表型。
- 蠕虫表型本体WP对秀丽线虫和其他线虫的表型描述进行分类和组织。使用它,WormBase为秀丽线虫的表型注释提供了主要资源。
- 酵母表型本体酵母基因组数据库(SGD)基于YP,YP是子囊菌表型本体的主要贡献者,为酵母基因组中的每个基因提供单一突变表型。
- 苍蝇表型本体FP指FlyBase控制的词汇表。具体来说,FlyBase中的等位基因注释(针对其诱变剂等)使用结构化受控词汇。
- 蝇类解剖本体FA是黑腹果蝇解剖结构的结构化受控词汇,用于描述表型和基因表达的位置。
- 斑马鱼解剖学本体ZA使用标准解剖学命名法显示斑马鱼的解剖学术语,以及受影响的基因。
- 爪蟾解剖学本体XA代表青蛙(非洲爪蟾和热带爪蟾)的组织谱系和发育时间。它用于注释爪蟾基因表达模式以及突变和变体表型。
- 拟南芥植物本体(AP)作为描述植物解剖和形态结构(AN)以及生长发育阶段(DE)的植物本体论的主要贡献者,拟南芥信息资源(TAIR)为模型高等植物拟南芥提供了拟南芥植物本体论注释。
- 酶委员会(EC)本体(EC)每个酶都有一个四位数的EC编号,前三位数定义了催化的反应,第四位数是唯一的标识符(序列号)。每种酶都有一个系统名称,唯一地定义了所催化的反应。
- DrugBank ATC(DB)本体(DB)在解剖治疗化学(ATC)分类系统中,药物根据其作用的器官或系统(第一级,解剖主要组)及其治疗(第二级,治疗亚组)、药理(第三级,药理亚组)分为五个不同级别的组和化学性质(第4级,化学亚组;第5级,化学物质)。只考虑DrugBank中的药物。
- UniProtKB关键字(KW)本体UniProtKB中的关键字是受控词汇表,提供条目内容的摘要,并用于基于10个类别(此处不包括“技术术语”类别)索引UniProtKB/Swiss-Prot条目。每个关键字都手动归属于UniProtKB/Swiss-Prot条目,并自动归属于UniProtKB/TrEMBL条目(根据特定的注释规则)。
- UniProtKB UniPathway(UP)本体UP是一个完全手动管理的资源,用于表示和注释代谢途径,在UniProtKB中用作路径注释的受控词汇。
结构域表型本体及其注释蛋白质结构分类(SCOP)将进化相关域划分为超级家族水平和家庭级别。使用上述表型本体,我们生成了以结构域为中心的表型注释,并进一步确定了那些对SCOP结构域注释信息最多的表型术语。令人欣慰的是,以域为中心的表型注释可以作为探索基因型-表型关系的另一个起点。我们为下载提供了几个相关文件,包括每个表型本体的注释和相应的本体。
超域表型本体及其注释虽然以域为中心的注释在描述独立域的表型性质方面有很大的希望,但大多数域本身可能不只是单独工作。在多域蛋白质中,它们可以结合在一起形成不同的域结构。现有结构域的重组被认为是表型多样性的主要驱动力之一。作为扩展,我们还生成了超域表型本体及其注释。与以域为中心的表型本体论和注释(SCOP域超级家族水平和家庭级别),此版本仅关注超域和单个SCOP域超级家族级别。此外,就单个超家族而言,以域为中心版本的注释可能与超域版本的注释不同。根据您的关注点,前者应用于考虑超级家族水平和家庭级别,否则,如果您对域组合感兴趣,应使用后者。此外,我们还为下载提供了几个相关文件,包括每个表型本体的注释和相应的本体。
跳转到[顶部·表型层次·超级家族·家庭·超域]
根:ZA层次(ZFIN斑马鱼解剖本体中的斑马鱼解剖学)
跳转到[顶部·表型层次·超级家族·家庭·超域]
超级家族(显示详细信息)
本ZA术语注释的超家族域(不在SDZA中)
以灰色突出显示的是FDR_all>0.001的那些
跳转到[顶部·表型层次·超级家族·家庭·超域]
家庭(显示详细信息)
本ZA术语注释的家族域(不在SDZA中)
以灰色突出显示的是FDR_all>0.001的那些
在系统发育树上为超级家族和/或家庭由该表型术语注释的域
|
将树绘制为:
| | 下载Newick格式树:
|
(显示帮助)
树木依据树向量
使用蛋白质域生成存在/缺失矩阵超级家族中所有基因组的结构数据。这个PAUP公司软件用于使用启发式简约方法。基因组组合或特定分支可以显示为如果有单株树的话。然而,该数据是从单个大树。这会产生比生成树时更高质量的拓扑并允许树立即显示。
跳转到[顶部·表型层次·超级家族·家庭·超域]
超域(包括单个超家族)(显示详细信息)
本ZA术语注释的超域(不在SPZA中)
以灰色突出显示的是FDR>0.001的那些
(显示详细信息)
注释到此ZA术语的Supra域(不在SPZA中)
以灰色突出显示的是FDR>0.001的那些
N到C端子顺序的超域(双工) |
FDR(全部) |
注释(直接或继承) |
54236,54236 54236 -类泛素 54236 -类泛素 | 0 | 直接 |
101912,103575 101912 -Sema域 103575 -Plexin重复 | 0 | 直接 |
57424,57424 57424 -LDL受体样模块 57424 -LDL受体样模块 | 0 | 直接 |
55486,50923 55486 -金属蛋白酶(“锌蛋白”),催化域 50923 -血红素样结构域 | 0 | 直接 |
55550,55550 55550 -SH2域 55550 -SH2域 | 0 | 直接 |
57440,57440 57440 -类似Kringle 57440 -类似Kringle | 0 | 直接 |
69179,69179 69179 -整合素域 69179 -整合素域 | 0 | 直接 |
52374,47323 52374 -核苷酸酰转移酶 47323 -I类氨酰-tRNA合成酶亚类的反密码子结合域 | 0 | 直接 |
55550,50044 55550 -SH2域 50044 -SH3-域 | 0 | 直接 |
50044,50044 50044 -SH3-域 50044 -SH3-域 | 0 | 直接 |
48425,50729 48425 -Sec7域 50729 -PH类域 | 0 | 直接 |
52058,57184 52058 -L类域名 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
49417,55550 49417 -p53类转录因子 55550 -SH2域 | 0 | 直接 |
49562,49562 49562 -C2结构域(钙/脂质结合结构域,CaLB) 49562 -C2结构域(钙/脂质结合结构域,CaLB) | 0 | 直接 |
47413,46689 47413 -lambda阻遏物样DNA结合域 46689 -类家畜 | 0 | 直接 |
101288,50156 101288 -L27域 50156 -PDZ域类 | 0 | 直接 |
52058,49265 52058 -L类域名 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0 | 直接 |
54160,54160 54160 -类色度域 54160 -类色度域 | 0 | 直接 |
54001,49758 54001 -半胱氨酸蛋白酶 49758 -钙蛋白酶大亚单位,中间结构域(结构域III) | 0 | 直接 |
56968,48431 56968个-脂蛋白球蛋白复合物;β-薄片壳区域 48431 -脂蛋白-磷蛋白复合物,超羟基结构域 | 0 | 直接 |
89837,89837 89837 -双皮质激素(DC) 89837 -双皮质激素(DC) | 0 | 直接 |
56784,81665 56784个-类似HAD 81665 -钙ATP酶,跨膜结构域M | 0 | 直接 |
81324,81324 81324 -电压门控钾通道 81324 -电压门控钾通道 | 0 | 直接 |
69318,69179 69318 -整合素αN末端结构域 69179 -整合素域 | 0 | 直接 |
90257,90257 90257 -肌球蛋白棒碎片 90257 -肌球蛋白棒碎片 | 0 | 直接 |
49785,57184 49785 -半乳糖结合域样 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
57586,57586 57586 -TNF受体样 57586 -TNF受体样 | 0 | 直接 |
52777,52777 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0 | 直接 |
