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表型本体
与基因本体论（GO）一样，表型本体论通过将单个术语视为节点及其与父项（允许多个父项）的关系视为有向边，将基因突变/空表型信息从顶部非常一般的术语分类并组织到有向无环图（DAG）中更具体的术语。要导航此层次结构，我们显示所有亲本表型项按与当前项的最短距离排序的当前感兴趣的表型项。也，仅直接儿童表型术语列出了当前表型术语的。我们纳入的表型本体如下：

• 疾病本体论
  DO通过DO术语到MeSH、ICD、NCI同义词库、SNOMED和OMIM的广泛交叉映射，在语义上整合了疾病和医学词汇。
  
• 人类表型（HP）本体（HP）
  HP捕获OMIM中描述的表型异常以及相应的致病基因。它包括三个互补的生物学概念：遗传模式（MI）、ONset_and_clinical_course（ON）和表型异常（PA）。
  
• 小鼠表型（MP）本体（MP）
  MP描述了特定基因被基因破坏后小鼠的表型。利用它，小鼠基因组信息学（MGI）为小鼠提供了高覆盖率的基因水平表型。
  
• 蠕虫表型本体
  WP对秀丽线虫和其他线虫的表型描述进行分类和组织。使用它，WormBase为秀丽线虫的表型注释提供了主要资源。
  
• 酵母表型本体
  酵母基因组数据库（SGD）基于YP，YP是子囊菌表型本体的主要贡献者，为酵母基因组中的每个基因提供单一突变表型。
  
• 苍蝇表型本体
  FP指FlyBase控制的词汇表。具体来说，FlyBase中的等位基因注释（针对其诱变剂等）使用结构化受控词汇。
  
• 蝇类解剖本体
  FA是黑腹果蝇解剖结构的结构化受控词汇，用于描述表型和基因表达的位置。
  
• 斑马鱼解剖学本体
  ZA使用标准解剖学术语和受影响的基因显示斑马鱼的解剖学术语。
  
• 爪蟾解剖学本体
  XA代表青蛙（非洲爪蟾和热带爪蟾）的组织谱系和发育时间。它用于注释非洲爪蟾的基因表达模式以及突变体和变形表型。
  
• 拟南芥植物本体（AP）
  作为描述植物解剖和形态结构（AN）以及生长发育阶段（DE）的植物本体的主要贡献者，拟南芥信息资源（TAIR）为模式高等植物拟南芥（Arabidopsis thaliana）提供了拟南芥子植物本体注释。
  
• 酶委员会本体论
  每个酶都有一个四位数的EC编号，前三位数定义了催化的反应，第四位数是唯一的标识符（序列号）。每种酶都有一个系统名称，唯一地定义了所催化的反应。
  
• DrugBank ATC（DB）本体（DB）
  在解剖治疗化学（ATC）分类系统中，药物根据作用的器官或系统（第一级，解剖主要组）及其治疗（第二级，治疗亚组）、药理（第三级，药理亚组）分为五个不同级别的组和化学性质（第4级，化学亚组；第5级，化学物质）。只考虑DrugBank中的药物。
  
• UniProtKB关键字（KW）本体
  UniProtKB中的关键字是受控词汇表，提供条目内容的摘要，并用于基于10个类别（此处不包括“技术术语”类别）索引UniProtKB/Swiss-Prot条目。每个关键字都手动归属于UniProtKB/Swiss-Prot条目，并自动归属于UniProtKB/TrEMBL条目（根据特定的注释规则）。
  
• UniProtKB UniPathway（UP）本体
  UP是一个完全手动管理的资源，用于表示和注释代谢途径，在UniProtKB中用作路径注释的受控词汇。
  

结构域表型本体及其注释
蛋白质结构分类（SCOP）将进化相关结构域分为超级家族水平和家庭级别。利用上述表型本体，我们生成了以域为中心的表型注释，并进一步确定了注释SCOP域信息最丰富的表型术语。令人欣慰的是，以域为中心的表型注释可以作为探索基因型-表型关系的另一个起点。我们为下载提供了几个相关文件，包括每个表型本体的注释和相应的本体。

