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表型本体
与基因本体论（GO）一样，表型本体论通过将单个术语视为节点及其与父项（允许多个父项）的关系视为有向边，将基因突变/空表型信息从顶部非常一般的术语分类并组织到有向无环图（DAG）中更具体的术语。要导航此层次结构，我们显示所有亲本表型项按与当前项的最短距离排序的当前感兴趣的表型项。也，仅直接儿童表型术语列出了当前表型术语的。我们纳入的表型本体如下：

• 疾病本体（DO）
  DO通过DO术语到MeSH、ICD、NCI同义词库、SNOMED和OMIM的广泛交叉映射，在语义上整合了疾病和医学词汇。
  
• 人类表型（HP）本体（HP）
  HP捕获OMIM中描述的表型异常，以及相应的致病基因。它包括三个互补的生物学概念：遗传模式（MI）、ONset_and_clinical_course（ON）和表型异常（PA）。
  
• 小鼠表型（MP）本体（MP）
  MP描述了特定基因被基因破坏后小鼠的表型。利用它，小鼠基因组信息学（MGI）为小鼠提供了高覆盖率的基因水平表型。
  
• 蠕虫表型本体
  WP对秀丽线虫和其他线虫的表型描述进行分类和组织。使用它，WormBase为秀丽线虫的表型注释提供了主要资源。
  
• 酵母表型本体
  酵母基因组数据库（SGD）基于YP，YP是子囊菌表型本体的主要贡献者，为酵母基因组中的每个基因提供单一突变表型。
  
• 苍蝇表型本体
  FP指FlyBase控制的词汇表。具体来说，FlyBase中的等位基因注释（针对其诱变剂等）使用结构化受控词汇。
  
• 蝇类解剖本体
  FA是黑腹果蝇解剖结构的结构化受控词汇，用于描述表型和基因表达的位置。
  
• 斑马鱼解剖学本体
  ZA使用标准解剖学命名法显示斑马鱼的解剖学术语，以及受影响的基因。
  
• 爪蟾解剖学本体
  XA代表青蛙（非洲爪蟾和热带爪蟾）的组织谱系和发育时间。它用于注释爪蟾基因表达模式以及突变和变体表型。
  
• 拟南芥植物本体（AP）
  作为描述植物解剖和形态结构（AN）以及生长发育阶段（DE）的植物本体论的主要贡献者，拟南芥信息资源（TAIR）为模型高等植物拟南芥提供了拟南芥植物本体论注释。
  
• 酶委员会（EC）本体（EC）
  每个酶都有一个四位数的EC编号，前三位数定义了催化的反应，第四位数是唯一的标识符（序列号）。每种酶都有一个系统名称，唯一地定义了所催化的反应。
  
• DrugBank ATC（DB）本体（DB）
  在解剖治疗化学（ATC）分类系统中，药物根据其作用的器官或系统（第一级，解剖主要组）及其治疗（第二级，治疗亚组）、药理（第三级，药理亚组）分为五个不同级别的组和化学性质（第4级，化学亚组；第5级，化学物质）。只考虑DrugBank中的药物。
  
• UniProtKB关键字（KW）本体
  UniProtKB中的关键字是受控词汇表，提供条目内容的摘要，并用于基于10个类别（此处不包括“技术术语”类别）索引UniProtKB/Swiss-Prot条目。每个关键字都手动归属于UniProtKB/Swiss-Prot条目，并自动归属于UniProtKB/TrEMBL条目（根据特定的注释规则）。
  
• UniProtKB UniPathway（UP）本体
  UP是一个完全手动管理的资源，用于表示和注释代谢途径，在UniProtKB中用作路径注释的受控词汇。
  

结构域表型本体及其注释
蛋白质结构分类（SCOP）将进化相关域划分为超级家族水平和家庭级别。使用上述表型本体，我们生成了以结构域为中心的表型注释，并进一步确定了那些对SCOP结构域注释信息最多的表型术语。令人欣慰的是，以域为中心的表型注释可以作为探索基因型-表型关系的另一个起点。我们为下载提供了几个相关文件，包括每个表型本体的注释和相应的本体。