46966,47473 46966 -Spectrin重复 47473 -结构域 | 0 | 直接 |
56112,56112 56112 -蛋白激酶样(PK-like) 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
47459,158457 47459 -HLH,螺旋-环-螺旋DNA-结合域 158457 -橙色domain-like | 0 | 直接 |
103575,81296 103575 -Plexin重复 81296 -E集合域 | 0 | 直接 |
50729,47473 50729 -PH类域 47473 -结构域 | 0 | 直接 |
47986,52129 47986 -死亡域 52129 -类半胱氨酸天冬氨酸 | 0 | 直接 |
63380,52343 63380 -核黄素合酶域样 52343 -铁氧还蛋白还原酶样,C末端NADP-连接域 | 0 | 直接 |
49562,48350 49562 -C2结构域(钙/脂质结合结构域,CaLB) 48350 -GTPase激活域 | 0 | 直接 |
48092,47655 48092 -转录因子STAT-4 N域 47655 -斯达 | 0 | 直接 |
111418,81321 111418 -激素受体域 81321 -家族A G蛋白偶联受体样 | 0 | 直接 |
57184,52058 57184 -生长因子受体结构域 52058 -L类域名 | 0 | 直接 |
49854,49785 49854 -精粘连蛋白,CUB域 49785 -半乳糖结合域样 | 0 | 直接 |
82199,57667 82199 -SET域 57667 -β-β-α锌指 | 0 | 直接 |
54236,47031 54236 -类泛素 47031个-FERM的第二域 | 0 | 直接 |
51905,54373 51905 -FAD/NAD(P)-结合域 54373 -FAD-连接还原酶,C末端结构域 | 0 | 直接 |
90193,90193 90193 -陷波域 90193 -陷波域 | 0 | 直接 |
47473,51695 47473 -结构域 51695 -类PLC磷酸二酯酶 | 0 | 直接 |
57196,49854 57196 -EGF/层粘连蛋白 49854 -精粘连蛋白,CUB域 | 0 | 直接 |
50044,55550 50044 -SH3-域 55550 -SH2域 | 0 | 直接 |
57362,57362 57362个-类似BPTI 57362个-类似BPTI | 0 | 直接 |
46785,46785 46785 -“翼螺旋”DNA-结合域 46785 -“翼螺旋”DNA-结合域 | 0 | 直接 |
47454,57959 47454 -真核转录因子中的DNA结合域 57959 -亮氨酸拉链域 | 0 | 直接 |
57196,63825 57196 -EGF/层粘连蛋白 63825 -YWTD域 | 0 | 直接 |
141072,141072 141072 -类CalX 141072 -类CalX | 0 | 直接 |
52058,52058 52058 -L类域名 52058 -L类域名 | 0 | 直接 |
55550,56112 55550 -SH2域 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
49785,49899 49785 -半乳糖结合域样 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
63712,90112 63712 -烟碱受体配体结合域样 90112 -神经递质门控离子通道跨膜孔 | 0 | 直接 |
57184,57184 57184 -生长因子受体结构域 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
53067,53067 53067 -类肌动蛋白ATP酶结构域 53067 -类肌动蛋白ATP酶结构域 | 0 | 直接 |
57196,49899 57196 -EGF/层粘连蛋白 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
82895,82895 82895 -TSP-1 1型重复 82895 -TSP-1 1型重复 | 0 | 直接 |
56436,56436 56436 -C型凝集素样 56436 -C型凝集素样 | 0 | 直接 |
49265,48726 49265 -纤维连接蛋白III型 48726 -免疫球蛋白 | 0 | 直接 |
53067,100920 53067 -类肌动蛋白ATP酶结构域 100920 -热休克蛋白70kD(HSP70),肽结合域 | 0 | 直接 |
81660,56784 81660 -金属阳离子转运ATP酶,ATP结合域N 56784个-类似HAD | 0 | 直接 |
57184,57603 57184 -生长因子受体结构域 57603 -类FnI域 | 0 | 直接 |
48371,56112 48371 -ARM重复 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
81296,81296 81296 -E集合域 81296 -E集合域 | 0 | 直接 |
57196,57184 57196 -EGF/层粘连蛋白 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
49417,81296 49417 -p53类转录因子 81296 -E集合域 | 0 | 直接 |
54001,143791 54001 -半胱氨酸蛋白酶 143791 -类DUSP | 0 | 直接 |
50044,52540 50044 -SH3-域 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
50978,50998 50978 -WD40重复 50998个-奎诺蛋白醇脱氢酶类 | 0 | 直接 |
50156,50044 50156 -PDZ域类 50044 -SH3-域 | 0 | 直接 |
49562,48371 49562 -C2结构域(钙/脂质结合结构域,CaLB) 48371 -ARM重复 | 0 | 直接 |
47090,55486 47090 -类PGBD 55486 -金属蛋白酶(“锌蛋白”),催化域 | 0 | 直接 |
49265,49899 49265 -纤维连接蛋白III型 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
54791,54791 54791 -真核型KH-结构域(KH-域I型) 54791 -真核型KH-结构域(KH-域I型) | 0 | 直接 |
100909,49899 100909 -IP3受体1型结合核心,结构域2 49899人-伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
75399,75399 75399 -Plakin重复 75399 -Plakin重复 | 0 | 直接 |
52743,49785 52743 -类枯草杆菌 49785 -半乳糖结合域样 | 0 | 直接 |
50447,50465 50447 -翻译蛋白 50465 -EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C末端结构域 | 0 | 直接 |
81324,81296 81324 -电压门控钾通道 81296 -E集合域 | 0 | 直接 |
54585,52540 54585 -Cdc48域2-类 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
57603,57603 57603 -类FnI域 57603 -类FnI域 | 0 | 直接 |
52540,50447 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 50447 -翻译蛋白 | 0 | 直接 |