• 结构域疾病本体（DO）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2DO.txt，以及相应的本体：SDDO.txt文件)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域人类表型（HP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2HP.txt，以及相应的本体：SDHP.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域小鼠表型（MP）本体（SDMP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2MP.txt，以及相应的本体：SDMP.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域蠕虫表型（WP）本体（SDWP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2WP.txt，以及相应的本体：SDWP.txt（软件开发包.txt）)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域酵母表型（YP）本体（SDYP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2YP.txt，以及相应的本体：SDYP.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域蝇表型（FP）本体（SDFP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2FP.txt，以及相应的本体：SDFP.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域苍蝇解剖学（FA）本体（SDFA）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域名2FA.txt，以及相应的本体：SDFA.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 斑马鱼结构域解剖学（ZA）本体（SDZA）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2ZA.txt，以及相应的本体：SDZA.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域爪蟾解剖学（XA）本体（SDXA）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域名2XA.txt，以及相应的本体：SDXA.txt（SDXA.text）)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域拟南芥植物本体（AP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2AP.txt，以及相应的本体：SDAP文本)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域酶委员会（EC）本体论（SDEC）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2EC.txt，以及相应的本体：SDEC文本)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域DrugBank ATC（DB）本体（SDDB）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2DB.txt，以及相应的本体：SDDB文本)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域UniProtKB关键字（KW）本体论（SDKW）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2KW.txt，以及相应的本体：SDKW.txt软件)和mysql表(域PO.sql.gz).
  
• 结构域UniProtKB UniPathway（UP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：SCOP域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：域2UP.txt，以及相应的本体：SDUP.txt格式)和mysql表(域PO.sql.gz).
  

超域表型本体及其注释
虽然以域为中心的注释在描述独立域的表型性质方面有很大的希望，但大多数域本身可能不只是单独工作。在多域蛋白质中，它们可以结合在一起形成不同的域结构。现有结构域的重组被认为是表型多样性的主要驱动力之一。作为扩展，我们还生成了超域表型本体及其注释。与以域为中心的表型本体论和注释（SCOP域超级家族水平和家庭级别），此版本仅关注超域和单个SCOP域超级家族级别。此外，就单个超家族而言，以域为中心版本的注释可能与超域版本的注释不同。根据您的关注点，前者应用于考虑超级家族水平和家庭级别，否则，如果您对域组合感兴趣，应使用后者。此外，我们还为下载提供了几个相关文件，包括每个表型本体的注释和相应的本体。

• 超域疾病本体（DO）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2DO.txt文件，以及相应的本体：SPDO.txt文件)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域人类表型（HP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2HP.txt格式，以及相应的本体：SPHO.txt文件)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域小鼠表型（MP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2MP.txt格式，以及相应的本体：SPMP.txt（SPMP文本）)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域域蠕虫表型（WP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2WP.txt格式，以及相应的本体：SPWP.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超结构域酵母表型（YP）本体（SPYP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2YP.txt格式，以及相应的本体：SPYP.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域蝇表型（FP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2FP.txt格式，以及相应的本体：SPFP.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域蝇类解剖本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2FA.txt文件，以及相应的本体：SPFA.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 斑马鱼超域解剖学（ZA）本体（SPZA）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2ZA.txt（SP2ZA.文本），以及相应的本体：SPZA.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域爪蟾解剖学（XA）本体（SPXA）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2XA.txt格式，以及相应的本体：SPXA.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域域拟南芥植物本体（AP）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2AP.txt格式，以及相应的本体：SPAP.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域酶委员会（EC）本体论（SPEC）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2EC文本，以及相应的本体：规格.txt)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域DrugBank ATC（DB）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2DB.txt文件，以及相应的本体：SPDB.txt文件)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域域UniProtKB关键字（KW）本体（SPKW）及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2KW.txt（SP2KW），以及相应的本体：SPKW.txt软件)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  
• 超域域UniProtKB UniPathway（UP）本体及其注释：
  有关详细信息，请访问文档：超级域的PO注释，其中数据可用性包含可解析的平面文件（注释：SP2UP.txt格式，以及相应的本体：SPUP.txt格式)和mysql表(SP2PO.sql.gz公司).
  

