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表型本体
与基因本体论（GO）一样，表型本体论通过将单个术语视为节点及其与父项（允许多个父项）的关系视为有向边，将基因突变/空表型信息从顶部非常一般的术语分类并组织到有向无环图（DAG）中更具体的术语。要导航此层次结构，我们显示所有亲本表型项按与当前项的最短距离排序的当前感兴趣的表型项。也，仅直接儿童表型术语列出了当前表型术语的。我们纳入的表型本体如下：

• 疾病本体论
  DO通过DO术语到MeSH、ICD、NCI同义词库、SNOMED和OMIM的广泛交叉映射，在语义上整合了疾病和医学词汇。
  
• 人类表型（HP）本体（HP）
  HP捕获OMIM中描述的表型异常以及相应的致病基因。它包括三个互补的生物学概念：遗传模式（MI）、ONset_and_clinical_course（ON）和表型异常（PA）。
  
• 小鼠表型（MP）本体（MP）
  MP描述了特定基因被基因破坏后小鼠的表型。利用它，小鼠基因组信息学（MGI）为小鼠提供了高覆盖率的基因水平表型。
  
• 蠕虫表型本体
  WP对秀丽线虫和其他线虫的表型描述进行分类和组织。使用它，WormBase为秀丽线虫的表型注释提供了主要资源。
  
• 酵母表型本体
  酵母基因组数据库（SGD）基于YP，YP是子囊菌表型本体的主要贡献者，为酵母基因组中的每个基因提供单一突变表型。
  
• 苍蝇表型本体
  FP指FlyBase控制的词汇表。具体来说，FlyBase中的等位基因注释（针对其诱变剂等）使用结构化受控词汇。
  
• 蝇类解剖本体
  FA是黑腹果蝇解剖结构的结构化受控词汇，用于描述表型和基因表达的位置。
  
• 斑马鱼解剖学本体
  ZA使用标准解剖学术语和受影响的基因显示斑马鱼的解剖学术语。
  
• 爪蟾解剖学本体
  XA代表青蛙（非洲爪蟾和热带爪蟾）的组织谱系和发育时间。它用于注释非洲爪蟾的基因表达模式以及突变体和变形表型。
  
• 拟南芥植物本体（AP）
  作为描述植物解剖和形态结构（AN）以及生长发育阶段（DE）的植物本体的主要贡献者，拟南芥信息资源（TAIR）为模式高等植物拟南芥（Arabidopsis thaliana）提供了拟南芥子植物本体注释。
  
• 酶委员会本体论
  每个酶都有一个四位数的EC编号，前三位数定义了催化的反应，第四位数是唯一的标识符（序列号）。每种酶都有一个系统名称，唯一地定义了所催化的反应。
  
• DrugBank ATC（DB）本体（DB）
  在解剖治疗化学（ATC）分类系统中，药物根据作用的器官或系统（第一级，解剖主要组）及其治疗（第二级，治疗亚组）、药理（第三级，药理亚组）分为五个不同级别的组和化学性质（第4级，化学亚组；第5级，化学物质）。只考虑DrugBank中的药物。
  
• UniProtKB关键字（KW）本体
  UniProtKB中的关键字是受控词汇表，提供条目内容的摘要，并用于基于10个类别（此处不包括“技术术语”类别）索引UniProtKB/Swiss-Prot条目。每个关键字都手动归属于UniProtKB/Swiss-Prot条目，并自动归属于UniProtKB/TrEMBL条目（根据特定的注释规则）。
  
• UniProtKB UniPathway（UP）本体
  UP是一个完全手动管理的资源，用于表示和注释代谢途径，在UniProtKB中用作路径注释的受控词汇。
  

结构域表型本体及其注释
蛋白质结构分类（SCOP）将进化相关结构域分为超级家族水平和家庭级别。利用上述表型本体，我们生成了以域为中心的表型注释，并进一步确定了注释SCOP域信息最丰富的表型术语。令人欣慰的是，以域为中心的表型注释可以作为探索基因型-表型关系的另一个起点。我们为下载提供了几个相关文件，包括每个表型本体的注释和相应的本体。

• 结构域疾病本体（DO）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2DO.txt，以及相应的本体：SDDO.txt文件)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域人类表型（HP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2HP.txt，以及相应的本体：SDHP.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域小鼠表型（MP）本体（SDMP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2MP.txt，以及相应的本体：SDMP.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域蠕虫表型（WP）本体（SDWP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2WP.txt，以及相应的本体：SDWP.txt（软件开发包.txt）)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域酵母表型（YP）本体（SDYP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2YP.txt，以及相应的本体：SDYP.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域蝇表型（FP）本体（SDFP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2FP.txt，以及相应的本体：SDFP.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域苍蝇解剖学（FA）本体（SDFA）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域名2FA.txt，以及相应的本体：SDFA.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 斑马鱼结构域解剖学（ZA）本体（SDZA）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2ZA.txt，以及相应的本体：SDZA.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域爪蟾解剖学（XA）本体（SDXA）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域名2XA.txt，以及相应的本体：SDXA.txt（SDXA.text）)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域拟南芥植物本体（AP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2AP.txt，以及相应的本体：SDAP文本)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域酶委员会（EC）本体论（SDEC）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2EC.txt，以及相应的本体：SDEC文本)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域DrugBank ATC（DB）本体（SDDB）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2DB.txt，以及相应的本体：SDDB文本)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域UniProtKB关键字（KW）本体论（SDKW）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2KW.txt，以及相应的本体：SDKW.txt软件)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域UniProtKB UniPathway（UP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2UP.txt，以及相应的本体：SDUP.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  