51556,51338 51556 -金属依赖性水解酶 51338 -金属依赖水解酶的复合结构域 | 0 | 直接 |
47954,47954 47954 -类周期蛋白 47954 -类周期蛋白 | 0 | 直接 |
54897,52743 54897 -蛋白酶前肽/抑制剂 52743 -类枯草杆菌 | 0 | 直接 |
55753,55753 55753 -肌动蛋白解聚蛋白 55753 -肌动蛋白解聚蛋白 | 0 | 直接 |
90257,57997 90257 -肌球蛋白棒碎片 57997 -原肌球蛋白 | 0 | 直接 |
63825,57196 63825 -YWTD域 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
52799,49562 52799 -(磷酸酪氨酸蛋白)磷酸酶Ⅱ 49562 -C2结构域(钙/脂质结合结构域,CaLB) | 0 | 直接 |
48097,56112 48097 -G蛋白信号调节器 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
49899,57196 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
57196,90193 57196 -EGF/层粘连蛋白 90193 -陷波域 | 0 | 直接 |
82109,82109 82109 -MIR域 82109 -MIR域 | 0 | 直接 |
49854,57196 49854 -精粘连蛋白,CUB域 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
50692,54585 50692 -类似ADC 54585 -Cdc48域2-类 | 0 | 直接 |
52833,47616 52833 -类硫氧还蛋白 47616 -GST C终端域类 | 0 | 直接 |
82153,82153 82153 -FAS1域 82153 -FAS1域 | 0 | 直接 |
57850,57850 57850 -环/U形盒 57850 -环/U形盒 | 0 | 直接 |
52490,55307 52490 -管蛋白核苷酸结合域样 55307 -Tubulin C末端domain-like | 0 | 直接 |
57903,57903 57903 -FYVE/PHD锌指 57903 -FYVE/PHD锌指 | 0 | 直接 |
50729,56112 50729 -PH类域 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
49758,47473 49758 -钙蛋白酶大亚单位,中间结构域(结构域III) 47473 -结构域 | 0 | 直接 |
56112,47769 56112 -蛋白激酶样(PK-like) 47769 -SAM/指向域 | 0 | 直接 |
47655,49417 47655 -斯达 49417 -p53类转录因子 | 0 | 直接 |
49785,49785 49785 -半乳糖结合域样 49785 -半乳糖结合域样 | 0 | 直接 |
48371,48371 48371 -ARM重复 48371 -ARM重复 | 0 | 直接 |
49899,49899 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
103575,48726 103575 -Plexin重复 48726 -免疫球蛋白 | 0 | 直接 |
54160,52540 54160 -类色度域 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
48726,48726 48726 -免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 | 0.0319 | 继承自:白质||内侧纵束||脑回 |
57196,57196 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0.06893 | 继承自:侧线神经节||血管系统||淋巴管||淋巴系统||后侧线神经节||脉管系统 |
57716,57716 57716 -糖皮质激素受体样(DNA-结合域) 57716 -糖皮质激素受体样(DNA-结合域) | 0.1454 | 继承自:面纱||心||心室||Kolmer-Agduhr神经元 |
48726,49265 48726 -免疫球蛋白 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0.24 | 继承自:白质||内侧纵束||脑干||脑细胞核||脑回 |
48065,50729 48065 -DBL同源域(DH-domain) 50729 -PH类域 | 0.4516 | 继承自:血管内皮||血管内皮细胞||血管内皮 |
49265,49265 49265 -纤维连接蛋白III型 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0.4536 | 继承自:头肾 |
54849,52029 54849 -类似GroEL的中间领域 52029 -GroEL顶端域样 | 0.6393 | 继承自:骨骼肌||肌肉系统||骨骼肌细胞||肌肉细胞||肌节||横纹肌细胞||躯干肌肉组织 |
48592,54849 48592 -GroEL赤道域状 54849 -类似GroEL的中间领域 | 0.6393 | 继承自:骨骼肌||肌肉系统||骨骼肌细胞||肌肉细胞||肌刀||横纹肌细胞||躯干肌肉组织 |
49313,49313 49313 -类钙粘蛋白 49313 -类钙粘蛋白 | 0.656 | 继承自:间脑白质||白质||神经||颅神经II||视顶盖||颅神经||视网膜神经节细胞层 |
53300,53300 53300 -vWA类 53300 -vWA类 | 0.6844 | 继承自:肌刀||躯干肌肉组织 |
48452,48452 48452 -类似TPR 48452 -类似TPR | 0.7102 | 继承自:肾系统||前肾 |
57667,57667 57667 -β-β-α锌指 57667 -β-β-α锌指 | 0.7263 | 继承自:丘脑||腹侧丘脑 |
55021,56534 55021 -类ACT 56534 -芳香氨基酸单加氧酶,催化和齐聚域 | 0.7315 | 继承自:背主动脉腹壁||轴向血管||动脉||背主动脉 |
82109,100909 82109 -MIR域 100909 -IP3受体1型结合核心,结构域2 | 0.7831 | 继承自:骨骼肌||骨骼肌细胞||肌肉细胞||横纹肌细胞 |
50156,50156 50156 -PDZ域类 50156 -PDZ域类 | 0.8576 | 继承自:视网膜外核层||眼睛感光细胞 |
N到C端子顺序的超域(双工) |
FDR(全部) |
注释(直接或继承) |
54236,54236 54236 -类泛素 54236 -类泛素 | 0 | 直接 |
101912,103575 101912 -Sema域 103575 -Plexin重复 | 0 | 直接 |
57424,57424 57424 -LDL受体样模块 57424 -LDL受体样模块 | 0 | 直接 |
55486,50923 55486 -金属蛋白酶(“锌蛋白”),催化域 50923 -血红素样结构域 | 0 | 直接 |
55550,55550 55550 -SH2域 55550 -SH2域 | 0 | 直接 |
57440,57440 57440 -类似Kringle 57440 -类似Kringle | 0 | 直接 |
69179,69179 69179 -整合素域 69179 -整合素域 | 0 | 直接 |
52374,47323 52374 -核苷酸酰转移酶 47323 -I类氨酰-tRNA合成酶亚类的反密码子结合域 | 0 | 直接 |
55550,50044 55550 -SH2域 50044 -SH3-域 | 0 | 直接 |
50044,50044 50044 -SH3-域 50044 -SH3-域 | 0 | 直接 |
48425,50729 48425 -Sec7域 50729 -PH类域 | 0 | 直接 |
