酶委员会(EC)每个酶都有一个四位数的EC编号,前三位数定义了催化的反应,第四位数是唯一的标识符(序列号)。每种酶也被赋予一个系统名称,该名称唯一地定义了催化的反应。为了导航EC的层次结构,我们显示所有母公司EC条款按照与当前期限的最短距离排序的当前EC利息期限。也,仅直接子EC术语列出了当前EC术语的。
蛋白质结构分类(SCOP)SCOP将进化相关领域划分为超级家族水平和家庭级别。因此,我们为这三个概念中的每一个在两个域级别上生成了以域为中心的EC注释。
结构域酶委员会本体(SDEO)作为以领域为中心的本体,SDEO仅指那些注释SCOP领域信息量最大的EC术语。
SCOP域的EC注释有关详细信息,请访问文档:SCOP域的EC注释其中,我们提供了几个相关文件(数据可用性)用于下载,包括注释文件(即。,域2EC.txt)和相应的本体(即。,SDEO.txt文件).
超域酶委员会本体(SPEO)作为扩展,SPEO包括那些EC术语,这些术语信息最丰富,可以在超级家族级别。
超域的EC注释有关详细信息,请访问文档:超域的EC注释其中,我们提供了几个相关文件(数据可用性)用于下载,包括注释文件(即。,SP2EC文本)和本体论(即。,SPEO.txt文件). 为了便于浏览,下面列出了那些超域(单域、双域、三域、四域)。
树木依据树向量
使用蛋白质结构域和超结构域生成存在/缺失矩阵超级家族中的所有基因组。这个RAxML公司软件用于使用启发式简约方法。基因组组合或特定分支可以显示为如果有单株树的话。然而,该数据是从单个大树。这会产生比生成树时更高质量的拓扑并允许树立即显示。
树木依据树向量
使用蛋白质结构域和超结构域生成存在/缺失矩阵超级家族中的所有基因组。这个RAxML公司软件用于使用启发式简约方法。基因组组合或特定分支可以显示为如果有单株树的话。然而,该数据是从单个大树。这会产生比生成树时更高质量的拓扑并允许树立即显示。