• 结构域疾病本体（DO）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2DO.txt，以及相应的本体：SDDO.txt文件)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域人类表型（HP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2HP.txt，以及相应的本体：SDHP.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域小鼠表型（MP）本体（SDMP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2MP.txt，以及相应的本体：SDMP.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域蠕虫表型（WP）本体（SDWP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域名2WP.txt，以及相应的本体：SDWP.txt（软件开发包.txt）)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域酵母表型（YP）本体（SDYP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2YP.txt，以及相应的本体：SDYP.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域蝇表型（FP）本体（SDFP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2FP.txt，以及相应的本体：SDFP.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域苍蝇解剖学（FA）本体（SDFA）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2FA.txt，以及相应的本体：SDFA.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 斑马鱼结构域解剖学（ZA）本体（SDZA）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2ZA.txt，以及相应的本体：SDZA.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域爪蟾解剖学（XA）本体（SDXA）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2XA.txt，以及相应的本体：SDXA.txt（SDXA.text）)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域拟南芥植物本体（AP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2AP.txt，以及相应的本体：SDAP文本)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域酶委员会（EC）本体论（SDEC）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2EC.txt，以及相应的本体：SDEC文本)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域DrugBank ATC（DB）本体（SDDB）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2DB.txt，以及相应的本体：SDDB文本)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域UniProtKB关键字（KW）本体（SDKW）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2KW.txt，以及相应的本体：SDKW.txt文件)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域UniProtKB UniPathway（UP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2UP.txt，以及相应的本体：SDUP.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  

超域表型本体及其注释
虽然以域为中心的注释在描述独立域的表型性质方面有很大的希望，但大多数域本身可能不只是单独工作。在多域蛋白质中，它们可以结合在一起形成不同的域结构。现有结构域的重组被认为是表型多样性的主要驱动力之一。作为扩展，我们还生成了超域表型本体及其注释。与以域为中心的表型本体论和注释（SCOP域超级家族水平和家庭级别），此版本仅关注超域和单个SCOP域超级家族级别。此外，就单个超家族而言，以域为中心版本的注释可能与超域版本的注释不同。根据您的关注点，前者应用于考虑超级家族水平和家庭级别，否则，如果您对域组合感兴趣，应使用后者。此外，我们还为下载提供了几个相关文件，包括每个表型本体的注释和相应的本体。

• 超域疾病本体（DO）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2DO.txt文件，以及相应的本体：SPDO.txt文件)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域人类表型（HP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2HP.txt格式，以及相应的本体：SPHO.txt文件)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域小鼠表型（MP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2MP.txt格式，以及相应的本体：SPMP.txt（SPMP文本）)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域域蠕虫表型（WP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2WP.txt格式，以及相应的本体：SPWP.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超结构域酵母表型（YP）本体（SPYP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2YP.txt格式，以及相应的本体：SPYP.txt文件)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域蝇表型（FP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2FP.txt格式，以及相应的本体：SPFP.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域蝇类解剖本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2FA.txt文件，以及相应的本体：SPFA.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 斑马鱼超域解剖学（ZA）本体（SPZA）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2ZA.txt（SP2ZA.文本），以及相应的本体：SPZA.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域爪蟾解剖学（XA）本体（SPXA）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2XA.txt文件，以及相应的本体：SPXA.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超结构域拟南芥植物本体论（AP）本体论（SPAP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2AP.txt格式，以及相应的本体：SPAP.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域酶委员会（EC）本体论（SPEC）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2EC文本，以及相应的本体：SPEC.txt文件)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域DrugBank ATC（DB）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2DB.txt文件，以及相应的本体：SPDB.txt文件)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域域UniProtKB关键字（KW）本体（SPKW）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2KW.txt（SP2KW），以及相应的本体：SPKW.txt软件)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域域UniProtKB UniPathway（UP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2UP.txt格式，以及相应的本体：SPUP.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  