52058,57184 52058 -L类域名 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
49417,55550 49417 -p53类转录因子 55550 -SH2域 | 0 | 直接 |
49562,49562 49562 -C2结构域(钙/脂质结合结构域,CaLB) 49562 -C2结构域(钙/脂质结合结构域,CaLB) | 0 | 直接 |
47413,46689 47413 -lambda阻遏物样DNA结合域 46689 -类家畜 | 0 | 直接 |
101288,50156 101288 -L27域 50156 -PDZ域类 | 0 | 直接 |
52058,49265 52058 -L类域名 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0 | 直接 |
54160,54160 54160 -类色度域 54160 -类色度域 | 0 | 直接 |
54001,49758 54001 -半胱氨酸蛋白酶 49758 -钙蛋白酶大亚单位,中间结构域(结构域III) | 0 | 直接 |
56968,48431 56968个-脂蛋白球蛋白复合物;β-薄片壳区域 48431 -脂蛋白-磷蛋白复合物,超羟基结构域 | 0 | 直接 |
89837,89837 89837 -双皮质激素(DC) 89837 -双皮质激素(DC) | 0 | 直接 |
56784,81665 56784个-类似HAD 81665 -钙ATP酶,跨膜结构域M | 0 | 直接 |
81324,81324 81324 -电压门控钾通道 81324 -电压门控钾通道 | 0 | 直接 |
69318,69179 69318 -整合素αN末端结构域 69179 -整合素域 | 0 | 直接 |
90257,90257 90257 -肌球蛋白棒碎片 90257 -肌球蛋白棒碎片 | 0 | 直接 |
49785,57184 49785 -半乳糖结合域样 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
57586,57586 57586 -TNF受体样 57586 -TNF受体样 | 0 | 直接 |
52777,52777 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0 | 直接 |
46966,47473 46966 -Spectrin重复 47473 -结构域 | 0 | 直接 |
56112,56112 56112 -蛋白激酶样(PK-like) 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
47459,158457 47459 -HLH,螺旋-环-螺旋DNA-结合域 158457 -橙色domain-like | 0 | 直接 |
103575,81296 103575 -Plexin重复 81296 -E集合域 | 0 | 直接 |
50729,47473 50729 -PH类域 47473 -结构域 | 0 | 直接 |
47986,52129 47986 -死亡域 52129 -类半胱氨酸天冬氨酸 | 0 | 直接 |
63380,52343 63380 -核黄素合酶域样 52343 -铁氧还蛋白还原酶样,C末端NADP-连接域 | 0 | 直接 |
49562,48350 49562 -C2结构域(钙/脂质结合结构域,CaLB) 48350 -GTPase激活域 | 0 | 直接 |
48092,47655 48092 -转录因子STAT-4 N域 47655 -斯达 | 0 | 直接 |
111418,81321 111418 -激素受体域 81321 -家族A G蛋白偶联受体样 | 0 | 直接 |
57184,52058 57184 -生长因子受体结构域 52058 -L类域名 | 0 | 直接 |
49854,49785 49854 -精粘连蛋白,CUB域 49785 -半乳糖结合域样 | 0 | 直接 |
82199,57667 82199 -SET域 57667 -β-β-α锌指 | 0 | 直接 |
54236,47031 54236 -类泛素 47031个-FERM的第二域 | 0 | 直接 |
51905,54373 51905 -FAD/NAD(P)-结合域 54373 -FAD-连接还原酶,C末端结构域 | 0 | 直接 |
90193,90193 90193 -陷波域 90193 -陷波域 | 0 | 直接 |
47473,51695 47473 -结构域 51695 -类PLC磷酸二酯酶 | 0 | 直接 |
57196,49854 57196 -EGF/层粘连蛋白 49854 -精粘连蛋白,CUB域 | 0 | 直接 |
50044,55550 50044 -SH3-域 55550 -SH2域 | 0 | 直接 |
57362,57362 57362个-类似BPTI 57362个-类似BPTI | 0 | 直接 |
46785,46785 46785 -“翼螺旋”DNA-结合域 46785 -“翼螺旋”DNA-结合域 | 0 | 直接 |
47454,57959 47454 -真核转录因子中的DNA结合域 57959 -亮氨酸拉链域 | 0 | 直接 |
57196,63825 57196 -EGF/层粘连蛋白 63825 -YWTD域 | 0 | 直接 |
141072,141072 141072 -类CalX 141072 -类CalX | 0 | 直接 |
52058,52058 52058 -L类域名 52058 -L类域名 | 0 | 直接 |
55550,56112 55550 -SH2域 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
49785,49899 49785 -半乳糖结合域样 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
63712,90112 63712 -烟碱受体配体结合域样 90112 -神经递质门控离子通道跨膜孔 | 0 | 直接 |
57184,57184 57184 -生长因子受体结构域 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
53067,53067 53067 -类肌动蛋白ATP酶结构域 53067 -类肌动蛋白ATP酶结构域 | 0 | 直接 |
57196,49899 57196 -EGF/层粘连蛋白 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
82895,82895 82895 -TSP-1 1型重复 82895 -TSP-1 1型重复 | 0 | 直接 |
56436,56436 56436 -C型凝集素样 56436 -C型凝集素样 | 0 | 直接 |
49265,48726 49265 -纤维连接蛋白III型 48726 -免疫球蛋白 | 0 | 直接 |
53067,100920 53067 -类肌动蛋白ATP酶结构域 100920 -热休克蛋白70kD(HSP70),肽结合域 | 0 | 直接 |
81660,56784 81660 -金属阳离子转运ATP酶,ATP结合域N 56784个-类似HAD | 0 | 直接 |
57184,57603 57184 -生长因子受体结构域 57603 -类FnI域 | 0 | 直接 |
48371,56112 48371 -ARM重复 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
81296,81296 81296 -E集合域 81296 -E集合域 | 0 | 直接 |
57196,57184 57196 -EGF/层粘连蛋白 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
49417,81296 49417 -p53类转录因子 81296 -E集合域 | 0 | 直接 |
54001,143791 54001 -半胱氨酸蛋白酶 143791 -类DUSP | 0 | 直接 |