超域表型本体及其注释
虽然以域为中心的注释在描述独立域的表型性质方面有很大的希望，但大多数域本身可能不只是单独工作。在多域蛋白质中，它们可以结合在一起形成不同的域结构。现有结构域的重组被认为是表型多样性的主要驱动力之一。作为扩展，我们还生成了超域表型本体及其注释。与以域为中心的表型本体论和注释（SCOP域超级家族水平和家庭级别），此版本仅关注超域和单个SCOP域超级家族级别。此外，就单个超家族而言，以域为中心版本的注释可能与超域版本的注释不同。根据您的关注点，前者应用于考虑超级家族水平和家庭级别，否则，如果您对域组合感兴趣，应使用后者。此外，我们还为下载提供了几个相关文件，包括每个表型本体的注释和相应的本体。

• 超域疾病本体（DO）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2DO.txt文件，以及相应的本体：SPDO.txt文件)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域人类表型（HP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2HP.txt格式，以及相应的本体：SPHO.txt文件)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域小鼠表型（MP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2MP.txt格式，以及相应的本体：SPMP.txt（SPMP文本）)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域域蠕虫表型（WP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2WP.txt格式，以及相应的本体：SPWP.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超结构域酵母表型（YP）本体（SPYP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2YP.txt格式，以及相应的本体：SPYP.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域蝇表型（FP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2FP.txt格式，以及相应的本体：SPFP.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域蝇类解剖本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2FA.txt文件，以及相应的本体：SPFA.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 斑马鱼超域解剖学（ZA）本体（SPZA）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2ZA.txt（SP2ZA.文本），以及相应的本体：SPZA.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域爪蟾解剖学（XA）本体（SPXA）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2XA.txt格式，以及相应的本体：SPXA.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域域拟南芥植物本体（AP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2AP.txt格式，以及相应的本体：SPAP.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域酶委员会（EC）本体论（SPEC）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2EC文本，以及相应的本体：规格.txt)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域DrugBank ATC（DB）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2DB.txt文件，以及相应的本体：SPDB.txt文件)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域域UniProtKB关键字（KW）本体（SPKW）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2KW.txt（SP2KW），以及相应的本体：SPKW.txt软件)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域域UniProtKB UniPathway（UP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2UP.txt格式，以及相应的本体：SPUP.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  