此WP术语注释的超家族域(SDWP级别：信息最少)
以灰色突出显示的是FDR_all>0.001的那些

SCOP术语	FDR（全部）	注释（直接或继承）
Sec23/24的螺旋域	0	直接
含P-loop的三磷酸核苷水解酶	0	直接
核糖体蛋白S24e、L23和L15e	0	直接
类似GroEL的中间领域	0	直接
GroEL赤道域状	0	直接
Plexin重复	0	直接
Sec23/24的C-末端，凝胶样结构域	0	直接
F1 ATP合成酶α和β亚基的C末端结构域	0	直接
14-3-3蛋白质	0	直接
多药外排转运体AcrB跨膜结构域	0	直接
Sec23/24的Zn-finger畴	0	直接
腺苷甲硫氨酸合成酶	0	直接
Nop域	0	直接
网格蛋白亚结构域和互变异构体附属物结构域	0	直接
F1 ATP合成酶α和β亚基的N末端结构域	0	直接
整合素域	0	直接
WD40重复	0.0000000006122	直接
ARM重复	0.000000001658	直接
PH类域	0.000000001954	直接
转导蛋白（α亚单位），插入域	0.000000002113	直接
GTPase激活域	0.000000006137	直接
类似TPR	0.0000000794	直接
Tubulin C末端domain-like	0.0000001605	直接
“翼螺旋”DNA-结合域	0.0000001755	直接
类家畜	0.0000002593	直接
GroEL顶端域样	0.0000002942	直接
管蛋白核苷酸结合域样	0.0000006634	直接
核酸结合蛋白	0.000001708	直接
类PYP传感器域（PAS域）	0.000007228	直接
翻译蛋白SH3-样结构域	0.000009181	直接
SH3-域	0.00002196	直接
HLH，螺旋-环-螺旋DNA-结合域	0.00005082	直接
像蛇一样	0.0001167	直接
Sema域	0.0001724	直接
Sec1/munc18样（SM）蛋白质	0.0001724	直接
SMAD MH1域	0.0001724	直接
Hedgehog/intein（提示）域	0.000201	直接
前折叠素	0.000221	直接
泛素样蛋白的激活酶	0.000221	直接
钙粘蛋白同源结构域	0.000229	直接
生长因子受体结构域	0.0003116	直接
原肌球蛋白	0.0005794	直接
纤维连接蛋白III型	0.0005922	直接
精氨酸酶/脱乙酰酶	0.0007766	直接
谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样	0.000799	直接
卷曲富含半胱氨酸结构域	0.0008204	直接
类枯草杆菌	0.0008204	直接
Ⅱ类aaRS和生物素合成酶	0.0009888	直接
β-β-α锌指	0.001176	继承自:外阴突出
免疫球蛋白	0.001645	继承自:突触形态变异||神经系统形态变异||神经元形态变异||体壁肌肌节形态变异||肌肉系统形态变异||神经突起形态变异
逆转录病毒锌指状结构域	0.001802	继承自:生殖系统形态变异
溴代甲烷	0.001802	继承自:两性相粒感器形态变异||感器形态变异
DBL同源域（DH-domain）	0.002044	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异
HMG盒	0.002044	继承自:外阴形态变异||相移插座缺失||生殖系统形态变异||性腺臂形态变异||外阴突出
蛋白激酶样（PK-like）	0.002169	继承自:胚核轴
类肌动蛋白ATP酶结构域	0.002293	继承自:体壁肌肌球蛋白组织缺陷
组蛋白折叠	0.00277	继承自:肠变性||外阴突出||性腺小
钙蛋白酶大亚单位，中间结构域（结构域III）	0.002886	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异||肌肉系统形态变异
肌钙蛋白卷曲亚单位	0.002886	继承自:咽形态变异||体壁肌肌节形态变异
GINS螺旋束状	0.003417	继承自:雌雄同体生殖系统形态变异||外阴形态变异||生殖系统形态变异||外阴突出
C2结构域（钙/脂质结合结构域，CaLB）	0.003753	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异||肌肉系统形态变异