50044,52540 50044 -SH3-域 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
50978,50998 50978 -WD40重复 50998个-奎诺蛋白醇脱氢酶类 | 0 | 直接 |
50156,50044 50156 -PDZ域类 50044 -SH3-域 | 0 | 直接 |
49562,48371 49562 -C2结构域(钙/脂质结合结构域,CaLB) 48371 -ARM重复 | 0 | 直接 |
47090,55486 47090 -类PGBD 55486 -金属蛋白酶(“锌蛋白”),催化域 | 0 | 直接 |
49265,49899 49265 -纤维连接蛋白III型 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
54791,54791 54791 -真核型KH-结构域(KH-域I型) 54791 -真核型KH-结构域(KH-域I型) | 0 | 直接 |
100909,49899 100909 -IP3受体1型结合核心,结构域2 49899人-伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
75399,75399 75399 -Plakin重复 75399 -Plakin重复 | 0 | 直接 |
52743,49785 52743 -类枯草杆菌 49785 -半乳糖结合域样 | 0 | 直接 |
50447,50465 50447 -翻译蛋白 50465 -EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C末端结构域 | 0 | 直接 |
81324,81296 81324 -电压门控钾通道 81296 -E集合域 | 0 | 直接 |
54585,52540 54585 -Cdc48域2-类 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
57603,57603 57603 -类FnI域 57603 -类FnI域 | 0 | 直接 |
52540,50447 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 50447 -翻译蛋白 | 0 | 直接 |
51556,51338 51556 -金属依赖性水解酶 51338 -金属依赖水解酶的复合结构域 | 0 | 直接 |
47954,47954 47954 -类周期蛋白 47954 -类周期蛋白 | 0 | 直接 |
54897,52743 54897 -蛋白酶前肽/抑制剂 52743 -类枯草杆菌 | 0 | 直接 |
55753,55753 55753 -肌动蛋白解聚蛋白 55753 -肌动蛋白解聚蛋白 | 0 | 直接 |
90257,57997 90257 -肌球蛋白棒碎片 57997 -原肌球蛋白 | 0 | 直接 |
63825,57196 63825 -YWTD域 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
52799,49562 52799 -(磷酸酪氨酸蛋白)磷酸酶Ⅱ 49562 -C2结构域(钙/脂质结合结构域,CaLB) | 0 | 直接 |
48097,56112 48097 -G蛋白信号调节器 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
49899,57196 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
57196,90193 57196 -EGF/层粘连蛋白 90193 -陷波域 | 0 | 直接 |
82109,82109 82109 -MIR域 82109 -MIR域 | 0 | 直接 |
49854,57196 49854 -精粘连蛋白,CUB域 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
50692,54585 50692 -类似ADC 54585 -Cdc48域2-类 | 0 | 直接 |
52833,47616 52833 -类硫氧还蛋白 47616 -GST C终端域类 | 0 | 直接 |
82153,82153 82153 -FAS1域 82153 -FAS1域 | 0 | 直接 |
57850,57850 57850 -环/U形盒 57850 -环/U形盒 | 0 | 直接 |
52490,55307 52490 -管蛋白核苷酸结合域样 55307 -Tubulin C末端domain-like | 0 | 直接 |
57903,57903 57903 -FYVE/PHD锌指 57903 -FYVE/PHD锌指 | 0 | 直接 |
50729,56112 50729 -PH类域 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
49758,47473 49758 -钙蛋白酶大亚单位,中间结构域(结构域III) 47473 -结构域 | 0 | 直接 |
56112,47769 56112 -蛋白激酶样(PK-like) 47769 -SAM/指向域 | 0 | 直接 |
47655,49417 47655 -斯达 49417 -p53类转录因子 | 0 | 直接 |
49785,49785 49785 -半乳糖结合域样 49785 -半乳糖结合域样 | 0 | 直接 |
48371,48371 48371 -ARM重复 48371 -ARM重复 | 0 | 直接 |
49899,49899 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
103575,48726 103575 -Plexin重复 48726 -免疫球蛋白 | 0 | 直接 |
54160,52540 54160 -类色度域 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
48726,48726 48726 -免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 | 0.0319 | 继承 |
57196,57196 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0.06893 | 继承 |
57716,57716 57716 -糖皮质激素受体样(DNA-结合域) 57716 -糖皮质激素受体样(DNA-结合域) | 0.1454 | 继承 |
48726,49265 48726 -免疫球蛋白 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0.24 | 继承 |
48065,50729 48065 -DBL同源域(DH-domain) 50729 -PH类域 | 0.4516 | 继承 |
49265,49265 49265 -纤维连接蛋白III型 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0.4536 | 继承 |
54849,52029 54849 -类似GroEL的中间领域 52029 -GroEL顶端域样 | 0.6393 | 继承 |
48592,54849 48592 -GroEL赤道域状 54849 -类似GroEL的中间领域 | 0.6393 | 继承 |
49313,49313 49313 -类钙粘蛋白 49313 -类钙粘蛋白 | 0.656 | 继承 |
53300,53300 53300 -vWA类 53300 -vWA类 | 0.6844 | 继承 |
48452,48452 48452 -类似TPR 48452 -类似TPR | 0.7102 | 继承 |
57667,57667 57667 -β-β-α锌指 57667 -β-β-α锌指 | 0.7263 | 继承 |
55021,56534 55021 -类ACT 56534 -芳香氨基酸单加氧酶,催化和齐聚域 | 0.7315 | 继承 |
82109,100909 82109 -MIR域 100909 -IP3受体1型结合核心,结构域2 | 0.7831 | 继承 |