本AP术语注释的超级家族域(不在SDAP中)
以灰色突出显示的是FDR_all>0.001的那些

SCOP术语	FDR（全部）	注释（直接或继承）
信号肽结合域	0	直接
蛋白酶前肽/抑制剂	0	直接
E2F-DP异二聚区	0	直接
半胱氨酸α-鸟苷基序	0	直接
SH3-域	0	直接
类半胱氨酸蛋白酶	0	直接
精氨酸酶/脱乙酰酶	0	直接
类似RraA	0	直接
L-天冬氨酸酶样	0	直接
FYVE/PHD锌指	0	直接
NAD激酶/二酰甘油激酶样	0	直接
DNA修复蛋白MutS，结构域I	0	直接
HSP20-like伴侣	0	直接
糖苷水解酶/脱乙酰酶	0	直接
VHP，Villin耳机领域	0	直接
SUPERFAMILY中的SCOP层次结构	0	直接
翻译起始因子2β，aIF2β，N-末端结构域	0	直接
ThrRS/AlaRS公共域	0	直接
脂蛋白	0	直接
碳酸酐酶	0	直接
LysM域	0	直接
颗粒蛋白重复	0	直接
At5g01610-类似	0	直接
RNA聚合酶RBP11样亚单位	0	直接
细胞色素b5样血红素/类固醇结合域	0	直接
核苷酸交换因子GrpE的头部结构域	0	直接
TATA-box结合蛋白样	0	直接
金属依赖水解酶的复合结构域	0	直接
RuBisCO，小亚单位	0	直接
磷酸果糖激酶	0	直接
S-腺苷蛋氨酸脱羧酶	0	直接
DNA修复蛋白MutS，结构域III	0	直接
BSD域类	0	直接
初级单杂交母题	0	直接
F1 ATP合成酶α和β亚基的C末端结构域	0	直接
细胞色素c氧化酶亚基h	0	直接
PAP/OAS1底物结合结构域	0	直接
HMG箱	0	直接
核糖体L11/L12e N端结构域	0	直接
Sec23/24的C-末端，凝胶样结构域	0	直接
PUG域类	0	直接
ADP核糖基化	0	直接
I类谷氨酰胺氨基转移酶样	0	直接
DNA依赖性RNA-聚合酶的β和β素亚基	0	直接
奎诺蛋白醇脱氢酶类	0	直接
Cdc48域2-类	0	直接
类PRT	0	直接
LexA/信号肽酶	0	直接
转录因子IIA（TFIIA），α-螺旋结构域	0	直接
类PapD	0	直接
翻译蛋白	0	直接
核糖体蛋白L30p/L7e	0	直接
类TGS	0	直接
PLC样磷酸二酯酶	0	直接
tRNA-绑定臂	0	直接
隐色素/光解酶，N末端结构域	0	直接
类LeuD/IlvD	0	直接
核糖体蛋白L31e	0	直接
磷酸甘油激酶	0	直接
含氧增强蛋白3，	0	直接
类似NTF2	0	直接
GHMP激酶，C末端结构域	0	直接
Tubulin C末端domain-like	0	直接
甘油醛-3-磷酸脱氢酶样，C-末端结构域	0	直接
lambda阻遏物样DNA结合域	0	直接
DNA断裂再结合酶	0	直接
STI样	0	直接
插入RNA聚合酶α亚单位的亚结构域	0	直接
摩押/提斯	0	直接
UROD/MetE-like酒店	0	直接
Sec7域	0	直接
肌酸酐酶/氨肽酶	0	直接
胸苷酸合成酶/dCMP羟甲基化酶	0	直接
核苷酸酰转移酶	0	直接
像螃蟹一样	0	直接
病变旁路DNA聚合酶（Y家族），小指域	0	直接
同型半胱氨酸S-甲基转移酶	0	直接
RBP7（RpoE）的N末端异二聚结构域	0	直接
氨基甲酸激酶样	0	直接
VC0467类	0	直接
葡萄球菌核酸酶	0	直接
二磷酸硫胺素结合褶皱（THDP-结合）	0	直接
酸性磷酸酶/钒依赖性盐过氧化物酶	0	直接
假定异构酶YbhE	0	直接
组氨酸磷酸转移结构域，HPT结构域	0	直接
YrdC/肋骨B	0	直接
类ACT	0	直接
II类aaRS ABD相关	0	直接
释放系数	0	直接
F1 ATP合成酶α和β亚基的N末端结构域	0	直接
互变异构酶/MIF	0	直接
PreATP-抓取域	0	直接
肌动蛋白解聚蛋白	0	直接
L9 N-域状	0	直接
类PEBP	0	直接