Smc铰链域	0.003756	继承自:性腺形态变异||外阴突出
DNA依赖性RNA-聚合酶的β和β素亚基	0.003756	继承自:生殖系统形态变异
RNA聚合酶的RBP11样亚基	0.003822	继承自:生殖系统形态变异||性腺形态变异
中间丝蛋白，卷曲螺旋区	0.004406	继承自:排泄管形态变异||排泄细胞形态变异||排泄-分泌系统形态变异
Spectrin重复	0.004406	继承自:横纹肌形态变异||肌肉系统形态变异
层压板A/C球状尾区	0.004406	继承自:排泄管形态变异||排泄细胞形态变异||排泄分泌系统形态变异
SMAD/FHA域	0.00524	继承自:染料填充缺陷||双相神经元形态变异||轴突分支变异体||神经系统形态变异||光线融合
BAR/IMD域类	0.005488	继承自:染料填充缺陷||两性相粒感器形态变异
富含半胱氨酸结构域	0.005582	继承自:横纹肌形态变异||轴突形态变异||轴宽||体壁肌肌节形态变异
热休克蛋白70kD（HSP70），肽结合域	0.006767	继承自:生殖系统形态变异
N-末端亲核氨基水解酶（Ntn水解酶）	0.007756	继承自:脊柱形态变异||生殖系统形态变异||性腺囊化||性腺形态变异||脊柱狭窄
RNA-结合域	0.008526	继承自:外阴形态变异||生殖系统形态变异
类Sm核糖核蛋白	0.00882	继承自:生殖系统形态变异||性腺形态变异||粗线期区域组织变异
锌结合核糖体蛋白	0.008943	继承自:生殖系统形态变异
Cullin同源结构域	0.01015	继承自:生殖系统形态变异
EGF/层粘连蛋白	0.01149	继承自:没有直肠||轴突轨迹变异||直肠形态变异||体壁肌肌节形态变异
S15/NS1 RNA-结合域	0.01299	继承自:脊柱形态变异||性腺形态变异||轴窄||粗线期区域组织变异
热休克蛋白70kD（HSP70），C末端亚结构域	0.01332	继承自:生殖系统形态变异
II类aaRS ABD相关	0.02122	继承自:性腺形态变异
p53类转录因子	0.02242	继承自:上皮系统形态变异||上皮形态变异||消化系统形态变异
SH2域	0.02788	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异||肌肉系统形态变异
PDZ域类	0.03161	继承自:上皮系统形态变异||上皮形态变异||突触形态变异
TAZ域	0.03365	继承自:外阴突出
平移机械部件	0.03365	继承自:脊柱形态变异||性腺形态变异||脊柱狭窄||粗线期区域组织变异
肌球蛋白棒碎片	0.03783	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌粗丝变异||体壁肌肌节形态变异||肌肉系统形态变异
L30e类	0.03783	继承自:脊柱形态变异||性腺囊化||性腺形态变异||脊柱狭窄||粗线期区域组织变异
翻译蛋白	0.07991	继承自:脊柱形态变异||粗线期区域组织变异
I类氨酰-tRNA合成酶亚类的反密码子结合域	0.08005	继承自:脊柱形态变异||性腺形态变异||粗线期区域组织变异
SAM/指向域	0.08505	继承自:突触形态变异
PX域	0.1228	继承自:两性相粒感器形态变异
伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶	0.1388	继承自:轴突形态变异||连合利手缺陷||神经突起形态变异
EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C末端结构域	0.1435	继承自:脊柱形态变异||性腺囊化||脊柱狭窄||粗线期区域组织变异
FERM的第二域	0.1692	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异||肌肉系统形态变异
胱氨酸结细胞因子	0.3971	继承自:突触形态变异
核苷酸二磷酸糖转移酶	0.6709	继承自:压扁的外阴||外阴内陷变异体L4
电压门控钾通道	0.8841	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异||肌肉系统形态变异
C型凝集素样	1	继承自:射线移位
NAD（P）-结合Rossmann-fold域	1	继承自:外阴内陷变异体L4