此WP术语注释的超家族域(不在SDWP中)
以灰色突出显示的是FDR_all>0.001的那些

SCOP术语	FDR（全部）	注释（直接或继承）
热休克蛋白70kD（HSP70），C末端亚结构域	0	直接
转导蛋白（异源三聚体G蛋白），γ链	0	直接
Sec23/24的螺旋域	0	直接
热休克蛋白70kD（HSP70），肽结合域	0	直接
细胞色素c	0	直接
RNA聚合酶RBP11样亚单位	0	直接
Sec23/24的C-末端，凝胶样结构域	0	直接
F1 ATP合成酶α和β亚基的C末端结构域	0	直接
伴侣J域	0	直接
Sec23/24的锌指结构域	0	直接
肌钙蛋白卷曲亚单位	0	直接
腺苷甲硫氨酸合成酶	0	直接
SMAD MH1域	0	直接
网格蛋白亚结构域和互变异构体附属物结构域	0	直接
F1 ATP合成酶α和β亚基的N末端结构域	0	直接
Clathrin接合器附件域	0	直接
线粒体F1F0-ATP合成酶ε亚基	0	直接
HSP40/DnaJ肽结合域	0	直接
HSP90 C-末端结构域	0	直接
细胞色素P450	0	直接
琥珀酸脱氢酶/富马酸还原酶黄素蛋白，催化结构域	0	直接
DnaJ/Hsp40富含半胱氨酸结构域	0	直接
多药外排转运体AcrB跨膜结构域	0.0000000000001202	直接
转导蛋白（α亚单位），插入域	0.0000000000006711	直接
HSP20-like伴侣	0.00000000001145	直接
含P-loop的三磷酸核苷水解酶	0.00000000004973	直接
组蛋白折叠	0.0000000001923	直接
细胞质结合蛋白样I	0.000000001853	直接
核苷酸环化酶	0.000000005384	直接
类似Homeodomain	0.000000008673	直接
类胰岛素	0.000000009713	直接
ARM重复	0.0000003995	直接
类似TPR	0.000001038	直接
波段7/SPFH域	0.000003688	直接
神经递质门控离子通道跨膜孔	0.000005834	直接
溴代多巴胺	0.000005837	直接
“有翼螺旋”DNA结合域	0.00001155	直接
类肌动蛋白ATP酶结构域	0.00001593	直接
类似GroEL的中间领域	0.00001981	直接
GroEL赤道域状	0.00001981	直接
类Sm核糖核蛋白	0.00002453	直接
C2结构域（钙/脂质结合结构域，CaLB）	0.00002697	直接
HLH，螺旋-环-螺旋DNA结合结构域	0.00002976	直接
Tubulin C末端domain-like	0.00007093	直接
烟碱受体配体结合域样	0.0001294	直接
GroEL顶端结构域样	0.0001422	直接
类似SNF	0.0002005	直接
管蛋白核苷酸结合域样	0.0002005	直接
PH类域	0.0002013	直接
SMAD/FHA域	0.0003064	直接
N-末端亲核氨基水解酶（Ntn水解酶）	0.0003855	直接
RNA-结合域	0.0004119	直接
生长因子受体域	0.0004808	直接
原肌球蛋白	0.0005615	直接
免疫球蛋白	0.0007898	直接
Ⅱ类aaRS和生物素合成酶	0.0009023	直接
DNA依赖性RNA-聚合酶的β和β素亚基	0.000942	直接
富含半胱氨酸结构域	0.001457	继承自:热敏行为变量||气味化学感觉反应变异体||饮食变体||气味阳性趋化性变体||趋化性阳性变异体||趋热性变体
前折叠素	0.001486	继承自:运动变体
Hedgehog/intein（提示）域	0.001665	继承自:运动变量||运动变体
蛋白激酶样（PK-like）	0.003053	继承自:水化学感觉反应变异体||胚后行为变异||生物区域行为变异||dauer小生境行为变异体||化学感觉行为变异||产卵对食物变异的反应||移动速度增加||体肌营养不良||趋化性阳性变异体||碱性pH趋化性变体||机械化变体||发育行为变异体||达斡尔族行为变体||辛醇趋化性缺陷||有机体片段行为变异||晚期产卵
NAD（P）连接氧化还原酶	0.003219	继承自:排便周期变量||排便变体
电压门控钾通道	0.003228	继承自:过度活跃产卵||骨针插入缺陷||产蛋缺陷||反向点速度变量||车身弯曲变形||向后运动变体||身体姿势变化||头部弯曲角度变量||饮食变体||局部运动变体||阳性趋化性缺陷||平板丝锥习惯化变体||转向频率变量||向前运动变体||驱逐有缺陷||驱逐变体||习惯化变体||前向点速度变量||运动协调变体||卷取频率变化||尾部弯曲角度变量||机械化变体||滚筒||虫子袋||浮肿的||松弛的||活动级别变量||头部移动变量
F1F0 ATP合成酶亚基C	0.00332	继承自:避免细菌草坪
类ARID	0.00332	继承自:光响应变量||机体紫外线过敏||生物体紫外线反应变异体
S15/NS1 RNA-结合域	0.00332	继承自:避免细菌草坪||喂食行为变异
卷曲的富含半胱氨酸结构域	0.00332	继承自:生物区域行为变异||身体行为变量||体肌营养不良||有机体片段行为变异
核酸结合蛋白	0.003527	继承自:避免细菌草坪
Spectrin重复	0.004391	继承自:运动变量||运动变体
锌结合核糖体蛋白	0.004609	继承自:避免细菌草坪||喂食行为变异