50156,50156 50156 -PDZ域类 50156 -PDZ域类 | 0.8576 | 继承 |
(显示详细信息)
本ZA术语注释的超域(不在SPZA中)
以灰色突出显示的是FDR>0.001的那些
N到C端子顺序的超域(三重) |
FDR(全部) |
注释(直接或继承) |
50729,47473,51695 50729 -PH类域 47473 -结构域 51695 -类PLC磷酸二酯酶 | 0 | 直接 |
57196,57196,57196 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
57196,63825,57196 57196 -EGF/层粘连蛋白 63825 -YWTD域 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
81660,56784,81665 81660 -金属阳离子转运ATP酶,ATP结合域N 56784个-类似HAD 81665 -钙ATP酶,跨膜结构域M | 0 | 直接 |
47655,49417,55550 47655 -斯达 49417 -p53类转录因子 55550 -SH2域 | 0 | 直接 |
101912,103575,48726 101912 -Sema域 103575 -Plexin重复 48726 -免疫球蛋白 | 0 | 直接 |
49854,49785,49785 49854 -精粘连蛋白,CUB域 49785 -半乳糖结合域样 49785 -半乳糖结合域样 | 0 | 直接 |
57184,52058,57184 57184 -生长因子受体结构域 52058 -L类域名 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
52540,50447,50465 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 50447 -翻译蛋白 50465 -EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C末端结构域 | 0 | 直接 |
49899,49899,49899 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
57196,57184,57196 57196 -EGF/层粘连蛋白 57184人-生长因子受体结构域 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
90257,90257,90257 90257 -肌球蛋白棒碎片 90257 -肌球蛋白棒碎片 90257 -肌球蛋白棒碎片 | 0 | 直接 |
55753,55753,55753 55753 -肌动蛋白解聚蛋白 55753 -肌动蛋白解聚蛋白 55753 -肌动蛋白解聚蛋白 | 0 | 直接 |
57196,57196,57184 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
82109,100909,49899 82109 -MIR域 100909 -IP3受体1型结合核心,结构域2 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
57603,57603,57603 57603 -类FnI域 57603 -类FnI域 57603 -类FnI域 | 0 | 直接 |
57184,57184,57196 57184 -生长因子受体结构域 57184 -生长因子受体结构域 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
53067,53067,100920 53067 -类肌动蛋白ATP酶结构域 53067 -类肌动蛋白ATP酶结构域 100920 -热休克蛋白70kD(HSP70),肽结合域 | 0 | 直接 |
57196,49899,49899 57196 -EGF/层粘连蛋白 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
54160,52540,52540 54160 -类色度域 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
54585,52540,52540 54585 -Cdc48域2-类 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
49854,57196,49854 49854 -精粘连蛋白,CUB域 57196 -EGF/层粘连蛋白 49854 -精粘连蛋白,CUB域 | 0 | 直接 |
57196,57196,90193 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 90193 -陷波域 | 0 | 直接 |
49785,49785,49899 49785 -半乳糖结合域样 49785 -半乳糖结合域样 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
90193,90193,90193 90193 -陷波域 90193 -陷波域 90193 -陷波域 | 0 | 直接 |
54160,54160,52540 54160 -类色度域 54160 -类色度域 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
57196,57184,57184 57196 -EGF/层粘连蛋白 57184 -生长因子受体结构域 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
52743,49785,57184 52743 -类枯草杆菌 49785 -半乳糖结合域样 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
48726,49265,49265 48726 -免疫球蛋白 49265 -纤维连接蛋白III型 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0 | 直接 |
57184,57184,57184 57184 -生长因子受体结构域 57184 -生长因子受体结构域 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
50156,50044,52540 50156 -PDZ域类 50044 -SH3-域 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
54897,52743,49785 54897 -蛋白酶前肽/抑制剂 52743 -类枯草杆菌 49785 -半乳糖结合域样 | 0 | 直接 |
69318,69179,69179 69318 -整合素αN末端结构域 69179 -整合素域 69179 -整合素域 | 0 | 直接 |
52058,57184,52058 52058 -L类域名 57184 -生长因子受体结构域 52058 -L类域名 | 0 | 直接 |
49899,57196,57196 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
57850,57850,57850 57850 -环/U形盒 57850 -环/U形盒 57850 -环/U形盒 | 0 | 直接 |
82109,82109,100909 82109 -MIR域 82109 -MIR域 100909 -IP3受体1型结合核心,结构域2 | 0 | 直接 |
50692,54585,52540 50692 -类似ADC 54585 -Cdc48域2-类 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
75399,75399,75399 75399 -Plakin重复 75399 -Plakin重复 75399 -Plakin重复 | 0 | 直接 |
82895,82895,82895 82895 -TSP-1 1型重复 82895 -TSP-1 1型重复 82895 -TSP-1 1型重复 | 0 | 直接 |