V型ATP酶亚基E样	0	直接
核糖体蛋白L1	0	直接
谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样	0	直接
核糖体蛋白S3 C末端结构域	0	直接
氨基酸脱氢酶样，N-末端结构域	0	直接
RecA蛋白，C末端结构域	0	直接
CHY锌指状	0	直接
转导蛋白（α亚单位），插入域	0	直接
类似eIF4e	0	直接
核糖体蛋白L6	0	直接
四吡咯甲基化酶	0	直接
核糖体蛋白L4	0	直接
电子传递辅助蛋白	0	直接
内体分选复合物组装域	0	直接
氧化甾醇结合蛋白样	0	直接
钙联蛋白/钙网蛋白的P-结构域	0	直接
单杂交图案	0	直接
核糖体蛋白L22	0	直接
螯合酶	0	直接
类FKBP	0	直接
金属水解酶/氧化还原酶	0	直接
类EIN3的DNA结合域	0	直接
SET域	0	直接
Sec1/munc18样（SM）蛋白	0	直接
PABC（PABP）域	0	直接
PLP装订桶	0	直接
YVTN重复样/奎诺蛋白胺脱氢酶	0	直接
cAMP结合结构域样	0	直接
翻译起始因子IF3，C末端结构域	0	直接
线粒体糖蛋白MAM33样	0	直接
原肌球蛋白	0	直接
氯离子通道	0	直接
前蛋白转定位酶SecE亚单位	0	直接
蛋白丙酰转移酶	0	直接
糖基水解酶结构域	0	直接
GYF域	0	直接
数据链路连接器	0	直接
RNA聚合酶sigma因子的Sigma3和sigma4结构域	0	直接
亲环素样	0	直接
网格蛋白亚结构域和互变异构体附属物结构域	0	直接
类溶菌酶	0	直接
管蛋白核苷酸结合域样	0	直接
γ-谷氨酸环转移酶样	0	直接
类NAP	0	直接
原核I型DNA拓扑异构酶	0	直接
Profilin（肌动蛋白结合蛋白）	0	直接
ENTH/VHS域	0	直接
Sec23/24的锌指结构域	0	直接
叶绿素a-b结合蛋白	0	直接
转录因子IIA（TFIIA），β-桶结构域	0	直接
5'至3'核酸外切酶，C末端亚结构域	0	直接
FMN-连接氧化还原酶	0	直接
重复五肽	0	直接
逆转录病毒锌指状结构域	0	直接
类水通道蛋白	0	直接
查尔酮异构酶	0	直接
SMAD/FHA域	0	直接
类似BolA	0	直接
琥珀酸脱氢酶/富马酸还原酶黄素蛋白C末端结构域	0	直接
转录因子TFIIS、elongin A、CRSP70共有的保守域	0	直接
电压门控钾通道	0	直接
类DUSP	0	直接
RuBisCo LSMT C终端，子带绑定域	0	直接
ADC合成酶	0	直接
DNA拓扑异构酶IV，α亚单位	0	直接
核苷二磷酸激酶	0	直接
阿拉伯糖苷酶/左旋蔗糖酶/转化酶	0	直接
核糖体蛋白L19（L19e）	0	直接
干扰素诱导的鸟苷酸结合蛋白1（GBP1），C末端结构域	0	直接
EF-G C端子域样	0	直接
RL5类	0	直接
皂苷	0	直接
叶绑定域	0	直接
ALDH样	0	直接
肽基-tRNA水解酶样	0	直接
F1F0 ATP合成酶亚基C	0	直接
核糖核酸酶样	0	直接
表达蛋白At2g23090/F21P24.15	0	直接
FMN-binding分体式枪管	0	直接
ABC转运蛋白跨膜区	0	直接
Fe，Mn超氧化物歧化酶（SOD），N-末端结构域	0	直接
糖脂转移蛋白	0	直接
金属阳离子转运ATP酶，ATP结合域N	0	直接
核糖体蛋白L39e	0	直接
核孔蛋白nup98的C末端自蛋白水解结构域	0	直接
核糖核酸酶PH域2-样	0	直接
烯醇化酶C末端结构域样	0	直接
努迪克斯	0	直接
热休克蛋白70kD（HSP70），肽结合域	0	直接
假设蛋白质TM0160	0	直接
假想蛋白YjiA，C末端结构域	0	直接
TK C端子域状	0	直接
类似Plus3	0	直接
金属依赖性水解酶	0	直接
色氨酸合成酶β亚单位样PLP依赖酶	0	直接
HSP90 C-末端结构域	0	直接