注释到此WP术语的家族域(不在SDWP中)
以灰色突出显示的是FDR_all>0.001的那些

SCOP术语	FDR（全部）	注释（直接或继承）
POU特定域	0	直接
DNA复制起始剂（cdc21/cdc54）N末端结构域	0	直接
Nop域	0	直接
Sec23/24的β-三明治结构域	0	直接
肌醇多磷酸5-磷酸酶（IPP5）	0	直接
奎诺蛋白醇脱氢酶类	0	直接
Sec23/24的螺旋域	0	直接
F1 ATP合成酶α和β亚基的C末端结构域	0	直接
Sema域	0	直接
Sec23/24的Zn-finger畴	0	直接
前蛋白转化酶P结构域	0	直接
II族伴侣蛋白（CCT，TRIC），中间结构域	0	直接
RNA-聚合酶β	0	直接
14-3-3蛋白质	0	直接
Sec23/24的中继域	0	直接
Ⅱ类伴侣蛋白（CCT，TRIC），ATP酶结构域	0	直接
MIF4G域类	0	直接
整合素域	0	直接
F1 ATP合成酶α和β亚基的N末端结构域	0	直接
腺苷甲硫氨酸合成酶	0	直接
Plexin重复	0	直接
Sec23/24的C-末端，凝胶样结构域	0	直接
多药外排转运体AcrB跨膜结构域	0.000000000000005004	直接
G蛋白	0.0000000001751	直接
转导蛋白（α亚单位），插入域	0.00000002758	直接
Homeodomain公司	0.000000097	直接
WD40-重复	0.0000003761	直接
管蛋白，C末端结构域	0.000001103	直接
BCR-同源GTPase激活域（BH-domain）	0.000002096	直接
蛋白酶体亚单位	0.000002562	直接
植物群落学域（PH域）	0.000003191	直接
微管蛋白，GTP酶结构域	0.000003848	直接
II组伴侣蛋白（CCT，TRIC），顶端结构域	0.000004884	直接
运动蛋白质类	0.0000111	直接
我设置域	0.00001112	直接
肌动蛋白/HSP70	0.00001777	直接
层压板型模块	0.0003501	直接
Sec1/munc18样（SM）蛋白质	0.0003501	直接
SMAD MH1域	0.0003501	直接
经典锌指，C2H2	0.000364	直接
SH3-域	0.0003663	直接
HLH，螺旋-环-螺旋DNA-结合域	0.0004405	直接
SMAD域	0.0005112	直接
类再裂解	0.0005112	直接
组蛋白脱乙酰酶	0.0005112	直接
平移机械部件	0.0005112	直接
LIM域	0.0005272	直接
Hedgehog C端（Hog）自动处理域	0.0005272	直接
生长因子受体结构域	0.0009042	直接
四三肽重复序列（TPR）	0.0009857	直接
钙粘蛋白同源结构域	0.001242	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌肌球蛋白组织缺陷||肌肉系统形态变异
冷休克DNA结合域样	0.001242	继承自:性腺囊化||脊柱狭窄||粗线期区域组织变异
泛素激活酶（UBA）	0.001427	继承自:外阴形态变异||生殖系统形态变异||外阴外翻||外阴突出
Smc铰链域	0.001427	继承自:雌雄同体生殖系统形态变异||外阴形态变异||性腺形态变异||外阴突出
副标题	0.001427	继承自:雌雄同体生殖系统形态变异||外阴形态变异
卷曲富含半胱氨酸结构域	0.001427	继承自:感器形态变异
原肌球蛋白	0.001472	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异
PDZ域	0.001795	继承自:突触形态变异
前折叠素	0.001837	继承自:雌雄同体生殖系统形态变异||外阴形态变异||外阴突出
氯氰菊酯衔接蛋白核心蛋白	0.001837	继承自:脊柱形态变异||二倍体区域组织变体||脊柱狭窄
氯菊酯涂层组装域	0.001837	继承自:感器形态变异
纤维连接蛋白III型	0.003879	继承自:轴突形态变异||连合缺失||神经元形态变异||体壁肌肌节形态变异||神经突起形态变异
Spectrin重复	0.004442	继承自:横纹肌形态变异||肌肉系统形态变异
逆转录病毒锌指状结构域	0.004847	继承自:生殖系统形态变异
溴代甲烷	0.004847	继承自:两性相粒感器形态变异||感器形态变异
细胞周期蛋白	0.004909	继承自:性腺臂形态变异
II类氨酰基tRNA合成酶（aaRS）样催化结构域	0.004909	继承自:性腺形态变异||终动区组织变异