49562,48371,56112 49562 -C2结构域(钙/脂质结合结构域,CaLB) 48371 -ARM重复 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
48726,49265,48726 48726 -免疫球蛋白 49265 -纤维连接蛋白III型 48726 -免疫球蛋白 | 0 | 直接 |
54236,47031,50729 54236 -类泛素 47031个-FERM的第二域 50729 -PH类域 | 0 | 直接 |
52540,52540,52540 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
57424,57424,57424 57424 -LDL受体样模块 57424 -LDL受体样模块 57424 -LDL受体样模块 | 0 | 直接 |
81296,81296,81296 81296 -E集合域 81296 -E集合域 81296 -E集合域 | 0 | 直接 |
69179,69179,69179 69179 -整合素域 69179 -整合素域 69179 -整合素域 | 0 | 直接 |
48092,47655,49417 48092 -转录因子STAT-4 N域 47655 -斯达 49417 -p53类转录因子 | 0 | 直接 |
57184,52058,49265 57184 -生长因子受体结构域 52058 -L类域名 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0 | 直接 |
82199,57667,57667 82199 -SET域 57667 -β-β-α锌指 57667 -β-β-α锌指 | 0 | 直接 |
47090,55486,50923 47090 -类PGBD 55486 -金属蛋白酶(“锌蛋白”),催化域 50923 -血红素样结构域 | 0 | 直接 |
103575,81296,81296 103575 -Plexin重复 81296 -E集合域 81296 -E集合域 | 0 | 直接 |
46966,46966,47473 46966 -Spectrin重复 46966 -Spectrin重复 47473 -结构域 | 0 | 直接 |
57196,90193,90193 57196 -EGF/层粘连蛋白 90193 -陷波域 90193 -陷波域 | 0 | 直接 |
52058,49265,49265 52058 -L类域名 49265 -纤维连接蛋白III型 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0 | 直接 |
48726,48726,48726 48726 -免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 | 0.06359 | 继承自:白质||内侧纵束||脑回 |
48726,48726,49265 48726 -免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0.3179 | 继承自:白质||内侧纵束||脑干||脑细胞核||骨骼肌细胞||联脑 |
57716,57716,57716 57716 -糖皮质激素受体样(DNA-结合域) 57716 -糖皮质激素受体样(DNA-结合域) 57716 -糖皮质激素受体样(DNA-结合域) | 0.3932 | 继承自:心室 |
48592,54849,52029 48592 -GroEL赤道域状 54849 -类似GroEL的中间领域 52029 -GroEL顶端域样 | 0.6393 | 继承自:骨骼肌||肌肉系统||骨骼肌细胞||肌肉细胞||肌刀||横纹肌细胞||躯干肌肉组织 |
49313,49313,49313 49313 -类钙粘蛋白 49313 -类钙粘蛋白 49313 -类钙粘蛋白 | 0.6842 | 继承自:间脑白质||白质||神经||黄斑||颅神经II||视顶盖||颅神经||视网膜神经节细胞层 |
N到C端子顺序的超域(三重) |
FDR(全部) |
注释(直接或继承) |
50729,47473,51695 50729 -PH类域 47473 -结构域 51695 -类PLC磷酸二酯酶 | 0 | 直接 |
57196,57196,57196 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
57196,63825,57196 57196 -EGF/层粘连蛋白 63825 -YWTD域 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
81660,56784,81665 81660 -金属阳离子转运ATP酶,ATP结合域N 56784个-类似HAD 81665 -钙ATP酶,跨膜结构域M | 0 | 直接 |
47655,49417,55550 47655 -斯达 49417 -p53类转录因子 55550 -SH2域 | 0 | 直接 |
101912,103575,48726 101912 -Sema域 103575 -Plexin重复 48726 -免疫球蛋白 | 0 | 直接 |
49854,49785,49785 49854 -精粘连蛋白,CUB域 49785 -半乳糖结合域样 49785 -半乳糖结合域样 | 0 | 直接 |
57184,52058,57184 57184 -生长因子受体结构域 52058 -L类域名 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
52540,50447,50465 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 50447 -翻译蛋白 50465 -EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C末端结构域 | 0 | 直接 |
49899,49899,49899 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
57196,57184,57196 57196 -EGF/层粘连蛋白 57184 -生长因子受体结构域 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
90257,90257,90257 90257 -肌球蛋白棒碎片 90257 -肌球蛋白棒碎片 90257 -肌球蛋白棒碎片 | 0 | 直接 |
55753,55753,55753 55753 -肌动蛋白解聚蛋白 55753 -肌动蛋白解聚蛋白 55753 -肌动蛋白解聚蛋白 | 0 | 直接 |
57196,57196,57184 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
82109,100909,49899 82109 -MIR域 100909 -IP3受体1型结合核心,结构域2 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
57603,57603,57603 57603 -类FnI域 57603 -类FnI域 57603 -类FnI域 | 0 | 直接 |
57184,57184,57196 57184 -生长因子受体结构域 57184人-生长因子受体结构域 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
53067,53067,100920 53067 -类肌动蛋白ATP酶结构域 53067 -类肌动蛋白ATP酶结构域 100920 -热休克蛋白70kD(HSP70),肽结合域 | 0 | 直接 |
57196,49899,49899 57196 -EGF/层粘连蛋白 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
54160,52540,52540 54160 -类色度域 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