cAMP结合结构域样	0.007763	继承自:热敏行为变量||气味化学感觉反应变异体||车身弯曲变化频率||产蛋缺陷||身体姿势波长变化||反向点速度变量||车身弯曲变形||气味负趋化性缺陷||雄性交配变异体||化学感觉行为变异||头部弯曲角度变量||雄性交配缺陷||苯甲醛趋化性缺陷||气味阳性趋化性变体||卷取变体||趋化性阳性变异体||阳性趋化性缺陷||转向频率变量||丁酮趋化性变体||前向点速度变量||氯化钠趋化性缺陷||趋化性变体||趋热性变体||气味阳性趋化性缺陷||卷取频率变化||方向性变量||滚筒||机头运动变量||浮肿的||身体姿势振幅变化||路径曲率变量||氯化钠趋化性变体||转向变量||苯甲醛趋化性变体||头部移动变量||正弦运动变化幅度
翻译蛋白SH3-样结构域	0.009521	继承自:避免细菌草坪||喂食行为变异
EGF/层粘连蛋白	0.01004	继承自:气味负趋化性缺陷||运动变量||运动变体||辛醇趋化性变体||辛醇趋化性缺陷
E2F-DP异二聚区	0.01142	继承自:向后运动变体||运动协调变体||反转变量||方向性变量
铜、锌超氧化物歧化酶样	0.01142	继承自:排便周期变量||排便周期可变长度||排便变体
整合素域	0.01142	继承自:产卵变异体
类PYP传感器域（PAS域）	0.01311	继承自:产蛋缺陷||产卵变异体
WD40重复	0.01763	继承自:渗透回避变体
PLC样磷酸二酯酶	0.01794	继承自:骨针插入缺陷||雄性交配变异体||性二形性行为变异||雄性交配缺陷||后壁收缩排便周期变异||排卵变异||排便变体||排便收缩变异体||交配变异体
纤维连接蛋白III型	0.01908	继承自:身体姿势变化||向前运动减少||反转变量||路径曲率增加||运动减少
中间丝蛋白，卷曲螺旋区	0.02274	继承自:瘫痪的
层压板A/C球状尾区	0.02274	继承自:瘫痪的
精氨酸酶/脱乙酰酶	0.02839	继承自:光响应变量||机体紫外线过敏||生物体紫外线反应变异体
SH3-域	0.03064	继承自:排卵变异
FYVE/PHD锌指	0.03139	继承自:光响应变量||机体紫外线过敏||生物体紫外线反应变异体
周质结合蛋白样II	0.04841	继承自:热敏行为变量||水阳性趋化性缺陷||化学感觉行为变异||饮食变体||阳性趋化性缺陷||氯化钠趋化性缺陷||趋化性变体||趋热性变体||咽部抽吸减少||咽泵速变异||水阳性趋化性变体||氯化钠趋化性变体||化学感觉反应变异体
β-β-α锌指	0.04847	继承自:产卵抗丙咪嗪
类FKBP	0.05182	继承自:胚后行为变异||发育行为变异体||达斡尔族行为变体
NO信号转导和高尔基体转运中的配体结合域	0.05182	继承自:饮食变体||咽泵速变异||诱导性咽泵变异
HD-域/PD-Ease类	0.05182	继承自:热敏行为变量||趋热性变体
DNA/RNA聚合酶	0.06367	继承自:光响应变量||机体紫外线过敏||生物体紫外线反应变异体
II类aaRS ABD相关	0.06728	继承自:避免细菌草坪||喂食行为变异
I类氨酰-tRNA合成酶亚类的反密码子结合域	0.08391	继承自:避免细菌草坪
脂蛋白球蛋白复合物，超螺旋结构域	0.08645	继承自:避免细菌草坪||喂食行为变异
脂蛋白球蛋白复合物；β-薄片壳区域	0.08645	继承自:避免细菌草坪||喂食行为变异
PDZ域类	0.09133	继承自:生物区域行为变异||身体行为变量||体肌营养不良||排卵变异||有机体片段行为变异
类似NTF2	0.1032	继承自:雄性交配变异体||雄性交配缺陷
核苷酸酰转移酶	0.1048	继承自:避免细菌草坪||喂食行为变异
二磷酸硫胺素结合褶皱（THDP-结合）	0.1112	继承自:避免细菌草坪
肌球蛋白棒碎片	0.1112	继承自:行动迟缓的
L30e类	0.1112	继承自:避免细菌草坪
G蛋白信号调节器	0.1348	继承自:趋化性阴性变异体||趋化性变体||机械化变体
谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样	0.1703	继承自:雄性交配变异体||化学感觉行为变异||性二形性行为变异||雄性交配效率降低||趋化性阴性变异体||渗透回避变体||趋化性变体||交配变异体
结构域	0.202	继承自:排卵变异||排便收缩变异体
酰基辅酶A脱氢酶C末端结构域样	0.2099	继承自:排便周期变量||排便变体
酰基辅酶A脱氢酶NM结构域样	0.2099	继承自:排便周期变量||排便变体
类色度域	0.2164	继承自:光响应变量||机体紫外线过敏||生物体紫外线反应变异体
PLP依赖性转移酶	0.3029	继承自:路径曲率减小||向前移动增加||驱逐变体||身体姿势振幅增加||排便收缩变异体
NAD激酶/二酰甘油激酶样	0.3829	继承自:热敏行为变量||趋热性变体
类泛素	0.3896	继承自:生物区域行为变异||身体行为变量||体肌营养不良||有机体片段行为变异
LDL受体样模块	0.4137	继承自:瘫痪的
Ankyrin重复	0.4982	继承自:车身弯曲变形||气味负趋化性缺陷||身体姿势波长降低||向后运动变体||正弦运动变量||身体姿势变化||头部弯曲角度变量||局部运动变体||转向频率变量||向前运动变体||趋化性变体||反转变量||尾部弯曲角度变量||辛醇趋化性变体||机头运动变量||辛醇趋化性缺陷||转向变量||化学感觉反应变异体||尾部运动变量||头部移动变量
FAD/NAD（P）-结合域	0.6845	继承自:产卵量减少
类似BPTI	0.7446	继承自:雄性交配缺陷
皂苷	0.8202	继承自:产卵量减少
C型凝集素样	1	继承自:雄性交配变异体||性二形性行为变异||雄性交配缺陷||交配变异体
糖皮质激素受体样（DNA-结合域）	1	继承自:单独喂养增加
家族A G蛋白偶联受体样	1	继承自:5-羟色胺诱导的抽吸变体||诱导性咽泵变异
核受体配体结合域	1	继承自:单独喂养增加