LuxS/MPP样金属水解酶	0	直接
脂肪酶/脂氧合酶结构域（PLAT/LH2结构域）	0	直接
BAG域	0	直接
细菌外肽酶二聚结构域	0	直接
类肌动蛋白ATP酶结构域	0	直接
铜、锌超氧化物歧化酶样	0	直接
LEA14-类	0	直接
白三烯A4水解酶N末端结构域	0	直接
AMPKBI-类	0	直接
肌苷一磷酸脱氢酶（IMPDH）	0	直接
核糖体蛋白L13	0	直接
β-N-乙酰己糖胺酶样结构域	0	直接
EB1二聚化域样	0	直接
类宏域	0	直接
磷酸葡萄糖变位酶，C末端结构域	0	直接
核糖体蛋白S19	0	直接
AN1型锌指	0	直接
LDH C末端域样	0	直接
自由基SAM酶	0	直接
钙粘蛋白同源结构域	0	直接
真核肽链释放因子亚单位1 ERF1的N末端结构域	0	直接
Trimeric LpxA-like酶	0	直接
Chorismate变位酶II	0	直接
泛素样蛋白的激活酶	0	直接
F1F0-ATP合成酶δ亚基的N末端结构域	0	直接
PAP/考古CCA-添加酶，C末端结构域	0	直接
NO信号转导和高尔基体转运中的配体结合域	0	直接
核糖体蛋白L25-like	0	直接
FF域	0	直接
磷酸葡萄糖变位酶，前3个结构域	0	直接
Formin同源2结构域（FH2结构域）	0	直接
嘌呤和尿苷磷酸化酶	0	直接
翻译起始因子2β的锌结合域	0	直接
核糖核酸酶III域样	0	直接
ISP域	0	直接
类GlnB	0	直接
PK C-末端结构域样	0	直接
肽基-tRNA水解酶II	0	直接
LightT型	0	直接
核糖体蛋白L7/12，低聚（N-末端）结构域	0	直接
Arp2/3复合亚基	0	直接
纤维连接蛋白III型	0	直接
α/β结	0	直接
CRAL/TRIO域	0	直接
类色度域	0	直接
丝氨酸代谢酶域	0	直接
类L28p	0	直接
Mss4类	0	直接
FAH公司	0	直接
波段7/SPFH域	0	直接
锌依赖性外肽酶	0	直接
SH2结构域	0	直接
RNA聚合酶sigma因子的Sigma2结构域	0	直接
类铁蛋白	0	直接
锌发夹烟囱	0	直接
原核型KH结构域（KH-结构域II型）	0	直接
血红素加氧酶样	0	直接
RCC1/BLIP-II	0	直接
核糖体蛋白L10-like	0	直接
阳离子流出蛋白胞质域样	0	直接
二氨基戊二酸差异构酶样	0	直接
WW域	0	直接
DNA/RNA聚合酶	0	直接
SWIB/MDM2域	0	直接
延伸系数TFIIS域2	0	直接
类S13-H2TH结构域	0	直接
核糖体蛋白S2	0	直接
类ITPase	0	直接
前蛋白转定位酶SecY亚基	0	直接
β-碳酸酐酶	0	直接
类Rubredoxin	0	直接
DNA修复蛋白MutS，结构域II	0	直接
阳离子流出蛋白跨膜结构域样	0	直接
四氢生物蝶呤生物合成酶	0	直接
PA域	0	直接
类ARID	0	直接
核糖体蛋白L16p/L10e	0	直接
AF0104/ALDC/Ptd012类似	0	直接
ssDNA-结合转录调控域	0	直接
碳氮水解酶	0	直接
磷脂酶A2，PLA2	0	直接
类似GroEL的中间领域	0	直接
类LanC	0	直接
类AlbA	0	直接
α-L RNA结合基序	0	直接
Clathrin接合器附件域	0	直接
肌动蛋白交联蛋白	0	直接
热休克蛋白70kD（HSP70），C末端亚结构域	0	直接
类Fe-S簇组件（FSCA）域	0	直接
类似UBA	0	直接
GroEL赤道域状	0	直接
CRAL/TRIO N端域	0	直接
GroEL顶端结构域样	0	直接
PIN域类	0	直接
2-氧代酸脱氢酶复合物的外周亚单位结合域	0	直接
类Trm112p	0	直接
HIT/MYND锌指状	0	直接
S15/NS1 RNA-结合域	0	直接
铁、锰超氧化物歧化酶（SOD），C末端结构域	0	直接
胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶	0	直接
FAD-连接氧化还原酶	0	直接
黄素蛋白	0	直接
假尿苷合酶	0	直接
MOSC N端类畴	0	直接
PriA/YqbF域	0	直接
RuvA域2类	0	直接
琥珀酸脱氢酶/富马酸还原酶黄素蛋白，催化结构域	0	直接
上清液蛋白因子（SPF），C末端结构域	0	直接
类似OMPA	0	直接
类烯氧环化酶	0	直接
细胞色素c	0	直接
依赖FAD的硫醇氧化酶	0	直接
烟酸/喹啉酸PRTase C末端结构域样	0	直接
可能的细菌效应器结合域	0	直接
酪蛋白激酶IIβ亚单位	0	直接
DNA-糖苷酶	0	直接
类dsRNA-绑定域	0	直接
GINS螺旋束状	0	直接
Ⅱ类aaRS和生物素合成酶	0	直接
乌头糖铁硫结构域	0	直接
烯醇化酶N-末端结构域样	0	直接
线粒体载体	0	直接
eIF1类	0	直接
类中介铰链	0	直接
起始因子IF2/eIF5b，域3	0	直接
蓖麻毒素B样凝集素	0	直接
FtsH蛋白酶域样	0	直接
七肽糖苷酶	0	直接
琥珀酰辅酶A合成酶结构域	0	直接
类RplX	0	直接
真核型KH结构域（KH结构域I型）	0	直接
硫酯酶/硫醇酯脱氢酶-异构酶	0	直接
SBT域	0	直接
类CYTH磷酸酶类	0	直接
无机焦磷酸酶	0	直接
SAM/指向域	0	直接
I类氨酰-tRNA合成酶亚类的反密码子结合域	0	直接
14-3-3蛋白质	0	直接
核糖体蛋白L11，C末端结构域	0	直接
核糖体蛋白S10	0	直接
碳水化合物磷酸酶	0	直接
ArfGap/RecO-like锌指	0	直接
AF1104类	0	直接
CCCH锌指	0	直接
谷氨酰胺合成酶，N-末端结构域	0	直接
甲酰转移酶	0	直接
类硫醇	0	直接
α-螺旋铁氧还蛋白	0	直接
AAA+后齐聚域样	0	直接
JAB1/MPN域	0	直接
SAP域	0	直接
R3H域	0	直接
Poly A聚合酶C末端区域样	0	直接
类PGBD	0	直接
谷氨酰tRNA还原酶二聚结构域	0	直接
家族57/38糖苷转移酶中间结构域	0	直接
肽蛋氨酸亚砜还原酶	0	直接
EPT/RTPC类	0	直接
谷氨酰tRNA还原酶催化，N末端结构域	0	直接
氧化还原酶钼蝶呤结合域	0	直接
SMR域类	0	直接
原核核糖体蛋白L17	0	直接
MurD-like肽连接酶，催化结构域	0	直接
肌酸酶/脯氨酸酶N端结构域	0	直接
4Fe-4S铁氧还蛋白	0	直接
DHS样NAD/FAD结合结构域	0	直接
类ACP	0	直接
类HRDC	0	直接
Cullin同源结构域	0	直接
YhbY类	0	直接
DNA钳	0	直接
核糖体蛋白S6	0	直接
ValRS/IleRS/LeuRS编辑域	0	直接
前折叠素	0	直接
gyp1p的Ypt/Rab-GAP结构域	0	直接
CBS域对	0	直接
6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶C末端结构域样	0	直接
D-核糖-5-磷酸异构酶（RpiA），lid结构域	0	直接
二氢叶酸还原酶样	0	直接
溴代多巴胺	0	直接
第63节N末端类域	0	直接
Tricorn蛋白酶域2	0	直接
PDZ域类	0	直接
钙ATP酶，转导域A	0	直接
镁转运蛋白CorA，跨膜区	0	直接
铑/细胞周期控制磷酸酶	0	直接
亚硝酸盐和亚硫酸盐还原酶4Fe-4S域样	0	直接
MurD样肽连接酶，肽结合域	0	直接
核苷酸转移酶	0	直接
BAR/IMD域类	0	直接
核糖磷酸装订桶	0	直接
肽酶/酯酶“gauge”域	0	直接
EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C末端结构域	0	直接
核糖体蛋白S24e、L23和L15e	0	直接