钙蛋白酶大亚单位，中间结构域（结构域III）	0.00558	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异||肌肉系统形态变异
反密码子结合域	0.005747	继承自:脊柱形态变异||双区组织变体||生殖系统形态变异||性腺形态变异||粗线期区域组织变异
糖基转移酶组1	0.005747	继承自:生殖系统形态变异
肌钙蛋白I	0.005747	继承自:咽部形态变异||消化系统形态变异
Ⅱ类aaRS的抗密码子结合域	0.005747	继承自:生殖系统形态变异||性腺形态变异
DBL同源域（DH-domain）	0.005988	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异
HMG盒	0.005988	继承自:外阴形态变异||相移插座缺失||生殖系统形态变异||性腺臂形态变异||外阴突出
RecA类蛋白（ATP酶域）	0.006408	继承自:二倍体区域组织变体||生殖系统形态变异||性腺形态变异
中间丝蛋白，卷曲螺旋区	0.009358	继承自:排泄管形态变异||排泄细胞形态变异||排泄分泌系统形态变异
类PLC（P变体）	0.009358	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异
层压板A/C球状尾区	0.01281	继承自:排泄管形态变异||体壁肌肌节形态变异||排泄细胞形态变异||排泄分泌系统形态变异
蛋白激酶，催化亚单位	0.01703	继承自:两性神经元染料填充缺陷||胚核轴
犰狳重复	0.01731	继承自:染料填充缺陷||相位神经元染色填充缺陷||双相神经元形态变异||相移神经元形态变异
核小体核心组蛋白	0.01776	继承自:外阴形态变异||肠道变性||外阴突出||性腺小
标准RBD	0.02036	继承自:外阴形态变异||生殖系统形态变异
转化生长因子（TGF）-β	0.0216	继承自:突触形态变异||神经系统形态变异
L30e/L7ae核糖体蛋白	0.0216	继承自:脊柱形态变异||二倍体区域组织变体||性腺囊化||性腺形态变异||脊柱狭窄||粗线期区域组织变异
DEP域	0.0216	继承自:神经系统形态变异
多域蛋白质中的EF-hand模块	0.0216	继承自:横纹肌形态变异||肌肉系统形态变异
叉头DNA结合域	0.02692	继承自:雌雄同体生殖系统形态变异||外阴形态变异
小核核糖核蛋白的Sm基序	0.02908	继承自:脊柱形态变异||性腺形态变异||粗线期区域组织变异
热休克蛋白70kD（HSP70），肽结合域	0.03521	继承自:性腺形态变异
串联AAA-ATP酶域	0.04044	继承自:外阴形态变异||生殖系统形态变异
层粘连蛋白G样模块	0.04215	继承自:轴突形态变异||连合利手缺陷||神经元形态变异||神经突起形态变异
FERM的第一个域	0.04985	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异||肌肉系统形态变异
肌球蛋白棒碎片	0.0614	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌粗丝变异||体壁肌肌节形态变异||肌肉系统形态变异
FERM的第三域	0.09558	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异||肌肉系统形态变异
SH2域	0.1116	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异||肌肉系统形态变异
钙蛋白酶大亚单位，催化结构域（结构域II）	0.1302	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异||肌肉系统形态变异
EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C末端结构域	0.2012	继承自:脊柱形态变异||性腺囊化||脊柱狭窄||粗线期区域组织变异
FERM的第二域	0.2165	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异||肌肉系统形态变异
突触结合蛋白样（S变异体）	0.2165	继承自:体壁肌肌节形态变异
色域	0.2398	继承自:外阴外翻
FHA域	0.2398	继承自:轴突形态变异||轴突分支变异体||神经突起形态变异
I类氨酰-tRNA合成酶亚类的反密码子结合域	0.2502	继承自:脊柱形态变异||粗线期区域组织变异
伸长率系数	0.3161	继承自:脊柱形态变异||粗线期区域组织变异
C型凝集素结构域	1	继承自:射线移位

