SUPERFAMILY 1.75 HMM库和基因组分配服务器

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环-Ligas

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根:EC层次结构(来自IntEnz版本70)

距当前期限的最短距离(+对于父母,-适合儿童) EC术语[EC标识] <#儿童> (#平方英尺|#FA公司) #超域
(单|双|三)
+ + + 3:  [] <6>
+ + 2:  连接酶类[6] <6>(80|99) (88|104|66)
+ 1:  形成碳氮键[6.3] <5>(45|56) (51|54|37)
0:   环-Ligas[6.3.3] <4>(8|8) (8|5|4)
- 1:  (羧乙基)精氨酸β-内酰胺合成酶[6.3.3.4](0|0) (0|0|0)
- 1:  5-甲酰四氢叶酸环-ligase[6.3.3.2](1|1) (1|0|0)
- 1:  硫代生物素合酶[6.3.3.3](1|1) (1|0|0)
- 1:  磷酸核糖基甲酰甘氨酰环-ligase[6.3.3.1](6|6) (6|5|4)


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超级家族

(显示详细信息)
SCOP术语 FDR(全部) 注释(直接或继承)
PurM N末端类域0直接
PurM C端域样0直接
含P-loop的三磷酸核苷水解酶0.00000000004252直接
甲酰转移酶0.006156继承的
NagB/RpiA/CoA类转移酶0.01457继承的
初级单杂交母题0.7611继承的
谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样1继承的
PreATP-抓取域1继承的


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家庭

(显示详细信息)
SCOP术语 FDR(全部) 注释(直接或继承)
PurM C端域样0直接
PurM N末端类域0直接
甲基四氢叶酸合成酶0直接
固氮酶铁蛋白样0.00000000001337直接
甲酰转移酶0.00769继承的
BC C端子域状0.7171继承的
BC N末端域状1继承的
BC ATP绑定域类1继承的


在系统发育树上为超级家族和/或家庭本EC术语注释的域
将树绘制为:   下载Newick格式树:
(显示帮助)

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超域(包括单个超家族)

(显示详细信息)
超域(单个) FDR(全部) 注释(直接或继承)
PurM C-末端类结构域0直接
PurM N末端类域0直接
含P-loop的三磷酸核苷水解酶0.00000000001665直接
甲酰转移酶0.005348继承的
NagB/RpiA/CoA类转移酶0.01276继承的
初级单杂交母题0.7193继承的
谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样1继承的
PreATP-抓取域1继承的

(显示详细信息)
N到C端子顺序的超域(双工) FDR(全部) 注释(直接或继承)
51246,55326
  • 51246 -初级单杂交母题
  • 55326 -PurM N末端类域
  • 0直接
    55326,56042
  • 55326 -PurM N末端类域
  • 56042 -PurM C端域样
  • 0直接
    56042,53328
  • 第56042页-PurM C端域样
  • 53328 -甲酰转移酶
  • 0直接
    56059,51246
  • 56059 -谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样
  • 51246 -初级单杂交母题
  • 0.7193继承的
    52440,56059
  • 52440 -PreATP-抓取域
  • 56059 -谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样
  • 1继承的

    (显示详细信息)
    N到C端子顺序的超域(三重) FDR(全部) 注释(直接或继承)
    55326,56042,53328
  • 55326 -PurM N末端类域
  • 56042 -PurM C端域样
  • 53328 -甲酰转移酶
  • 0直接
    51246,55326,56042
  • 51246 -初级单杂交母题
  • 55326 -PurM N末端类域
  • 56042 -PurM C端域样
  • 0直接
    56059,51246,55326
  • 56059 -谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样
  • 51246 -初级单杂交母题
  • 55326 -PurM N末端类域
  • 0直接
    52440,56059,51246
  • 52440 -PreATP-抓取域
  • 56059 -谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样
  • 51246 -初级单杂交母题
  • 0.7108继承的


    在系统发育树上为单个超域由该EC术语注释
    将树绘制为:   下载Newick格式树:
    (显示帮助)