注释到此WP术语的家族域(不在SDWP中)
以灰色突出显示的是FDR_all>0.001的那些

SCOP术语	FDR（全部）	注释（直接或继承）
Sec23/24的β-三明治结构域	0	直接
tRNA合酶结构域	0	直接
热休克蛋白90，HSP90，N末端结构域	0	直接
层压板型模块	0	直接
肌醇多磷酸5-磷酸酶（IPP5）	0	直接
类似RhoGDI	0	直接
线粒体F1F0-ATP合成酶ε亚基	0	直接
HSP40/DnaJ肽结合域	0	直接
Hsp90中间结构域	0	直接
奎诺蛋白醇脱氢酶类	0	直接
Sec23/24的螺旋域	0	直接
伴侣J域	0	直接
F1 ATP合成酶α和β亚基的C末端结构域	0	直接
Sec23/24的锌指结构域	0	直接
热休克蛋白20	0	直接
II族伴侣蛋白（CCT，TRIC），中间结构域	0	直接
DnaJ/Hsp40富含半胱氨酸结构域	0	直接
核糖核酸聚合酶β	0	直接
磷脂酰糖醇转移蛋白	0	直接
哺乳动物PLC	0	直接
琥珀酸脱氢酶/富马酸还原酶黄素蛋白，催化结构域	0	直接
Sec23/24的中继域	0	直接
转导蛋白（异源三聚体G蛋白），γ链	0	直接
肌钙蛋白I	0	直接
琥珀酸脱氢酶/富马酸还原酶黄素蛋白N末端结构域	0	直接
SMAD MH1域	0	直接
HSP90 C-末端结构域	0	直接
整合素域	0	直接
热休克蛋白70kD（HSP70），肽结合域	0	直接
F1 ATP合成酶α和β亚基的N末端结构域	0	直接
腺苷甲硫氨酸合成酶	0	直接
热休克蛋白70kD（HSP70），C末端亚结构域	0	直接
细胞色素P450	0	直接
Ⅱ类aaRS的抗密码子结合域	0	直接
Sec23/24的C-末端，凝胶样结构域	0	直接
多药外排转运体AcrB跨膜结构域	0.00000000001627	直接
转导蛋白（α亚单位），插入域	0.00000000002644	直接
肌动蛋白/HSP70	0.000000003485	直接
Homeodomain公司	0.00000002768	直接
核小体核心组蛋白	0.00000004306	直接
类胰岛素	0.0000002402	直接
蛋白酶体亚单位	0.0000002549	直接
腺苷酸和鸟苷酸环化酶催化域	0.0000003116	直接
L-阿拉伯糖结合蛋白样	0.000000523	直接
植物群落学域（PH域）	0.000008505	直接
溴代多巴胺	0.00003878	直接
波段7/SPFH域	0.00007323	直接
类PLC（P变体）	0.0001766	直接
SMAD域	0.0002242	直接
Ⅱ类伴侣蛋白（CCT，TRIC），ATP酶结构域	0.0002242	直接
神经递质门控离子通道跨膜孔	0.0002297	直接
小核核糖核蛋白的Sm基序	0.0002758	直接
类似SNF	0.0003552	直接
管蛋白，C末端结构域	0.0004103	直接
PHD域	0.0004557	直接
HLH，螺旋-环-螺旋DNA结合结构域	0.0004851	直接
G蛋白	0.0005705	直接
PDZ域	0.0006707	直接
酰基辅酶A氧化酶C末端结构域	0.0006822	直接
酰基辅酶A氧化酶N-末端结构域	0.0006822	直接
管蛋白，GTPase结构域	0.0009715	直接
突触结合蛋白样（S变异体）	0.0009715	直接
烟碱受体配体结合域样	0.0009753	直接
II类氨酰-tRNA合成酶（aaRS）样催化结构域	0.001012	继承自:生物行为变异体||避免细菌草坪||喂食行为变异
四三肽重复序列（TPR）	0.001315	继承自:运动变量
II组伴侣蛋白（CCT，TRIC），顶端结构域	0.001354	继承自:避免细菌草坪
串联AAA-ATP酶域	0.001542	继承自:光响应变量||生物体紫外线反应变异体
原肌球蛋白	0.00184	继承自:行动迟缓的||运动变体||运动减少
标准RBD	0.001934	继承自:运动变体||未受精卵母细胞
PDEase（PDEase）	0.002063	继承自:热敏行为变量||趋热性变体
RecA蛋白样（ATP酶结构域）	0.002063	继承自:避免细菌草坪
生长因子受体域	0.002255	继承自:静止变种
Spectrin重复	0.004612	继承自:运动变量||运动变体
Hedgehog C端（Hog）自动处理域	0.004612	继承自:运动变量||运动变体
泛素激活酶（UBA）	0.006175	继承自:运动变量||运动变体
ARID域	0.006175	继承自:光响应变量||机体紫外线过敏||生物体紫外线反应变异体
Smc铰链域	0.006175	继承自:运动变量||运动变体
卷曲的富含半胱氨酸结构域	0.006175	继承自:生物区域行为变异||身体行为变量||体肌营养不良||有机体片段行为变异
F1F0 ATP合成酶亚基C	0.006175	继承自:避免细菌草坪
我设置域	0.008734	继承自:身体姿势变化||运动变量||向前运动减少||路径曲率增加||运动减少||暂停时间增加
氯菊酯涂层组装域	0.009703	继承自:运动变量||运动变体
醛酮还原酶（NADP）	0.01054	继承自:排便周期变量||排便变体
cAMP结合域	0.01124	继承自:热敏行为变量||气味化学感觉反应变异体||车身弯曲变化频率||产蛋缺陷||身体姿势波长变化||反向点速度变量||气味负趋化性缺陷||雄性交配变异体||化学感觉行为变异||头部弯曲角度变量||雄性交配缺陷||苯甲醛趋化性缺陷||气味阳性趋化性变体||卷取变体||趋化性阳性变异体||阳性趋化性缺陷||转向频率变量||丁酮趋化性变体||前向点速度变量||氯化钠趋化性缺陷||趋化性变体||趋热性变体||气味阳性趋化性缺陷||卷取频率变化||方向性变量||滚筒||机头运动变量||浮肿的||身体姿势振幅变化||路径曲率变量||氯化钠趋化性变体||转向变量||苯甲醛趋化性变体||头部移动变量||正弦运动变化幅度