翻译起始因子IF3，N-末端结构域	0	直接
金属蛋白酶（“锌蛋白”），催化域	0	直接
紫色酸性磷酸酶，N-末端结构域	0	直接
核糖体蛋白S8	0	直接
Tubby C端domain-like	0	直接
GAF域类	0	直接
TAZ域	0	直接
核糖体蛋白L29（L29p）	0	直接
II型DNA拓扑异构酶	0	直接
ATP合成酶（F1-ATPase），γ亚基	0	直接
锌结合核糖体蛋白	0	直接
Rap30/74交互域	0	直接
类似HIT	0	直接
DnaJ/Hsp40富含半胱氨酸结构域	0	直接
类GAT域	0	直接
脂氧化酶	0	直接
eEF-1类	0	直接
都铎王朝/PWWP/MBT	0	直接
SIS域	0	直接
核糖体蛋白L14	0	直接
NSFL1（p97 ATP酶）辅因子p47，SEP结构域	0	直接
隐色素/光解酶FAD结合域	0	直接
异柠檬酸/苹果酸异丙酯脱氢酶类	0	直接
HD-域/PD-Ease类	0	直接
双Clp-N图案	0	直接
UDP-葡萄糖/GDP-甘露糖脱氢酶C末端结构域	0	直接
DEK C端域	0	直接
谷氨酸合成酶α亚基C末端结构域	0	直接
钙ATP酶，跨膜结构域M	0	直接
vWA类	0	直接
腺苷甲硫氨酸合成酶	0	直接
Smc铰链域	0	直接
FAD-连接氧化酶，C末端结构域	0	直接
乙酰-CoA合成酶样	0	直接
类ADC	0	直接
3-磷酸甘油（1）-酰基转移酶	0	直接
核糖体蛋白L15p和L18e	0	直接
FAD/NAD相关还原酶，二聚（C末端）结构域	0	直接
PKβ-桶状domain-like	0	直接
蝎子类毒素	0	直接
钙依赖性磷酸三酯酶	0	直接
植物凝集素/抗菌肽	0	直接
类似Tim10	0	直接
CAD和PB1域	0	直接
Rps17e类	0	直接
胺氧化酶N-末端区	0	直接
酰基辅酶A结合蛋白	0	直接
胺氧化酶催化域	0	直接
锌β色带	0	直接
Sec23/24的螺旋域	0	直接
谷氨酰胺合成酶/胍基激酶	0	直接
PX域	0	直接
烟酸/喹啉酸PRTase N末端结构域样	0	直接
磷脂酶C/P1核酸酶	0	直接
类似RibA	0	直接
戊聚糖	0	直接
Hect，E3连接酶催化结构域	0	直接
碱性磷酸酶样	0	直接
ap2适配器的Mu2适配蛋白亚基（ap50）的第二域	0	直接
NHL重复	0	直接
SufE/NifU公司	0	直接
金属依赖性磷酸酶	0	直接
HesB-like域	0	直接
Run结合蛋白锌指状	0	直接
ClpP/巴豆酶	0	直接
磷脂酶D/核酸酶	0	直接
血红素依赖性过氧化氢酶样	0	直接
核苷酸交换因子GrpE的螺旋结构域	0	直接
糖皮质激素受体样（DNA-结合域）	0	直接
GTPase激活域	0	直接
膜联蛋白	0	直接
Surp模块（SWAP域）	0	直接
纺锤组件检查点蛋白mad2	0	直接
MCP/YpsA类	0	直接
核苷水解酶	0	直接
二聚体α+β桶	0	直接
核糖体L27蛋白样	0	直接
外臂达因轻链1	0	直接
类UBC	0	直接
甲酸盐/甘油脱氢酶催化域样	0	直接
DPP6 N端类域	0	直接
XPC绑定域	0	直接
FAD-连接还原酶，C末端结构域	0	直接
类球蛋白	0	直接
类ClpS	0	直接
拖把1p/PsbP-like	0	直接
限制性内切酶样	0	直接
RNA-结合域	0.01438	继承自:雌蕊||叶柄||腋芽||腋生营养芽||营养芽||花序轴||芽表皮||分支||叶片基部||花序枝||叶顶||气孔复合体||花梗||雄蕊群||芽表皮细胞||花冠||叶片||保护电池||大孢子叶||芽尖||心皮||花瓣
类似HAD	0.01554	继承自:营养枝顶端||叶状原基||花粉囊||维管叶原基||花粉
WD40重复	0.02272	继承自:芽表皮||气孔复合体||保护电池
类硫氧还蛋白	0.02374	继承自:维管叶||茎节间||茎||孢子叶||芽表皮||气孔复合体||雄蕊群||花粉||保护电池||心皮