树木依据树向量

使用蛋白质域生成存在/缺失矩阵超级家族中所有基因组的结构数据。这个PAUP公司软件用于使用启发式简约方法。基因组组合或特定分支可以显示为如果有单株树的话。然而，该数据是从单个大树。这会产生比生成树时更高质量的拓扑并允许树立即显示。

注释到此WP术语的超域(SPWP等级：信息最少)
以灰色突出显示的是FDR>0.001的那些

超域（单个）	FDR（全部）	注释（直接或继承）
GroEL赤道域状	0	直接
含P-loop的三磷酸核苷水解酶	0	直接
Sec23/24的C-末端，凝胶样结构域	0	直接
14-3-3蛋白质	0	直接
腺苷甲硫氨酸合成酶	0	直接
核糖体蛋白S24e、L23和L15e	0	直接
整合素域	0	直接
Plexin重复	0	直接
F1 ATP合成酶α和β亚基的N末端结构域	0	直接
类似GroEL的中间领域	0	直接
网格蛋白亚结构域和互变异构体附属物结构域	0	直接
Sec23/24的螺旋域	0	直接
Nop域	0	直接
F1 ATP合成酶α和β亚基的C末端结构域	0	直接
多药外排转运体AcrB跨膜结构域	0	直接
Sec23/24的Zn-finger畴	0	直接
WD40重复	0.0000000004858	直接
ARM重复	0.000000001318	直接
PH类域	0.000000001553	直接
转导蛋白（α亚单位），插入域	0.00000000168	直接
GTPase激活域	0.00000000489	直接
类似TPR	0.00000006359	直接
Tubulin C末端domain-like	0.0000001288	直接
“翼螺旋”DNA-结合域	0.0000001409	直接
类家畜	0.0000002085	直接
GroEL顶端域样	0.0000002366	直接
管蛋白核苷酸结合域样	0.0000005353	直接
核酸结合蛋白	0.000001383	直接
类PYP传感器域（PAS域）	0.00000588	直接
翻译蛋白SH3-样结构域	0.00000747	直接
SH3-域	0.0000179	直接
HLH，螺旋-环-螺旋DNA-结合域	0.00004158	直接
像蛇一样	0.00009571	直接
Sema域	0.0001415	直接
SMAD MH1域	0.0001415	直接
Sec1/munc18样（SM）蛋白质	0.0001415	直接
Hedgehog/intein（提示）域	0.000165	直接
前折叠素	0.0001816	直接
泛素样蛋白的激活酶	0.0001816	直接
钙粘蛋白同源结构域	0.0001883	直接
生长因子受体结构域	0.0002567	直接
原肌球蛋白	0.0004799	直接
纤维连接蛋白III型	0.0004906	直接
精氨酸酶/脱乙酰酶	0.0006456	直接
谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样	0.0006645	直接
类枯草杆菌	0.0006823	直接
卷曲富含半胱氨酸结构域	0.0006823	直接
Ⅱ类aaRS和生物素合成酶	0.000823	直接
β-β-α锌指	0.0009805	直接
免疫球蛋白	0.001375	继承自:肌肉系统形态变异||神经系统形态变异||神经元形态变异||神经突起形态变异||体壁肌肌节形态变异||突触形态变异
溴代甲烷	0.001508	继承自:感器形态变异||两性相粒感器形态变异
逆转录病毒锌指状结构域	0.001508	继承自:生殖系统形态变异
HMG盒	0.001714	继承自:相移插座缺失||生殖系统形态变异||外阴突出||性腺臂形态变异||外阴形态变异
DBL同源域（DH-domain）	0.001714	继承自:横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异
蛋白激酶样（PK-like）	0.001822	继承自:胚核轴
类肌动蛋白ATP酶结构域	0.001927	继承自:体壁肌肌球蛋白组织缺陷
组蛋白折叠	0.002336	继承自:性腺小||外阴突出||肠道形态变异||肠道变性
肌钙蛋白卷曲亚单位	0.002435	继承自:咽形态变异||体壁肌肌节形态变异
钙蛋白酶大亚单位，中间结构域（结构域III）	0.002435	继承自:肌肉系统形态变异||横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异
GINS螺旋束状	0.002891	继承自:生殖系统形态变异||外阴突出||雌雄同体生殖系统形态变异||外阴形态变异
C2结构域（钙/脂质结合结构域，CaLB）	0.003179	继承自:肌肉系统形态变异||横纹肌形态变异||轴突形态变异||体壁肌肌节形态变异