蛋白激酶富含半胱氨酸结构域（cys2，佛波结合结构域）	0.0132	继承自:热敏行为变量||鼻子触摸变体||饮食变体||气味阳性趋化性变体||趋热性变体
H-NOX域	0.01835	继承自:饮食变体||咽泵速变异||喂食行为变异||诱导性咽泵变异
反密码子结合域	0.01835	继承自:避免细菌草坪||喂食行为变异
铜、锌超氧化物歧化酶样	0.01835	继承自:排便周期变量||排便周期可变长度||排便变体
泛素羧基末端水解酶UCH-L	0.01835	继承自:排便变体
细胞周期转录因子e2f-dp	0.01835	继承自:向后运动变体||运动协调变体||反转变量||方向性变量
LIM域	0.02588	继承自:饮食变体
组蛋白脱乙酰酶	0.02669	继承自:光响应变量||机体紫外线过敏||生物体紫外线反应变异体
扩展AAA-ATP酶域	0.02852	继承自:喂食行为变异
WD40-重复	0.03049	继承自:渗透回避变体
视紫红质样	0.03647	继承自:产卵期变异||车身弯曲变形||向后运动变体||产卵变异体||正弦运动变量||身体姿势变化||5-羟色胺诱导的抽吸变体||活动期间产卵事件较少||有源相位变量||头部弯曲角度变量||运动变量||饮食变体||局部运动变体||运动速度变量||觅食行为变体||饱足行为变异||正弦运动幅度减小||暂停变体||转向频率变量||向前运动变体||运动协调变体||产卵对药物变异的反应||卷取频率变化||尾部弯曲角度变量||方向性变量||机头运动变量||诱导性咽泵变异||头部移动变量||水适应缺陷
磷酸盐结合蛋白样	0.04342	继承自:热敏行为变量||水阳性趋化性缺陷||化学感觉行为变异||饮食变体||阳性趋化性缺陷||氯化钠趋化性缺陷||趋化性变体||趋热性变体||咽部抽吸减少||咽泵速变异||水阳性趋化性变体||氯化钠趋化性变体||化学感觉反应变异体
中间丝蛋白，卷曲螺旋区	0.04946	继承自:瘫痪的
I类氨酰-tRNA合成酶（RS），催化结构域	0.05138	继承自:避免细菌草坪||喂食行为变异
蛋白激酶，催化亚单位	0.05204	继承自:胚后行为变异||生物区域行为变异||dauer小生境行为变异体||化学感觉行为变异||产卵对食物变异的反应||移动速度增加||体肌营养不良||趋化性阳性变异体||碱性pH趋化性变体||机械化变体||达斡尔族行为变体||辛醇趋化性缺陷||有机体片段行为变异
吡哆醛依赖性脱羧酶	0.05552	继承自:漫游增加||身体姿势波长变化||反向点速度变量||车身弯曲变形||向后运动变体||产卵变异体||正弦运动变量||身体姿势变化||路径曲率减小||前方点速度增加||局部运动变体||觅食行为变体||转向频率变量||向前运动变体||向前移动增加||前向点速度变量||运动协调变体||反转变量||产卵对药物变异的反应||身体姿势振幅增加||尾部弯曲角度变量||方向性变量||身体姿势振幅变化||后向点速度增加||活动级别变量||头部移动变量||正弦运动变化幅度
层压板A/C球状尾区	0.05552	继承自:瘫痪的
转化生长因子（TGF）-β	0.06264	继承自:产蛋缺陷||产卵变异体
L30e/L7ae核糖体蛋白	0.06264	继承自:避免细菌草坪||喂食行为变异
DEP域	0.06264	继承自:生物区域行为变异||身体行为变量||体肌营养不良||有机体片段行为变异
纤维连接蛋白III型	0.09075	继承自:身体姿势变化||向前运动减少||路径曲率增加||运动减少
FKBP亲免疫蛋白/脯氨酸异构酶	0.0969	继承自:胚后行为变异||发育行为变异体||达斡尔族行为变体
电压门控钾通道	0.1258	继承自:产蛋缺陷||反向点速度变量||车身弯曲变形||身体姿势变化||头部弯曲角度变量||饮食变体||局部运动变体||平板丝锥习惯化变体||转向频率变量||向前运动变体||驱逐有缺陷||驱逐变体||习惯化变体||前向点速度变量||运动协调变体||卷取频率变化||滚筒||机头运动变量||松弛的||头部移动变量
脂蛋白球蛋白复合物，超螺旋结构域	0.1314	继承自:避免细菌草坪||喂食行为变异
脂蛋白球蛋白复合物；β-薄片壳区域	0.1314	继承自:避免细菌草坪||喂食行为变异
SH3-域	0.1601	继承自:排卵变异
运动蛋白质类	0.1713	继承自:性二形机制变异||雌雄同体后接触变异体||雄性对雌雄异体的反应||外阴位置变异
肌球蛋白棒碎片	0.1812	继承自:行动迟缓的
G蛋白信号调节器	0.2182	继承自:趋化性阴性变异体||趋化性变体||机械化变体
EGF型模块	0.2392	继承自:活动级别变量
色域	0.2858	继承自:光响应变量||机体紫外线过敏||生物体紫外线反应变异体
LDL受体样模块	0.6258	继承自:瘫痪的
Ankyrin重复	0.8522	继承自:车身弯曲变形||气味负趋化性缺陷||身体姿势波长降低||向后运动变体||正弦运动变量||头部弯曲角度变量||局部运动变体||转向频率变量||向前运动变体||反转变量||尾部弯曲角度变量||辛醇趋化性变体||机头运动变量||辛醇趋化性缺陷||转向变量||尾部运动变量||头部移动变量
整合素A（或I）域	0.8929	继承自:瘫痪的
核受体	1	继承自:单独喂养增加
乙酰胆碱酯酶类	1	继承自:游泳变体
核受体配体结合域	1	继承自:单独喂养增加
C型凝集素结构域	1	继承自:雄性交配变异体||性二形性行为变异||雄性交配缺陷||交配变异体