54585,52540,52540 54585 -Cdc48域2-类 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
49854,57196,49854 49854 -精粘连蛋白,CUB域 57196 -EGF/层粘连蛋白 49854 -精粘连蛋白,CUB域 | 0 | 直接 |
57196,57196,90193 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 90193 -陷波域 | 0 | 直接 |
49785,49785,49899 49785 -半乳糖结合域样 49785 -半乳糖结合域样 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
90193,90193,90193 90193 -陷波域 90193 -陷波域 90193 -陷波域 | 0 | 直接 |
54160,54160,52540 54160 -类色度域 54160 -类色度域 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
57196,57184,57184 57196 -EGF/层粘连蛋白 57184 -生长因子受体结构域 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
52743,49785,57184 52743 -类枯草杆菌 49785 -半乳糖结合域样 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
48726,49265,49265 48726 -免疫球蛋白 49265 -纤维连接蛋白III型 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0 | 直接 |
57184,57184,57184 57184 -生长因子受体结构域 57184 -生长因子受体结构域 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
50156,50044,52540 50156 -PDZ域类 50044 -SH3-域 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
54897,52743,49785 54897 -蛋白酶前肽/抑制剂 52743 -类枯草杆菌 49785 -半乳糖结合域样 | 0 | 直接 |
69318,69179,69179 69318 -整合素αN末端结构域 69179 -整合素域 69179 -整合素域 | 0 | 直接 |
52058,57184,52058 52058 -L类域名 57184 -生长因子受体结构域 52058 -L类域名 | 0 | 直接 |
49899,57196,57196 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
57850,57850,57850 57850 -环/U形盒 57850 -环/U形盒 57850 -环/U形盒 | 0 | 直接 |
82109,82109,100909 82109 -MIR域 82109 -MIR域 100909 -IP3受体1型结合核心,结构域2 | 0 | 直接 |
50692,54585,52540 50692 -类似ADC 54585 -Cdc48域2-类 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
75399,75399,75399 75399 -Plakin重复 75399 -Plakin重复 75399 -Plakin重复 | 0 | 直接 |
82895,82895,82895 82895 -TSP-1 1型重复 82895 -TSP-1 1型重复 82895 -TSP-1 1型重复 | 0 | 直接 |
49562,48371,56112 49562 -C2结构域(钙/脂质结合结构域,CaLB) 48371 -ARM重复 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
48726,49265,48726 48726 -免疫球蛋白 49265 -纤维连接蛋白III型 48726 -免疫球蛋白 | 0 | 直接 |
54236,47031,50729 54236 -类泛素 47031个-FERM的第二域 50729 -PH类域 | 0 | 直接 |
52540,52540,52540 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0 | 直接 |
57424,57424,57424 57424 -LDL受体样模块 57424 -LDL受体样模块 57424 -LDL受体样模块 | 0 | 直接 |
81296,81296,81296 81296 -E集合域 81296 -E集合域 81296 -E集合域 | 0 | 直接 |
69179,69179,69179 69179 -整合素域 69179 -整合素域 69179 -整合素域 | 0 | 直接 |
48092,47655,49417 48092 -转录因子STAT-4 N域 47655 -斯达 49417 -p53类转录因子 | 0 | 直接 |
57184,52058,49265 57184 -生长因子受体结构域 52058 -L类域名 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0 | 直接 |
82199,57667,57667 82199 -SET域 57667 -β-β-α锌指 57667 -β-β-α锌指 | 0 | 直接 |
47090,55486,50923 47090 -类PGBD 55486 -金属蛋白酶(“锌蛋白”),催化域 50923 -血红素样结构域 | 0 | 直接 |
103575,81296,81296 103575 -Plexin重复 81296 -E集合域 81296 -E集合域 | 0 | 直接 |
46966,46966,47473 46966 -Spectrin重复 46966 -Spectrin重复 47473 -结构域 | 0 | 直接 |
57196,90193,90193 57196 -EGF/层粘连蛋白 90193 -陷波域 90193 -陷波域 | 0 | 直接 |
52058,49265,49265 52058 -L类域名 49265 -纤维连接蛋白III型 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0 | 直接 |
48726,48726,48726 48726 -免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 | 0.06359 | 继承 |
48726,48726,49265 48726 -免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0.3179 | 继承 |
57716,57716,57716 57716 -糖皮质激素受体样(DNA-结合域) 57716 -糖皮质激素受体样(DNA-结合域) 57716 -糖皮质激素受体样(DNA-结合域) | 0.3932 | 继承 |
48592,54849,52029 48592 -GroEL赤道域状 54849 -类似GroEL的中间领域 52029 -GroEL顶端域样 | 0.6393 | 继承 |
49313,49313,49313 49313 -类钙粘蛋白 49313 -类钙粘蛋白 49313 -类钙粘蛋白 | 0.6842 | 继承 |
在系统发育树上为超域(单个/单个)用这个表型术语注释
|
将树绘制为:
| | 下载Newick格式树:
|
(显示帮助)
树木依据树向量
使用蛋白质结构域和超结构域生成存在/缺失矩阵超级家族中的所有基因组。这个RAxML公司软件用于使用启发式简约方法。基因组组合或特定分支可以显示为如果有单株树的话。然而,该数据是从单个大树。这会产生比生成树时更高质量的拓扑并允许树立即显示。
|
|