环/U形盒	0.02999	继承自:叶表皮||叶毛||叶状表皮
NAD（P）-结合Rossmann-fold域	0.09263	继承自:雄蕊群||花粉||心皮
ARM重复	0.09284	继承自:芽||花蕾||芽表皮||气孔复合体||花粉||保护电池||生殖芽
含P-loop的三磷酸核苷水解酶	0.1292	继承自:保护电池
类似TPR	0.1553	继承自:芽尖
PP2C类	0.1785	继承自:花粉囊||花粉
核酸结合蛋白	0.1842	继承自:芽表皮||气孔复合体||芽表皮细胞||保护电池
核糖体蛋白S5结构域2样	0.1944	继承自:芽表皮||气孔复合体||芽表皮细胞||保护电池
PH类域	0.2331	继承自:花粉囊||花粉
伴侣J域	0.2372	继承自:花序轴||芽表皮||分支||花序枝||气孔复合体||花梗||芽表皮细胞||保护电池
NAC域	0.3386	继承自:芽轴石碑||芽系统血管系统
核苷酸二磷酸糖转移酶	0.4366	继承自:束间区||叶肉||叶表皮||叶毛||叶状表皮
（磷酸酪氨酸蛋白）磷酸酶Ⅱ	0.5386	继承自:花粉囊||花粉
组蛋白折叠	0.6898	继承自:茎顶端分生组织||花分生组织||生殖枝顶端分生组织||生殖枝顶端
类似RNI	0.7184	继承自:花药
铜氧还蛋白类	0.7405	继承自:萼片血管系统||乳头细胞||叶片维管系统||长丝||叶状维管系统||莲座叶||表皮铺装细胞||芽系统血管系统||叶表皮||叶毛||叶状表皮||花瓣血管系统||子叶维管系统||花维管束系统
MFS通用底物运输器	0.7999	继承自:叶状维管系统
醛缩酶	0.7999	继承自:维管叶||叶||茎||花序分生组织||叶顶||子叶||雄蕊||花冠||茎叶||芽尖||叶尖||花瓣
象棋般的	0.8272	继承自:叶片维管系统||叶状维管系统||茎顶端分生组织||芽分生组织||芽系统血管系统||幼年维管叶
β-β-α锌指	0.8861	继承自:生殖枝顶端
半乳糖结合域样	0.9097	继承自:莲座叶||幼年维管叶||成体维管束叶
TRAF域类	0.9195	继承自:莲座叶
E集合域	0.9507	继承自:花粉囊||花粉
POZ域	0.9548	继承自:莲座叶||茎轴皮层
Skp1二聚化域样	1	继承自:茎顶端分生组织||芽分生组织||茎轴皮层
伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶	1	继承自:成体维管束叶
β-D-葡聚糖外水解酶，C末端结构域	1	继承自:幼年维管叶||成体维管束叶
酰胺酶特征酶	1	继承自:芽||莲座叶||花蕾||生殖芽
HLH，螺旋-环-螺旋DNA结合结构域	1	继承自:传输组织的一部分
Clavaminate合酶样	1	继承自:花维管束系统
双功能抑制剂/脂质转运蛋白/种子贮藏2S白蛋白	1	继承自:长丝||子叶维管系统||风格
DNA-结合假桶结构域	1	继承自:植物子房||卵巢胎盘||生殖枝顶端||胚珠原基
类枯草杆菌	1	继承自:叶片维管系统||叶状维管系统||芽系统血管系统||风格
UDP糖基转移酶/糖原磷酸化酶	1	继承自:芽||营养枝顶端||花蕾||叶状原基||维管叶原基||生殖芽
类SRF	1	继承自:生殖枝顶端
萜类合酶	1	继承自:长丝||污名
萜类环化酶/蛋白质-戊基转移酶	1	继承自:长丝||污名
类似Homeodomain	1	继承自:叶片维管系统||营养枝顶端||托叶||叶状维管系统||茎顶端分生组织||芽分生组织||芽系统血管系统||叶状原基||幼年维管叶||花分生组织||花药||风格||卵巢复盖||生殖枝顶端
下注v1-like	1	继承自:营养枝顶端||托叶||茎顶端分生组织||芽分生组织||叶状原基||花分生组织||维管叶原基||生殖枝顶端
（反式）糖苷酶	1	继承自:幼年维管叶||成体维管束叶