树木依据树向量

使用蛋白质域生成存在/缺失矩阵超级家族中所有基因组的结构数据。这个PAUP公司软件用于使用启发式简约方法。基因组组合或特定分支可以显示为如果有单株树的话。然而，该数据是从单个大树。这会产生比生成树时更高质量的拓扑并允许树立即显示。

注释到此WP术语的超域(不在SPWP中)
以灰色突出显示的是FDR>0.001的那些

超域（单个）	FDR（全部）	注释（直接或继承）
线粒体F1F0-ATP合成酶ε亚基	0	直接
Clathrin接合器附件域	0	直接
HSP40/DnaJ肽结合域	0	直接
Sec23/24的C-末端，凝胶样结构域	0	直接
伴侣J域	0	直接
腺苷甲硫氨酸合成酶	0	直接
热休克蛋白70kD（HSP70），C末端亚结构域	0	直接
SMAD MH1域	0	直接
热休克蛋白70kD（HSP70），肽结合域	0	直接
HSP90 C-末端结构域	0	直接
肌钙蛋白卷曲亚单位	0	直接
F1 ATP合成酶α和β亚基的N末端结构域	0	直接
RNA聚合酶RBP11样亚单位	0	直接
细胞色素P450	0	直接
网格蛋白亚结构域和互变异构体附属物结构域	0	直接
Sec23/24的螺旋域	0	直接
DnaJ/Hsp40富含半胱氨酸结构域	0	直接
F1 ATP合成酶α和β亚基的C末端结构域	0	直接
转导蛋白（异源三聚体G蛋白），γ链	0	直接
细胞色素c	0	直接
Sec23/24的锌指结构域	0	直接
琥珀酸脱氢酶/富马酸还原酶黄素蛋白，催化结构域	0	直接
多药外排转运体AcrB跨膜结构域	零点零零零零零零零零零零零零零九四四二	直接
转导蛋白（α亚单位），插入域	0.0000000000005283	直接
HSP20-like伴侣	0.000000000009038	直接
含P-loop的三磷酸核苷水解酶	0.00000000003932	直接
组蛋白折叠	0.0000000001523	直接
细胞质结合蛋白样I	0.000000001472	直接
核苷酸环化酶	0.000000004288	直接
类似Homeodomain	0.000000006914	直接
类胰岛素	0.000000007745	直接
ARM重复	0.0000003217	直接
类似TPR	0.0000008391	直接
波段7/SPFH域	0.000002995	直接
神经递质门控离子通道跨膜孔	0.000004744	直接
溴代多巴胺	0.000004747	直接
“有翼螺旋”DNA结合域	0.000009399	直接
类肌动蛋白ATP酶结构域	0.00001298	直接
GroEL赤道域状	0.00001614	直接
类似GroEL的中间领域	0.00001614	直接
类Sm核糖核蛋白	0.00002001	直接
C2结构域（钙/脂质结合结构域，CaLB）	0.00002201	直接
HLH，螺旋-环-螺旋DNA结合结构域	0.0000243	直接
Tubulin C末端domain-like	0.00005802	直接
烟碱受体配体结合域样	0.0001062	直接
GroEL顶端结构域样	0.0001166	直接
类似SNF	0.0001647	直接
管蛋白核苷酸结合域样	0.0001647	直接
PH类域	0.0001653	直接
SMAD/FHA域	0.0002524	直接
N-末端亲核氨基水解酶（Ntn水解酶）	0.0003179	直接
RNA-结合域	0.0003401	直接
生长因子受体域	0.0003978	直接
原肌球蛋白	0.0004651	直接
免疫球蛋白	0.0006567	直接
Ⅱ类aaRS和生物素合成酶	0.0007507	直接
DNA依赖性RNA-聚合酶的β和β素亚基	0.0007838	直接
富含半胱氨酸结构域	0.001217	继承自:热敏行为变量||气味化学感觉反应变异体||饮食变体||趋化性阳性变异体||气味阳性趋化性变体||趋热性变体
前折叠素	0.001241	继承自:运动变体
Hedgehog/intein（提示）域	0.001392	继承自:运动变体||运动变量
蛋白激酶样（PK-like）	0.002577	继承自:移动速度增加||达斡尔族行为变体||水化学感觉反应变异体||dauer小生境行为变异体||碱性pH趋化性变体||化学感觉行为变异||体肌营养不良||趋化性阳性变异体||晚期产卵||发育行为变异体||有机体片段行为变异||产卵对食物变异的反应||辛醇趋化性缺陷||机械化变体||生物区域行为变异||胚后行为变异
NAD（P）连接氧化还原酶	0.00272	继承自:排便变体||排便周期变量
电压门控钾通道	0.002728	继承自:浮肿的||平板丝锥习惯化变体||转向频率变量||头部弯曲角度变量||松弛的||身体姿势变化||阳性趋化性缺陷||向前运动变体||驱逐变体||局部运动变体||反向点速度变量||骨针插入缺陷||驱逐有缺陷||运动协调变体||尾部弯曲角度变量||过度活跃产卵||活动级别变量||前向点速度变量||头部移动变量||向后运动变体||饮食变体||滚筒||卷取频率变化||虫子袋||机械化变体||产蛋缺陷||习惯化变体||车身弯曲变形
F1F0 ATP合成酶亚基C	0.002806	继承自:避免细菌草坪
类ARID	0.002806	继承自:机体紫外线过敏||生物体紫外线反应变异体||光响应变量
卷曲的富含半胱氨酸结构域	0.002806	继承自:体肌营养不良||有机体片段行为变异||身体行为变量||生物区域行为变异
S15/NS1 RNA-结合域	0.002806	继承自:喂食行为变异||避免细菌草坪
核酸结合蛋白	0.002984	继承自:避免细菌草坪
Spectrin重复	0.003723	继承自:运动变体||运动变量
锌结合核糖体蛋白	0.003912	继承自:喂食行为变异||避免细菌草坪