DNA依赖性RNA-聚合酶的β和β素亚基	0.003181	继承自:生殖系统形态变异
Smc铰链域	0.003181	继承自:外阴突出||性腺形态变异||雌雄同体生殖系统形态变异||外阴形态变异
RNA聚合酶的RBP11样亚基	0.003238	继承自:生殖系统形态变异||性腺形态变异
层压板A/C球状尾区	0.003736	继承自:排泄管形态变异||排泄细胞形态变异||排泄分泌系统形态变异
中间丝蛋白，卷曲螺旋区	0.003736	继承自:排泄管形态变异||排泄细胞形态变异||排泄分泌系统形态变异
Spectrin重复	0.003736	继承自:肌肉系统形态变异||横纹肌形态变异
SMAD/FHA域	0.004454	继承自:染料填充缺陷||神经系统形态变异||轴突分支变异体||光线融合||双相神经元形态变异
BAR/IMD域类	0.004667	继承自:染料填充缺陷||两性相粒感器形态变异
富含半胱氨酸结构域	0.004749	继承自:横纹肌形态变异||轴突形态变异||体壁肌肌节形态变异||轴宽
热休克蛋白70kD（HSP70），肽结合域	0.005772	继承自:生殖系统形态变异
N-末端亲核氨基水解酶（Ntn水解酶）	0.006631	继承自:脊柱形态变异||生殖系统形态变异||性腺形态变异||脊柱狭窄||性腺囊化
RNA-结合域	0.00731	继承自:生殖系统形态变异||外阴形态变异
类Sm核糖核蛋白	0.007566	继承自:生殖系统形态变异||性腺形态变异||粗线期区域组织变异
锌结合核糖体蛋白	0.007675	继承自:生殖系统形态变异
Cullin同源结构域	0.008733	继承自:生殖系统形态变异
EGF/层粘连蛋白	0.009903	继承自:轴突轨迹变异||没有直肠||体壁肌肌节形态变异||直肠形态变异
S15/NS1 RNA-结合域	0.01122	继承自:脊柱形态变异||性腺形态变异||粗线期区域组织变异||脊柱狭窄
热休克蛋白70kD（HSP70），C末端亚结构域	0.01151	继承自:生殖系统形态变异
下注v1-like	0.01241	继承自:两性相粒感器形态变异
II类aaRS ABD相关	0.01849	继承自:性腺形态变异
p53类转录因子	0.01956	继承自:上皮形态变异||上皮系统形态变异||消化系统形态变异
SH2域	0.02444	继承自:肌肉系统形态变异||横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异
PDZ域类	0.02778	继承自:上皮形态变异||上皮系统形态变异||突触形态变异
平移机械部件	0.0296	继承自:脊柱形态变异||性腺形态变异||粗线期区域组织变异||脊柱狭窄
TAZ域	0.0296	继承自:外阴突出||雌雄同体生殖系统形态变异||外阴形态变异
L30e类	0.03335	继承自:脊柱形态变异||性腺形态变异||粗线期区域组织变异||脊柱狭窄||性腺囊化
肌球蛋白棒碎片	0.03335	继承自:肌肉系统形态变异||横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异||体壁肌粗丝变异
类色度域	0.05105	继承自:外阴形态变异
翻译蛋白	0.07169	继承自:脊柱形态变异||粗线期区域组织变异
I类氨酰-tRNA合成酶亚类的反密码子结合域	0.07183	继承自:脊柱形态变异||性腺形态变异||粗线期区域组织变异
SAM/指向域	0.07643	继承自:突触形态变异
PX域	0.1114	继承自:两性相粒感器形态变异
伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶	0.1264	继承自:神经突起形态变异||轴突形态变异||连合利手缺陷
EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C末端结构域	0.1308	继承自:脊柱形态变异||粗线期区域组织变异||脊柱狭窄||性腺囊化
FERM的第二域	0.155	继承自:肌肉系统形态变异||横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异
胱氨酸结细胞因子	0.3766	继承自:突触形态变异
核苷酸二磷酸糖转移酶	0.6494	继承自:外阴内陷变异L4||压扁的外阴
电压门控钾通道	0.8685	继承自:肌肉系统形态变异||横纹肌形态变异||体壁肌肌节形态变异
NAD（P）-结合Rossmann-fold域	1	继承自:外阴内陷变异体L4
C型凝集素样	1	继承自:射线移位