cAMP结合结构域样	0.006637	继承自:雄性交配变异体||苯甲醛趋化性缺陷||浮肿的||转向频率变量||头部弯曲角度变量||正弦运动变化幅度||方向性变量||阳性趋化性缺陷||热敏行为变量||卷取变体||雄性交配缺陷||车身弯曲变化频率||身体姿势波长变化||反向点速度变量||丁酮趋化性变体||气味化学感觉反应变异体||化学感觉行为变异||苯甲醛趋化性变体||氯化钠趋化性变体||前向点速度变量||头部移动变量||转向变量||趋化性阳性变异体||滚筒||气味阳性趋化性缺陷||卷取频率变化||气味阳性趋化性变体||氯化钠趋化性缺陷||机头运动变量||路径曲率变量||趋化性变体||气味负趋化性缺陷||产蛋缺陷||车身弯曲变形||正弦运动变量||身体姿势振幅变化||趋热性变体
翻译蛋白SH3-样结构域	0.008179	继承自:喂食行为变异||避免细菌草坪
EGF/层粘连蛋白	0.008633	继承自:运动变体||辛醇趋化性变体||运动变量||辛醇趋化性缺陷||气味负趋化性缺陷
整合素域	0.009843	继承自:产卵变异体
E2F-DP异二聚区	0.009843	继承自:方向性变量||运动协调变体||向后运动变体||反转变量
铜、锌超氧化物歧化酶样	0.009843	继承自:排便变体||排便周期变量||排便周期可变长度
类PYP传感器域（PAS域）	0.01133	继承自:产卵变异体||产蛋缺陷
WD40重复	0.01532	继承自:渗透回避变体
PLC样磷酸二酯酶	0.01558	继承自:雄性交配变异体||排便变体||雄性交配缺陷||交配变异体||排便收缩变异体||骨针插入缺陷||后壁收缩排便周期变异||性二形性行为变异||排卵变异
纤维连接蛋白III型	0.01658	继承自:运动减少||身体姿势变化||反转变量||向前运动减少||路径曲率增加
层压板A/C球状尾区	0.01984	继承自:瘫痪的
中间丝蛋白，卷曲螺旋区	0.01984	继承自:瘫痪的
精氨酸酶/脱乙酰酶	0.0249	继承自:机体紫外线过敏||生物体紫外线反应变异体||光响应变量
SH3-域	0.02691	继承自:排卵变异
FYVE/PHD锌指	0.02759	继承自:机体紫外线过敏||生物体紫外线反应变异体||光响应变量
周质结合蛋白样II	0.04286	继承自:水阳性趋化性缺陷||阳性趋化性缺陷||热敏行为变量||咽泵速变异||化学感觉行为变异||氯化钠趋化性变体||饮食变体||氯化钠趋化性缺陷||咽部抽吸减少||水阳性趋化性变体||趋化性变体||化学感觉反应变异体||趋热性变体
β-β-α锌指	0.04291	继承自:抗产卵血清素||产卵抗丙咪嗪
NO信号转导和高尔基体转运中的配体结合域	0.04598	继承自:诱导性咽泵变异||咽泵速变异||饮食变体
类FKBP	0.04598	继承自:达斡尔族行为变体||发育行为变异体||胚后行为变异
HD-域/PD-Ease类	0.04598	继承自:热敏行为变量||趋热性变体
DNA/RNA聚合酶	0.05675	继承自:机体紫外线过敏||生物体紫外线反应变异体||光响应变量
II类aaRS ABD相关	0.06006	继承自:喂食行为变异||避免细菌草坪
I类氨酰-tRNA合成酶亚类的反密码子结合域	0.0754	继承自:避免细菌草坪
脂蛋白球蛋白复合物；β-薄片壳区域	0.0777	继承自:喂食行为变异||避免细菌草坪
脂蛋白球蛋白复合物，超螺旋结构域	0.0777	继承自:喂食行为变异||避免细菌草坪
PDZ域类	0.08224	继承自:体肌营养不良||排卵变异||有机体片段行为变异||身体行为变量||生物区域行为变异
类似NTF2	0.09325	继承自:雄性交配变异体||雄性交配缺陷||交配变异体||性二形性行为变异
核苷酸酰转移酶	0.09475	继承自:喂食行为变异||避免细菌草坪
二磷酸硫胺素结合褶皱（THDP-结合）	0.1007	继承自:避免细菌草坪
L30e类	0.1007	继承自:避免细菌草坪
肌球蛋白棒碎片	0.1007	继承自:行动迟缓的
G蛋白信号调节器	0.1227	继承自:趋化性变体||机械化变体||趋化性阴性变异体
谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样	0.1561	继承自:雄性交配变异体||交配变异体||化学感觉行为变异||性二形性行为变异||渗透回避变体||雄性交配效率降低||趋化性变体||趋化性阴性变异体
结构域	0.1861	继承自:排便收缩变异体||排卵变异
酰基辅酶A脱氢酶C末端结构域样	0.1937	继承自:排便变体||排便周期变量
酰基辅酶A脱氢酶NM结构域样	0.1937	继承自:排便变体||排便周期变量
类色度域	0.1999	继承自:机体紫外线过敏||生物体紫外线反应变异体||光响应变量
PLP依赖性转移酶	0.2837	继承自:前方点速度增加||后向点速度增加||排便收缩变异体||驱逐变体||向前移动增加||路径曲率减小||身体姿势振幅增加
NAD激酶/二酰甘油激酶样	0.3624	继承自:热敏行为变量||趋热性变体
类泛素	0.3691	继承自:体肌营养不良||有机体片段行为变异||身体行为变量||生物区域行为变异
LDL受体样模块	0.393	继承自:瘫痪的
Ankyrin重复	0.4765	继承自:转向频率变量||头部弯曲角度变量||身体姿势变化||向前运动变体||局部运动变体||尾部弯曲角度变量||头部移动变量||向后运动变体||转向变量||尾部运动变量||辛醇趋化性变体||机头运动变量||辛醇趋化性缺陷||反转变量||身体姿势波长降低||趋化性变体||气味负趋化性缺陷||化学感觉反应变异体||车身弯曲变形||正弦运动变量
FAD/NAD（P）-结合域	0.6633	继承自:产卵量减少
类似BPTI	0.7247	继承自:雄性交配缺陷
皂苷	0.8023	继承自:产卵量减少
核受体配体结合域	1	继承自:单独喂养增加
糖皮质激素受体样（DNA-结合域）	1	继承自:单独喂养增加
C型凝集素样	1	继承自:雄性交配变异体||雄性交配缺陷||交配变异体||性二形性行为变异
家族A G蛋白偶联受体样	1	继承自:诱导性咽泵变异||5-羟色胺诱导的抽吸变体